Compound Repeats of Lachancea kluyveri mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_018056 | (AATA)3tatatatta(TAAT)3tt(ATAA)3 | c | 70 | 116 | 47 | Design Primer |
| 2 | NC_018056 | (ATTA)4acttaatatattatatatataatatttttttatatatataattatttattgactatattctta(T)13atatttaaattatattttatttgagtttttttttattgatagagggtttttatattattaaataat(ATA)5attatatattttatat(TA)8tttataatattattttttaa(TATT)3 | c | 1624 | 1860 | 237 | Design Primer |
| 3 | NC_018056 | (ATAA)4aaacccggctaaatataataaaatataatggtcataaacacagctcttcgggcctccctttcttaaaaggtgttttaattaaataaaatcaactgtatta(AAT)5a(AAT)5aaaataat(AATATA)3gcccccctccaaccaacccttaaagggtggggaggggggcggtgacctgtagatatagatatttctattta(ATTAT)3 | c | 2005 | 2263 | 259 | Design Primer |
| 4 | NC_018056 | (AT)6a(AAAT)4aatatacaaactttaataattatattaaagattaaataaataatatatatataataaataataatatatatataaataattaatttttata(TAAT)4 | c | 2425 | 2560 | 136 | Design Primer |
| 5 | NC_018056 | (ATT)4cttttttttagtattttttcttaattattttttgttaataaattattatttaataatttattatattttat(TA)6 | c | 3406 | 3500 | 95 | Design Primer |
| 6 | NC_018056 | (ATA)4ttcct(TTTA)3ccccgccggtcacaaatattatattacacagattaactaactgtgtttaaatgtgccggcggg(TATT)5aaattatataaaaaataaatattaattaataaaaaataaaatattaattaataaaataataaaaattata(TATT)3atttattaataatataaatatattatattatgtaatattataaaaaaacaaaaataatacttttatatatgaaaagtaaaataaac(TAT)4 | c | 3860 | 4151 | 292 | Design Primer |
| 7 | NC_018056 | (TTATAA)3tttatcttatgatattaatatttttataaaaataaaataaaaatatatgaagtatatatatttaatttaaataata(AATT)4aaagtttttaaagataaataactaattaat(TAAC)5t(AATA)5 | c | 4289 | 4469 | 181 | Design Primer |
| 8 | NC_018056 | (AAT)4aaataattatataaaaatt(ATTA)4atgaattaattcatt(TA)7aataaattaaataaattaatatatatataataatatataataatatataatatatataataaataatattaatttaaataatata(AAT)4aaataatattaatataaatattaataaataataatttataaacctttgttatatatattaattaaataaaatacctattctattcttaataa(ATT)5atattaaataataatatatatttaatataata(AT)6 | c | 5048 | 5371 | 324 | Design Primer |
| 9 | NC_018056 | (AAAT)4aattattaataataatattattatatattccttttttattattaatatttaataaattatatt(ATTA)3aaaaaaacaaaataaattattacttaaaattattaataataattattaat(AATAA)3ttaatatttttattaataattaataaattttattaatagtaaatataaaatataat(AATA)3 | c | 7030 | 7253 | 224 | Design Primer |
| 10 | NC_018056 | (T)10atttttttatttaattattaaatattatattataaataaaaaaaag(AATT)3aataatataaatatat(ATA)4 | c | 7478 | 7573 | 96 | Design Primer |
| 11 | NC_018056 | (TTAA)5aaattatatatatatctctaatttaattaaaaataaattat(A)12taaaaatttatatataataactattttaataaaaattttttttataaaaaaaataatataataagattataaaatataattttata(TAT)4 | c | 7782 | 7952 | 171 | Design Primer |
| 12 | NC_018056 | (TA)8(TTAA)3 | c | 8980 | 9007 | 28 | Design Primer |
| 13 | NC_018056 | (AT)8aagtaagaattaatatataatatattaataatatcttaataataatttatatatctataatatattgattaattaaataaatatataaatatat(ATA)4aattatatatttataatag(ATTA)3 | c | 9715 | 9867 | 153 | Design Primer |
| 14 | NC_018056 | (AT)8ctaataatatata(TATC)3taataatatatatatctaataatatatatctctaaattattccctcttg(TTTATA)11tttatgttattaatataa(ATATTT)3atattaatattaatatttatgtttatatttatatttatgt(TATTAA)3tatttatgtttacatttatatttatgttattaatattaatatttatatttaatt(ATA)5 | c | 10214 | 10532 | 319 | Design Primer |
| 15 | NC_018056 | (ATAA)3taatatatttataatataaataattataaatataatattaataaaaatagt(A)10tagtaaatatagtttaatggtagaatatatgtttttaggtgcataggatctgagttcaattctcagtgtttac(AT)8aaa(AAAT)3 | c | 10682 | 10858 | 177 | Design Primer |
| 16 | NC_018056 | (TTAA)7tttatg(TTAT)3ataaataaatt(TA)7 | c | 11012 | 11082 | 71 | Design Primer |
| 17 | NC_018056 | (A)11taaaaaatggaggtgttgtttaaaggttaaactgttagattgcaaatctattcattaagagttcgattctcttcatctcttaatatattat(ATA)4t(ATA)6tttaattatataaaaaaaacaaaaatataatatataa(AAAT)3a(ATTT)6attaatatgtttttatatctaatttatatataaaa(AT)7aaata(AT)7aataatatatttattaattgtttttgattattatatatattaattaattt(ATTA)3atttatattatttaa(TTAT)3gttatataa(TTAT)3gttata(TAAT)4(TATT)6cctaataaaataattataaatttataggcttttatttt(TTAA)3gaaagg(AAT)4tattattataaaaaaaaataatatataaatatatatattaatttaatataaaaaaaataatattattt(ATATA)4atatttatattaat(AAATAA)3taaataatcttagaaagtaatataagtaataaaataa(AT)6 | c | 11806 | 12473 | 668 | Design Primer |
| 18 | NC_018056 | (TA)6ataatatattctattatattatattttattctattatattatataatatattattatataataaatattat(TA)6aaaaaacaaaaatataatatat(A)10taaaaaag(AT)7taaagat(A)14 | c | 12606 | 12775 | 170 | Design Primer |
| 19 | NC_018056 | (T)11atttttttgtt(TTTA)3attattaatagttattatttttaatacttattttattattaacagttattatttttatatatttttatattatttctttaatataatattatta(ATAAT)4aaat(TAATA)3 | c | 13628 | 13794 | 167 | Design Primer |
| 20 | NC_018056 | (TA)6tttatgaatattataataattaactctccaatataatt(TA)6(TTTA)3ccccgccgggcacaaagacagttaatctgtgtaatataatatttgtgccggcggg(TATT)3 | c | 14416 | 14556 | 141 | Design Primer |
| 21 | NC_018056 | (C)12attaagggggggcggtggcctggagtataagtaataatataaaattgtaattattattatatttaataaaatataatattttaataattaata(AAT)4taactttataa(AAT)4 | c | 14675 | 14814 | 140 | Design Primer |
| 22 | NC_018056 | (AT)7taaatatt(TA)6tctaaatatatataaagt(ATAA)3 | c | 14964 | 15027 | 64 | Design Primer |
| 23 | NC_018056 | (TA)8ttctaatataaat(AATA)3 | c | 15722 | 15762 | 41 | Design Primer |
| 24 | NC_018056 | (ATCT)3atttatttatctatctatttatctatta(TTTC)3(TTTA)4tttctcccgccggtcacaaacacagatttaattaactgtgtataaatgtgccggcggg(TATT)4tatctatttattgattgatttatg(TA)8aaaat(TA)6aatatatatattttaatataaaaaaatataataattaattatttttgtaaataaattatatctaaataaattttatataaataaat(TA)6atataagctctcttagcttaatggttaaagcataatacttctaatattaggattccatgttcaaatcatggagagagtattagtactataag(TAA)4ttcttctttcttattg(ATTT)4(TAA)4 | c | 15962 | 16406 | 445 | Design Primer |
| 25 | NC_018056 | (TATT)4tatat(ATA)6 | c | 16546 | 16584 | 39 | Design Primer |
| 26 | NC_018056 | (AATT)5gatattaaataaatagataataaaaattattataataaatatatttatataaaaaaaaataaataataataa(ATATT)7ttat(ATAA)3taaatatatatatctaaaatattataatatatatatctaaa(AT)6 | c | 16751 | 16946 | 196 | Design Primer |
| 27 | NC_018056 | (AT)6aaatataatatctttttatatattattatatatataaatataatattacaatata(TATC)5tatttatttcccccgccggtcacaaacacagattaactgtgtaatatttgtgaccggcggg(TATT)3 | c | 17098 | 17257 | 160 | Design Primer |
| 28 | NC_018056 | (TATT)3tatatattaaattaattaaataataataaatattaataatataaagcttttatttttgttaaataaaaaataattc(TA)9aaaaaaataataaataaaaatatttaa(AT)6 | c | 17368 | 17512 | 145 | Design Primer |
| 29 | NC_018056 | (TATG)7tatatatgtctgtata(TATG)3tattaaaagtaataatataattttatatattatatataatatatatatactataaaaaaatata(TAAT)6tattataaaaa(ATATT)3 | c | 18066 | 18235 | 170 | Design Primer |
| 30 | NC_018056 | (AATT)6aata(AAT)4 | c | 18523 | 18562 | 40 | Design Primer |
| 31 | NC_018056 | (AATA)3atgaatgaataaaaaagattatataaataa(AT)9aaaataaataaaaattatagttcccg(C)10 | c | 18923 | 19018 | 96 | Design Primer |
| 32 | NC_018056 | (AAAT)4taatc(AATT)7 | c | 19131 | 19179 | 49 | Design Primer |
| 33 | NC_018056 | (AAT)4aaag(AAAT)3 | c | 19534 | 19561 | 28 | Design Primer |
| 34 | NC_018056 | (AAT)5attataaaagatattttaattagtaaaccaatttatgaacatacagtaaataaattaaatattaaattttattatt(ATA)5aattaaaaaataataatataaataattattatataaatatagtatcaaaattaataaatttattaaataatg(ATA)4 | c | 19813 | 20002 | 190 | Design Primer |
| 35 | NC_018056 | (AAT)8attaataaatta(AAT)5 | c | 20266 | 20316 | 51 | Design Primer |
| 36 | NC_018056 | (TAAT)3tattatattttattatat(TA)6atatt(TA)9ttttttataatattttataatatttgattatattttatctttttattttttttatgtaataatattcta(T)13aattaattatctgctatattatttctattttataatat(TTATA)3ttttattatattctataatatttatattatattaaattatataata(T)12aactaactattatcatttttatttatatttttcctcttttatttaaatatagtccaaaaagttttaatttaattaactatgtaatttaatctaatc(TAATT)9 | c | 20706 | 21104 | 399 | Design Primer |
| 37 | NC_018056 | (AT)6aaatatctccaacccccttatctaaaaaataagagaagggtat(TA)6 | c | 22590 | 22656 | 67 | Design Primer |
| 38 | NC_018056 | (C)10acttaggggggt(G)10 | c | 23461 | 23492 | 32 | Design Primer |
| 39 | NC_018056 | (TAAT)6ataagatatatc(TA)7 | c | 23887 | 23936 | 50 | Design Primer |
| 40 | NC_018056 | (AATT)5attat(TAA)6tatttttctaatattatttaatataatattatttatattttaatatataattattatata(ATT)4tacctcggcaaaataataataaacacagatttaattaactcttcgggtccccgcccccctta(G)10cggggactgtgtaatataatattttgtgcgaatatttttttata(TAT)4 | c | 25718 | 25960 | 243 | Design Primer |
| 41 | NC_018056 | (ATA)4ttta(ATT)4 | c | 27540 | 27567 | 28 | Design Primer |
| 42 | NC_018056 | (ATTA)6ttttttaaataatataattcta(TATT)3 | c | 30118 | 30175 | 58 | Design Primer |
| 43 | NC_018056 | (AAAAT)7ggttacaaacatagattaactgtataatatttatacaggtacttatttatatttaattacctcggcag(AATAA)5aatattatattacacagatttaattaactgtgtttaattgtgctgctttactttatcgggaatattta(ATT)6tattatatta(ATATT)3 | c | 30632 | 30870 | 239 | Design Primer |
| 44 | NC_018056 | (TTATA)5tatcttaataaaataataataaatatagcttaattttataatatttatagccaccgccccccccttatgggggggggcgggaggcctagaagaatat(TTA)4 | c | 31154 | 31287 | 134 | Design Primer |
| 45 | NC_018056 | (TAT)5taatattatataatattatatataatattatttatttaccccgccggtcacaaacacagattaactgtgtaatatttgtgccggcggg(TATT)3atttttaata(ATT)4 | c | 31673 | 31809 | 137 | Design Primer |
| 46 | NC_018056 | (ATATA)3catatattatataaatctaaaatatctaat(ATA)5 | c | 32106 | 32165 | 60 | Design Primer |
| 47 | NC_018056 | (TAAA)3attagaccttatcgtctaatggttacgacatcatctcttcatgttgaaaataccggttcgattccggttaaggttaaaatagt(A)10 | c | 33121 | 33225 | 105 | Design Primer |
| 48 | NC_018056 | (A)10taattaagatcgtcggttaaataaataatcgcgacagactagtccactaatgggtatctgaaatgatgcttaatgtatagtcgaa(AT)9 | c | 35496 | 35608 | 113 | Design Primer |
| 49 | NC_018056 | (ATA)4ttaatattcctcaaaattattaattaatatatttattttataatatcttttttt(TATAA)4(TATT)4 | c | 36759 | 36860 | 102 | Design Primer |
| 50 | NC_018056 | (TAATA)4taatctttaggtttatttgtttaattaaagaggttttttataattattatatatataaataat(AATA)3 | c | 38000 | 38094 | 95 | Design Primer |
| 51 | NC_018056 | (AT)6aataa(TTAT)3 | c | 39224 | 39252 | 29 | Design Primer |
| 52 | NC_018056 | (AATAT)3atataattacagatagaagccaaagggtcaggcgctttctttgggagaaag(AGTT)3 | c | 40756 | 40833 | 78 | Design Primer |
| 53 | NC_018056 | (AT)11aatatataataaataataatat(ATA)4 | c | 41358 | 41413 | 56 | Design Primer |
| 54 | NC_018056 | (ATA)4tttaaatatttaagtatataataataaagttatatatttaataaagtgata(TATT)3taaatataattttaataaattatgaataaatg(AATA)3aattttaatagtacctgaagagttaatataatatttctaattattttatttaactagtataataaatataataaataattatattttaataatatatat(ATTA)6ataaatatataaaaacccgatggtcacaa(ATATT)3acatagctttaatcagctatatttatgctactttactttatagggaggataaatgaataaataaaaaataataaataataa(AT)7aatatataaaaaaataaaaatatataa(AT)7aata(AAT)5atataaataatataataaattttccacttatatatataataaatggagccgaaa(AT)6 | c | 41532 | 42038 | 507 | Design Primer |
| 55 | NC_018056 | (ATATAA)3aaaagtatgtttattatat(A)10tcaataaatatataataataaaaaatatagtataaaataataattaaaaaatatatataaaaaaaggtatataaaaaaaatga(AT)8 | c | 42185 | 42330 | 146 | Design Primer |
| 56 | NC_018056 | (ATA)5attatt(ATA)4 | c | 46145 | 46177 | 33 | Design Primer |
| 57 | NC_018056 | (AATT)3aaatgaaaaaaatatatatatttatatttattatattaattatattataacaaattagcggtcac(ATT)6 | c | 47559 | 47653 | 95 | Design Primer |
| 58 | NC_018056 | (ATTA)3tataaataaaaccctttcatttattaataaaataaatggaaaggaagatttaaattatcttcttagtaaatacaaatacaaatat(AAATAC)5aacttt(AATAA)4 | c | 47929 | 48081 | 153 | Design Primer |
| 59 | NC_018056 | (ATTA)3atgtacagtcggcgtctcaatatat(ATATA)3 | c | 48367 | 48418 | 52 | Design Primer |
| 60 | NC_018056 | (TTTA)3attatttttttattttatttatatatatattaaaatttatttttttatatttatatttaatttattaatttttttatataaataatta(T)10atattctttttttc(AT)6tctttattta(TAT)4tttatatttattattaatatttattatataatattattattaatatttagtagcctaaacattacatagctttaatcagccccca(C)11 | c | 49435 | 49688 | 254 | Design Primer |
| 61 | NC_018056 | (AATT)3atattatttatttttataataa(T)12 | c | 49880 | 49925 | 46 | Design Primer |
| 62 | NC_018056 | (TTAA)5tattattaattaaataataaaaatctacataaatattatat(AGTTA)5 | c | 50148 | 50233 | 86 | Design Primer |
| 63 | NC_018056 | (ATA)5aatat(TAATA)3atcaatataatataaataaaagaaagatatttattctttttttttcatataatagtcc(AT)11gtttaatgttcccggcggtcacatttaaacacagctttaatcagctgtg(TAATA)3tttgtgactattttaccgggtttatattattaattatatatatttttgtttatttaaatataaataatgat(TA)6ttttttttatttgtaataaattatatattttaa(AT)7aaataaaaacataataatataaataaaaacttag(TAATA)6 | c | 50349 | 50721 | 373 | Design Primer |
| 64 | NC_018056 | (TTTAA)3ttaactg(TATAA)4tatttggactactcacaaatatattat(TTA)6ttgtatattctatatatattattttattatttttcgagttctccccccccaacccttaaagggtt(G)10 | c | 51230 | 51391 | 162 | Design Primer |