Compound Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_022151 | (TAAA)3aaacataaataatttt(AATAAA)12 | c | 8305 | 8404 | 100 | Design Primer |
| 2 | NC_022151 | (A)10tatatttaatttacttttaaaaaaggtaaaacttaattatcattattgataatattaacataataaatttatataaattattataattaaaaaaag(ATTA)6 | c | 14471 | 14600 | 130 | Design Primer |
| 3 | NC_022151 | (TAT)5aattat(TTATA)4attat(AATTA)4 | c | 18721 | 18786 | 66 | Design Primer |
| 4 | NC_022151 | (ATA)4ttttatttgctatattaattattattgttagttctatctcaatattatattatagtaatataattaaaactatttgatttaatattaatattaattt(AAATTC)3 | c | 20235 | 20361 | 127 | Design Primer |
| 5 | NC_022151 | (AATTTA)3catttacatttttaattaacatttatattaatattaagattaaaagattaaataaatcaa(ATT)4 | c | 23223 | 23312 | 90 | Design Primer |
| 6 | NC_022151 | (GTTATA)5(GTTATT)5 | c | 24111 | 24170 | 60 | Design Primer |
| 7 | NC_022151 | (TTAATG)4taataaattatattaataattgataaataaaattatttgaaaaaaaaatatg(AATAAA)3 | c | 24284 | 24377 | 94 | Design Primer |
| 8 | NC_022151 | (ATTTA)3tattaatatattataatttatattatttttatataaaggtaatataaggtgataattattaattattagattaatagataaaaaaaaga(TAAT)3 | c | 25561 | 25676 | 116 | Design Primer |
| 9 | NC_022151 | (ATAA)3atactctaaaaa(TAAGAG)3 | c | 28111 | 28152 | 42 | Design Primer |
| 10 | NC_022151 | (TAAT)3tagtaatataagttaaaaaagtataataataaatatttatcctttattatttatcctttattatttatgagtat(TAA)4 | c | 28403 | 28500 | 98 | Design Primer |
| 11 | NC_022151 | (TTA)5ttcttatattatagaattttagataaaattattttcttttatt(A)11 | c | 29900 | 29968 | 69 | Design Primer |
| 12 | NC_022151 | (A)10taata(TATAT)6 | c | 34362 | 34406 | 45 | Design Primer |
| 13 | NC_022151 | (T)11attataaattaaaacttacttttttttaatttatattgttctttttttattactttttttattattatatttttataaaatataattt(ATTA)3 | c | 35473 | 35583 | 111 | Design Primer |
| 14 | NC_022151 | (TTTAAA)3tttataatgagtttataattaaaattattaatataataattatattaaagtaattta(T)10 | c | 37786 | 37870 | 85 | Design Primer |
| 15 | NC_022151 | (ATT)4tatttttaaattatttaaatttccatttaaattaatattttttaat(TTA)4 | c | 40034 | 40103 | 70 | Design Primer |
| 16 | NC_022151 | (TTA)7tttaatgatttatttaatctaccaaatatacgatttattgaaaatacaattaattgtaaataatttggaa(TAT)6 | c | 40386 | 40494 | 109 | Design Primer |
| 17 | NC_022151 | (TATAGT)3tataataatagtaataatag(TAA)4tagtataaataataaaattgtg(A)10 | c | 42166 | 42247 | 82 | Design Primer |
| 18 | NC_022151 | (ATTATC)4attattataaatataattatcattatc(ATT)4ataaatatc(ATT)4 | c | 49843 | 49926 | 84 | Design Primer |