Compound Repeats of Pneumocystis jirovecii mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_020331 | (TTAT)3tataatttattatttctatttattactgttgtatttttattattagtattatatctattattatg(TAT)4 | c | 490 | 578 | 89 | Design Primer |
| 2 | NC_020331 | (TA)6atacagtttatagttaaatagtgttatattaaagtataataaggtatatttatattgtatatagtatatttaaatattctaatta(TAAG)3 | c | 970 | 1078 | 109 | Design Primer |
| 3 | NC_020331 | (TA)6atataatagattaatgtaatgtgattgtgttatattgtattcttattttaatattgttgtgtattctaatttatctacaattatgttaataaaattttac(TAT)4 | c | 2899 | 3022 | 124 | Design Primer |
| 4 | NC_020331 | (TA)6agtaatatactttaaatgtaatgtctttatgtatattagtgtagttattctaatttatactaaga(AT)6 | c | 4923 | 5011 | 89 | Design Primer |
| 5 | NC_020331 | (AATA)3ttatagtattagattaaggatag(TTAA)3 | c | 7018 | 7064 | 47 | Design Primer |
| 6 | NC_020331 | (GTAT)3atag(ATGT)3 | c | 11273 | 11300 | 28 | Design Primer |
| 7 | NC_020331 | (T)10attgctttttattatattatagttcattagattacattttatttta(TTATT)3ttatattgtattacattatattacattatataacattatataacattttataac(ATTAT)3attt(TATTA)3 | c | 18981 | 19139 | 159 | Design Primer |
| 8 | NC_020331 | (T)10ctgttgtgtatctagatttattatcttttttt(TTA)4tttattattattttaaatatttttattgaatttatttagatatttaattccatttattatgtttatttatta(AT)7 | c | 28608 | 28747 | 140 | Design Primer |