Compound Compound Repeats of Flammulina velutipes strain 4019-20 mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_021373 | (TTTATT)3ttttaacttttttattaactcacttaatttatttaaataaattat(TTTA)3 | c | 239 | 313 | 75 | Design Primer |
| 2 | NC_021373 | (TTAA)3attaat(TTAAA)3 | c | 3157 | 3189 | 33 | Design Primer |
| 3 | NC_021373 | (AATT)3aaataatattaaatatactaa(AAT)4 | c | 16821 | 16865 | 45 | Design Primer |
| 4 | NC_021373 | (GTTA)3attaatttaattaatttatttaaacaaaaatatctaattggaatttttaaatttaaatttaatcttaaataaacagcctt(TTTAA)5(ATTT)3 | c | 23067 | 23195 | 129 | Design Primer |
| 5 | NC_021373 | (T)10ataaagtaatattttaatcttgtataatttttatctataaaatattaaattgtatatagtattaacagtttaaataataatctatg(TTTTAA)3ttaaattttaatttaattttaatcttaattctttatatttataaaaaaagtaaatataaaat(A)10 | c | 26990 | 27175 | 186 | Design Primer |
| 6 | NC_021373 | (TAA)4tattaaaaatttaaataaatctaataatatatctaataaaaatatagttataaataatgatatatta(AAT)4 | c | 28350 | 28440 | 91 | Design Primer |
| 7 | NC_021373 | (A)10ttgaattatttaataaaaaatcaaaaatgtctaattttttaaataataacaatattaaaaattatggctttgggtataattttttaactaatgagt(ATA)4 | c | 29302 | 29419 | 118 | Design Primer |
| 8 | NC_021373 | (TAA)4ttataataataatt(ATA)7atttattatattctttaaaatttaaattatttaaattgaataaatttattggttttttaaataatttctttaagaatgttaataaacaaataaatactat(TAA)7 | c | 29883 | 30050 | 168 | Design Primer |
| 9 | NC_021373 | (AAT)5aaaattattaatagaatatctaatcctgtttatatgtttaaaaataataatcaaattaataataatttaaatattaacacaat(TAA)5 | c | 30325 | 30437 | 113 | Design Primer |
| 10 | NC_021373 | (TAA)5aattaataattttaataatttaactcaa(AAT)6 | c | 31782 | 31842 | 61 | Design Primer |
| 11 | NC_021373 | (TAA)5ttaatataata(ATT)4 | c | 32904 | 32941 | 38 | Design Primer |
| 12 | NC_021373 | (AATTGT)4aa(TTGAAG)3 | c | 33528 | 33571 | 44 | Design Primer |
| 13 | NC_021373 | (TAAT)3tatttactaaaaaaaataataaaataaactaaaaaaat(A)10taaatagtcaattaaaaaaaataaaaagattaaaagaagataataaaaattgtaaaaagcatataaaatataac(A)11 | c | 35232 | 35376 | 145 | Design Primer |
| 14 | NC_021373 | (TTAA)3actaatataaattaggtacagttaattc(TTAA)3 | c | 35648 | 35699 | 52 | Design Primer |
| 15 | NC_021373 | (T)12attttatattattttatttttatattattataattttattttaat(ATTA)3 | c | 38672 | 38740 | 69 | Design Primer |
| 16 | NC_021373 | (TTAT)3ttaaa(TATT)3taattctttatataa(ATTT)4 | c | 39503 | 39562 | 60 | Design Primer |
| 17 | NC_021373 | (A)10gatacctttaag(TGTAAT)3 | c | 39963 | 40002 | 40 | Design Primer |
| 18 | NC_021373 | (TTA)4tttag(TAT)4 | c | 65454 | 65482 | 29 | Design Primer |
| 19 | NC_021373 | (ATT)4tgtgactatcgttaaactgttttaagtgtctaacagt(A)12 | c | 68635 | 68695 | 61 | Design Primer |
| 20 | NC_021373 | (A)11ttctattaaattaaatatacaaaaatcaatgaaaaaaacagaaatac(A)11 | c | 69462 | 69530 | 69 | Design Primer |
| 21 | NC_021373 | (AATA)3taataaatttaataattaatttaaataatcaaaagaaattatattttttatacaccca(T)10attctaaagtatgtactttttataatattaaaagtatttttttacgtgaatttaattaaatttaaccattttaaagagaaatttttaaattatttaaaa(TAT)4 | c | 70727 | 70917 | 191 | Design Primer |
| 22 | NC_021373 | (A)11tataataatatactaatataataat(ATA)4 | c | 72950 | 72997 | 48 | Design Primer |
| 23 | NC_021373 | (T)10aatt(A)10 | c | 73223 | 73246 | 24 | Design Primer |
| 24 | NC_021373 | (ATTA)3att(TTTTA)3atatta(ATTT)3 | c | 75512 | 75559 | 48 | Design Primer |
| 25 | NC_021373 | (TTA)4attaatttaatttatacatctt(TTA)4 | c | 78716 | 78761 | 46 | Design Primer |
| 26 | NC_021373 | (A)10tactataattataaactgattataaaaattatttaattattttattgaaaaacctttatattattatatatttttaaaatatgataaaaatatcc(T)12caaaaaataacaaataaaatataatatcatatcaaaatttattca(ATT)4 | c | 80901 | 81074 | 174 | Design Primer |
| 27 | NC_021373 | (TTAGTT)3ttaaaattaaatctagtttatttttattactattttatttaagtattatttctagttaaaaaa(TATT)3 | c | 84766 | 84858 | 93 | Design Primer |
| 28 | NC_021373 | (TTAT)3ttaaatcttaaaattaaaaaaaatctcacataaaaaaaaataaaaagtagcaaatt(A)10 | c | 87259 | 87336 | 78 | Design Primer |