ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Compound Repeats of Pneumocystis murina mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_020332(T)10aattaatgatcaataaactaaatcaattattagttattattaaattaaaaagtaag(TAAA)4c37145282Design Primer
2NC_020332(TGAGTT)3aggttagagagagtta(GAGT)8ttagtttagattcgattccagacagatacagatagattagattgatagatta(GATT)3gatagtgatagatta(GATT)3gatagtgatagatta(GATT)3gatagatttaagaaggtactgaatgactttgaatgggagtagtctatattaa(TAG)4c7561003248Design Primer
3NC_020332(ATTT)4attaattaattttattaattttt(TTAA)4tta(TTAT)3taattgaatgaattcagaattcaattgattattcattcttcgattcctttcattgattattaatgaatacatttc(ATTT)9atgtatgttaatgttatttatgt(ATTA)3ata(AAATC)3aaattcattgattatgaattaatgaattcctttcatttattaattaaattaata(AAATC)3c19062208303Design Primer
4NC_020332(ATTTG)3attttattaatttaattaataaatgaaaggaattcattaattcataatcaatga(ATTTG)3atttt(ATTA)3atacataaataacattaacatac(ATAA)9atgaaatgtattcattaataatcaatgaaaggaatcgaagaatgaataatcaattgaattctgaattcattcaatt(AATA)3a(TAAT)4taaaaaaattaataaaattaatt(AATA)4c2239722700304Design Primer
5NC_020332(TAC)4tattaatatagactactcccattcaaagtcattcagtaccttcttaaatct(ATCA)3atctaatctatcact(ATCA)3atctaatctatcact(ATCA)3atctaatctatcaatctaatctatctgtatctgtctggaatcgaatctaaactaa(ACTC)8taactctctctaacct(AACTCA)3c2360423853250Design Primer
6NC_020332(TTAT)4ttacttactttttaatttaataataactaataattgatttagtttattgatcattaatt(A)10c241542423885Design Primer