All Repeats of Pneumocystis murina mitochondrion
Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_020332 | (AAT)4 | p3 | 5 | 16 | 12 | Design Primer |
| 2 | NC_020332 | (TTA)6 | p3 | 122 | 139 | 18 | Design Primer |
| 3 | NC_020332 | (T)10aattaatgatcaataaactaaatcaattattagttattattaaattaaaaagtaag(TAAA)4 | c | 371 | 452 | 82 | Design Primer |
| 4 | NC_020332 | (TGAGTT)3aggttagagagagtta(GAGT)8ttagtttagattcgattccagacagatacagatagattagattgatagatta(GATT)3gatagtgatagatta(GATT)3gatagtgatagatta(GATT)3gatagatttaagaaggtactgaatgactttgaatgggagtagtctatattaa(TAG)4 | c | 756 | 1003 | 248 | Design Primer |
| 5 | NC_020332 | (AAGT)4gtagtgtagtgaagtaagtgtagtgtagtgaggttagggatattcaatagattcatttcattctgattgatatggattgaa(TATAT)3(ATTAT)3atattatattattatagaatagatattatattatatct(TATTA)3ta(TAT)4agatattatatattattatagatattata(TAT)4agatattatatattata(TAT)4ag(ATATT)3ataatattatta(TAT)4(AGATA)3(AGAT)3*cacagactgacttacccacgacaactcacttcatga(AATG)4aattaaatattaataaataaaattctgaaataaattcaatgaaatgaaattaaatgaaattaaattcaatgaaattaatt(ATTA)3 | c* | 1283 | 1753 | 471 | Design Primer |
| 6 | NC_020332 | (ATTT)4attaattaattttattaattttt(TTAA)4tta(TTAT)3taattgaatgaattcagaattcaattgattattcattcttcgattcctttcattgattattaatgaatacatttc(ATTT)9atgtatgttaatgttatttatgt(ATTA)3ata(AAATC)3aaattcattgattatgaattaatgaattcctttcatttattaattaaattaata(AAATC)3 | c | 1906 | 2208 | 303 | Design Primer |
| 7 | NC_020332 | (A)11 | p1 | 3050 | 3060 | 11 | Design Primer |
| 8 | NC_020332 | (T)12 | p1 | 10910 | 10921 | 12 | Design Primer |
| 9 | NC_020332 | (CTT)4 | p3 | 13075 | 13086 | 12 | Design Primer |
| 10 | NC_020332 | (TTAT)3 | p4 | 13511 | 13522 | 12 | Design Primer |
| 11 | NC_020332 | (T)10 | p1 | 18741 | 18750 | 10 | Design Primer |
| 12 | NC_020332 | (TAT)5 | p3 | 19340 | 19354 | 15 | Design Primer |
| 13 | NC_020332 | (ATTTG)3attttattaatttaattaataaatgaaaggaattcattaattcataatcaatga(ATTTG)3atttt(ATTA)3atacataaataacattaacatac(ATAA)9atgaaatgtattcattaataatcaatgaaaggaatcgaagaatgaataatcaattgaattctgaattcattcaatt(AATA)3a(TAAT)4taaaaaaattaataaaattaatt(AATA)4 | c | 22397 | 22700 | 304 | Design Primer |
| 14 | NC_020332 | (TTAA)3taattaatttcattgaatttaatttcatttaatttcatttcattgaatttatttcagaattttatttattaatattta(ATTC)4atttcatgaagtgagttgtcgtgggtaagtcagtctgtg(ATCT)3(TATCT)3*(ATA)4taataatat(TATAA)3tatct(ATA)4tataatatataatatct(ATA)4tataatatctataataatatataatatct(ATA)4(ATATA)3*ataagatataatataatatctattctataataatataat(ATATA)4taatataatatattcaatccatatcaatcagaatgaaatgaatctattgaatatccctaacctcactacactacacttacttcactacactac(ACTT)4 | c* | 22855 | 23326 | 472 | Design Primer |
| 15 | NC_020332 | (TAC)4tattaatatagactactcccattcaaagtcattcagtaccttcttaaatct(ATCA)3atctaatctatcact(ATCA)3atctaatctatcact(ATCA)3atctaatctatcaatctaatctatctgtatctgtctggaatcgaatctaaactaa(ACTC)8taactctctctaacct(AACTCA)3 | c | 23604 | 23853 | 250 | Design Primer |
| 16 | NC_020332 | (TTAT)4ttacttactttttaatttaataataactaataattgatttagtttattgatcattaatt(A)10 | c | 24154 | 24238 | 85 | Design Primer |
| 17 | NC_020332 | (TAA)6 | p3 | 24470 | 24487 | 18 | Design Primer |
| 18 | NC_020332 | (TTA)4 | p3 | 24591 | 24602 | 12 | Design Primer |