ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Trochodendron aralioides chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_021426(A)17p121423017Design Primer
2NC_021426(TGAA)3p41771178212Design Primer
3NC_021426(AATAA)3ataataa(AT)6aawaawaata(AT)6aawaawaataaatatat(TAA)4(AT)6aa(AT)6aatawt(TAA)6(AAT)4(AT)6*aataataawaaatatat(TAA)4(AT)6aa(AT)6aataattaataawaataataataaaataataawa(AT)6(ATA)4*aatatattaataataawaa(AT)6aa(AT)6aataat(TAA)6aataataataaaataataatataatatataatatataat(ATA)4c*48995286388Design Primer
4NC_021426(T)10p15700570910Design Primer
5NC_021426(T)10atttgtatataatgtataatggcaaatagatccataaaatcatcaaatcaattagactattatttgagtcttttttgttcttccttcccgaaaaag(A)10c60306145116Design Primer
6NC_021426(A)17p19304932017Design Primer
7NC_021426(A)11p19789979911Design Primer
8NC_021426(A)12p1104201043112Design Primer
9NC_021426(T)11p1147091471911Design Primer
10NC_021426(A)11p1164271643711Design Primer
11NC_021426(A)10p1181421815110Design Primer
12NC_021426(T)10p1201892019810Design Primer
13NC_021426(A)11p1303063031611Design Primer
14NC_021426(TTC)4p3316023161312Design Primer
15NC_021426(AATA)3taataatataatataaat(ATA)4aataataatcaaaataataataaataataataaaaatataatataaattataaataaatcaaataagtaatata(AAT)4c3455534682128Design Primer
16NC_021426(A)11p1399633997311Design Primer
17NC_021426(T)13c(A)10c403754039824Design Primer
18NC_021426(A)10p1410604106910Design Primer
19NC_021426(TTTCT)3p5456484566215Design Primer
20NC_021426(A)15p1461894620315Design Primer
21NC_021426(TAAA)3(A)12*c*480494806921Design Primer
22NC_021426(A)12p1483224833312Design Primer
23NC_021426(T)15aacggtttttcacaagaaaaaaaaatgta(T)10c488894894254Design Primer
24NC_021426(T)12p1502715028212Design Primer
25NC_021426(A)10p1510915110010Design Primer
26NC_021426(A)11p1514905150011Design Primer
27NC_021426(AGTT)3gaaaaacccaaaagtctagtctagaggagttgaagtatgagaatagacaagcttaatctcagatacagtgcaaatagaatctgatctcctttca(T)10c5304853163116Design Primer
28NC_021426(T)10p1533395334810Design Primer
29NC_021426(T)11p1556045561411Design Primer
30NC_021426(C)10p1559995600810Design Primer
31NC_021426(T)11p1575475755711Design Primer
32NC_021426(ATA)4p3595535956412Design Primer
33NC_021426(T)10p1686046861310Design Primer
34NC_021426(ATCTA)3p5687786879215Design Primer
35NC_021426(A)10p1689696897810Design Primer
36NC_021426(AAAG)3p4705367054712Design Primer
37NC_021426(A)11p1709117092111Design Primer
38NC_021426(TTA)4ctattactctattgattattgattgcaaagaaatctttcataattggatttctagttagcaacttcta(T)10(TTC)4*c*7285472953100Design Primer
39NC_021426(AT)9p2732757329218Design Primer
40NC_021426(A)16gaatcagagaagaagaaattc(T)13c737777382650Design Primer
41NC_021426(A)16p1757267574116Design Primer
42NC_021426(A)10p1766817669010Design Primer
43NC_021426(T)14p1768967690914Design Primer
44NC_021426(A)11p1818238183311Design Primer
45NC_021426(T)10aataaag(A)17c832828331534Design Primer
46NC_021426(TTTA)3p4860068601712Design Primer
47NC_021426(T)13gaatctgttctttcaatgcaaagggcgaagg(A)10c864858653854Design Primer
48NC_021426(T)10p1875998760810Design Primer
49NC_021426(T)16p1896098962416Design Primer
50NC_021426(T)10p110842710843610Design Primer
51NC_021426(A)10p111885411886310Design Primer
52NC_021426(T)10p112042412043310Design Primer
53NC_021426(T)10p112102812103710Design Primer
54NC_021426(T)10p112266512267410Design Primer
55NC_021426(A)10p112625812626710Design Primer
56NC_021426(T)11p112788512789511Design Primer
57NC_021426(TAA)4p313069413070512Design Primer
58NC_021426(T)10p113195113196010Design Primer
59NC_021426(CATT)3p413283013284112Design Primer
60NC_021426(A)11p113440613441611Design Primer
61NC_021426(A)10p114299314300210Design Primer
62NC_021426(A)16p116180516182016Design Primer
63NC_021426(A)10p116382116383010Design Primer
64NC_021426(T)10ccttcgccctttgcattgaaagaacagattc(A)13c16489116494454Design Primer
65NC_021426(ATAA)3p416541116542212Design Primer