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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion

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S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_022151(AATA)3p44354436512Design Primer
2NC_022151(T)10p16983699210Design Primer
3NC_022151(ATTAA)8(TAAA)3*c*7218726649Design Primer
4NC_022151(TAAA)3aaacataaataatttt(AATAAA)12c83058404100Design Primer
5NC_022151(A)12p18518852912Design Primer
6NC_022151(TATT)6p49313933624Design Primer
7NC_022151(TTAAT)5p5125381256225Design Primer
8NC_022151(TAAA)5(AAATAA)3*c*139281395831Design Primer
9NC_022151(TAT)5p3140961411015Design Primer
10NC_022151(A)10tatatttaatttacttttaaaaaaggtaaaacttaattatcattattgataatattaacataataaatttatataaattattataattaaaaaaag(ATTA)6c1447114600130Design Primer
11NC_022151(TAA)9p3150971512327Design Primer
12NC_022151(TAA)4p3158351584612Design Primer
13NC_022151(ATTTA)10p5161121616150Design Primer
14NC_022151(AATTT)4p5164091642820Design Primer
15NC_022151(AACTTA)4p6174891751224Design Primer
16NC_022151(TTA)4p3184261843712Design Primer
17NC_022151(TAT)5aattat(TTATA)4attat(AATTA)4c187211878666Design Primer
18NC_022151(ATAAAA)5p6188971892630Design Primer
19NC_022151(TAA)5p3192691928315Design Primer
20NC_022151(TATT)3p4197341974512Design Primer
21NC_022151(TAA)5p3200382005215Design Primer
22NC_022151(ATA)4ttttatttgctatattaattattattgttagttctatctcaatattatattatagtaatataattaaaactatttgatttaatattaatattaattt(AAATTC)3c2023520361127Design Primer
23NC_022151(TATAT)3p5204742048815Design Primer
24NC_022151(AAAAAT)3aaaattaaaaataatcaactttattaatttttgaatataaaaaggaaaattcaatttatttaaaaatgaattaaaatttt(AAATTA)6(ATT)5*aataattaaaattaaaaa(AATT)3c*2099721171175Design Primer
25NC_022151(TAAT)4(TTAAT)3*(AT)6*c*223852242036Design Primer
26NC_022151(TAAAT)3p5230412305515Design Primer
27NC_022151(AATTTA)3catttacatttttaattaacatttatattaatattaagattaaaagattaaataaatcaa(ATT)4c232232331290Design Primer
28NC_022151(TTTTA)3p5235152352915Design Primer
29NC_022151(AATA)5p4239852400420Design Primer
30NC_022151(GTTATA)5(GTTATT)5c241112417060Design Primer
31NC_022151(TTAATG)4taataaattatattaataattgataaataaaattatttgaaaaaaaaatatg(AATAAA)3c242842437794Design Primer
32NC_022151(TTATA)4(TAAT)3*tattg(AATAAA)3(AAAAT)3*c*248462490560Design Primer
33NC_022151(TATAC)4p5251362515520Design Primer
34NC_022151(ATA)7p3252782529821Design Primer
35NC_022151(ATTTA)3tattaatatattataatttatattatttttatataaaggtaatataaggtgataattattaattattagattaatagataaaaaaaaga(TAAT)3c2556125676116Design Primer
36NC_022151(TTAATA)4p6270022702524Design Primer
37NC_022151(AAT)5p3274892750315Design Primer
38NC_022151(ATAA)3atactctaaaaa(TAAGAG)3c281112815242Design Primer
39NC_022151(TAAT)3tagtaatataagttaaaaaagtataataataaatatttatcctttattatttatcctttattatttatgagtat(TAA)4c284032850098Design Primer
40NC_022151(TAAA)5p4287752879420Design Primer
41NC_022151(AATA)3p4291412915212Design Primer
42NC_022151(T)10p1294172942610Design Primer
43NC_022151(TTA)5ttcttatattatagaattttagataaaattattttcttttatt(A)11c299002996869Design Primer
44NC_022151(A)10p1302153022410Design Primer
45NC_022151(AAT)4p3306663067712Design Primer
46NC_022151(ATAATG)3p6308373085418Design Primer
47NC_022151(AAT)4p3313693138012Design Primer
48NC_022151(ATAA)3p4316383164912Design Primer
49NC_022151(TAA)6p3318583187518Design Primer
50NC_022151(AAT)4p3320793209012Design Primer
51NC_022151(TGATTA)4p6341133413624Design Primer
52NC_022151(A)10taata(TATAT)6c343623440645Design Primer
53NC_022151(T)11attataaattaaaacttacttttttttaatttatattgttctttttttattactttttttattattatatttttataaaatataattt(ATTA)3c3547335583111Design Primer
54NC_022151(TTAAG)4p5361963621520Design Primer
55NC_022151(TTTAAA)3tttataatgagtttataattaaaattattaatataataattatattaaagtaattta(T)10c377863787085Design Primer
56NC_022151(TTA)4p3391233913412Design Primer
57NC_022151(AT)6p2397013971212Design Primer
58NC_022151(ATT)4tatttttaaattatttaaatttccatttaaattaatattttttaat(TTA)4c400344010370Design Primer
59NC_022151(TTA)7tttaatgatttatttaatctaccaaatatacgatttattgaaaatacaattaattgtaaataatttggaa(TAT)6c4038640494109Design Primer
60NC_022151(TTA)5p3411904120415Design Primer
61NC_022151(ATATT)3p5416084162215Design Primer
62NC_022151(TTTTAT)3p6417744179118Design Primer
63NC_022151(TATAGT)3tataataatagtaataatag(TAA)4tagtataaataataaaattgtg(A)10c421664224782Design Primer
64NC_022151(TTTAT)3p5425264254015Design Primer
65NC_022151(TA)6(ATATA)3*c*427804280122Design Primer
66NC_022151(TAT)4p3447504476112Design Primer
67NC_022151(AATTAA)3p6449104492718Design Primer
68NC_022151(TTTAA)3p5452774529115Design Primer
69NC_022151(TAAT)3p4454554546612Design Primer
70NC_022151(AATA)3p4461814619212Design Primer
71NC_022151(ATA)4p3467494676012Design Primer
72NC_022151(AATT)4p4470654708016Design Primer
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74NC_022151(TTTAAA)3p6485784859518Design Primer
75NC_022151(ATTATC)4attattataaatataattatcattatc(ATT)4ataaatatc(ATT)4c498434992684Design Primer