ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Lachancea kluyveri mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_018056(AATA)3tatatatta(TAAT)3tt(ATAA)3c7011647Design Primer
2NC_018056(G)10ctaaataattttattatattatataatc(TAAA)3(ATATT)3*c*32038364Design Primer
3NC_018056(TAATA)3p557659015Design Primer
4NC_018056(ATA)4p3995100612Design Primer
5NC_018056(ATTA)4acttaatatattatatatataatatttttttatatatataattatttattgactatattctta(T)13atatttaaattatattttatttgagtttttttttattgatagagggtttttatattattaaataat(ATA)5attatatattttatat(TA)8tttataatattattttttaa(TATT)3c16241860237Design Primer
6NC_018056(ATAA)4aaacccggctaaatataataaaatataatggtcataaacacagctcttcgggcctccctttcttaaaaggtgttttaattaaataaaatcaactgtatta(AAT)5a(AAT)5aaaataat(AATATA)3gcccccctccaaccaacccttaaagggtggggaggggggcggtgacctgtagatatagatatttctattta(ATTAT)3c20052263259Design Primer
7NC_018056(AT)6a(AAAT)4aatatacaaactttaataattatattaaagattaaataaataatatatatataataaataataatatatatataaataattaatttttata(TAAT)4c24252560136Design Primer
8NC_018056(AT)6p22747275812Design Primer
9NC_018056(A)12p13112312312Design Primer
10NC_018056(ATT)4cttttttttagtattttttcttaattattttttgttaataaattattatttaataatttattatattttat(TA)6c3406350095Design Primer
11NC_018056(A)10p13743375210Design Primer
12NC_018056(ATA)4ttcct(TTTA)3ccccgccggtcacaaatattatattacacagattaactaactgtgtttaaatgtgccggcggg(TATT)5aaattatataaaaaataaatattaattaataaaaaataaaatattaattaataaaataataaaaattata(TATT)3atttattaataatataaatatattatattatgtaatattataaaaaaacaaaaataatacttttatatatgaaaagtaaaataaac(TAT)4c38604151292Design Primer
13NC_018056(TTATAA)3tttatcttatgatattaatatttttataaaaataaaataaaaatatatgaagtatatatatttaatttaaataata(AATT)4aaagtttttaaagataaataactaattaat(TAAC)5t(AATA)5c42894469181Design Primer
14NC_018056(TAT)5atttg(TTTTA)7(TA)7*ttaataaaat(TAA)5aataataaataataatattctatatttatgttatattat(TTATG)3ttatattatattat(TTATG)7c*45964790195Design Primer
15NC_018056(AAT)4aaataattatataaaaatt(ATTA)4atgaattaattcatt(TA)7aataaattaaataaattaatatatatataataatatataataatatataatatatataataaataatattaatttaaataatata(AAT)4aaataatattaatataaatattaataaataataatttataaacctttgttatatatattaattaaataaaatacctattctattcttaataa(ATT)5atattaaataataatatatatttaatataata(AT)6c50485371324Design Primer
16NC_018056(TAA)5atattatataacctcccaaccctataaagagaggaaatttatataaaatttaaataaatctaatt(TA)7aataatatctataa(TAAT)3(ATT)5*(TTAT)4*gtaatttatttaataaaatataataatatatataataaataat(TA)8(A)10*c*54885699212Design Primer
17NC_018056(TTTA)6ataataaataacaagaggaatagttataattaaatataattaa(T)16c(AATAT)4ttatataaatttataaaaataataacaaagataactttcctaactttcaatctt(A)10ggggggtgattaaattaaaataatattaaaatgagaatataaatatttaataaaaag(AT)6(ATATA)3*c*58026049248Design Primer
18NC_018056(A)13p16241625313Design Primer
19NC_018056(AAAT)4aattattaataataatattattatatattccttttttattattaatatttaataaattatatt(ATTA)3aaaaaaacaaaataaattattacttaaaattattaataataattattaat(AATAA)3ttaatatttttattaataattaataaattttattaatagtaaatataaaatataat(AATA)3c70307253224Design Primer
20NC_018056(T)10atttttttatttaattattaaatattatattataaataaaaaaaag(AATT)3aataatataaatatat(ATA)4c7478757396Design Primer
21NC_018056(TTAA)5aaattatatatatatctctaatttaattaaaaataaattat(A)12taaaaatttatatataataactattttaataaaaattttttttataaaaaaaataatataataagattataaaatataattttata(TAT)4c77827952171Design Primer
22NC_018056(TAAT)4tataattttttattgatattatatttataattaaatatttttattgt(ATTTA)7atttttttatttataaataaaaaacaaaaataataaaatatttaaaaataaaatatattttaaagaataatttattataataaattatttattattaat(TATTA)4aattatattatttattatataatttaatatatttaattatatttataaaaattaaaactttataaacttt(TTAC)5(T)10aataaaaaactattttattattcttcattattttaataattaaatatataataatt(TTA)4(ATTA)4*attttaataattattagtaataatattatttatttttagttttattttatttttgttttttttataaataaatttaatatttatattattataaatatat(AATA)3c*82738781509Design Primer
23NC_018056(TA)8(TTAA)3c8980900728Design Primer
24NC_018056(AT)8aagtaagaattaatatataatatattaataatatcttaataataatttatatatctataatatattgattaattaaataaatatataaatatat(ATA)4aattatatatttataatag(ATTA)3c97159867153Design Primer
25NC_018056(AT)8ctaataatatata(TATC)3taataatatatatatctaataatatatatctctaaattattccctcttg(TTTATA)11tttatgttattaatataa(ATATTT)3atattaatattaatatttatgtttatatttatatttatgt(TATTAA)3tatttatgtttacatttatatttatgttattaatattaatatttatatttaatt(ATA)5c1021410532319Design Primer
26NC_018056(ATAA)3taatatatttataatataaataattataaatataatattaataaaaatagt(A)10tagtaaatatagtttaatggtagaatatatgtttttaggtgcataggatctgagttcaattctcagtgtttac(AT)8aaa(AAAT)3c1068210858177Design Primer
27NC_018056(TTAA)7tttatg(TTAT)3ataaataaatt(TA)7c110121108271Design Primer
28NC_018056(AT)6p2112381124912Design Primer
29NC_018056(ATAA)3p4115531156412Design Primer
30NC_018056(A)11taaaaaatggaggtgttgtttaaaggttaaactgttagattgcaaatctattcattaagagttcgattctcttcatctcttaatatattat(ATA)4t(ATA)6tttaattatataaaaaaaacaaaaatataatatataa(AAAT)3a(ATTT)6attaatatgtttttatatctaatttatatataaaa(AT)7aaata(AT)7aataatatatttattaattgtttttgattattatatatattaattaattt(ATTA)3atttatattatttaa(TTAT)3gttatataa(TTAT)3gttata(TAAT)4(TATT)6cctaataaaataattataaatttataggcttttatttt(TTAA)3gaaagg(AAT)4tattattataaaaaaaaataatatataaatatatatattaatttaatataaaaaaaataatattattt(ATATA)4atatttatattaat(AAATAA)3taaataatcttagaaagtaatataagtaataaaataa(AT)6c1180612473668Design Primer
31NC_018056(TA)6ataatatattctattatattatattttattctattatattatataatatattattatataataaatattat(TA)6aaaaaacaaaaatataatatat(A)10taaaaaag(AT)7taaagat(A)14c1260612775170Design Primer
32NC_018056(T)11atttttttgtt(TTTA)3attattaatagttattatttttaatacttattttattattaacagttattatttttatatatttttatattatttctttaatataatattatta(ATAAT)4aaat(TAATA)3c1362813794167Design Primer
33NC_018056(AT)10p2139321395120Design Primer
34NC_018056(TA)6tttatgaatattataataattaactctccaatataatt(TA)6(TTTA)3ccccgccgggcacaaagacagttaatctgtgtaatataatatttgtgccggcggg(TATT)3c1441614556141Design Primer
35NC_018056(C)12attaagggggggcggtggcctggagtataagtaataatataaaattgtaattattattatatttaataaaatataatattttaataattaata(AAT)4taactttataa(AAT)4c1467514814140Design Primer
36NC_018056(AT)7taaatatt(TA)6tctaaatatatataaagt(ATAA)3c149641502764Design Primer
37NC_018056(TAAT)4ttataatatatttttaattatccgttcgatataaatataattttaataaataaattatctaatataatattgatatata(AT)6aataatatat(ATA)6t(ATA)7t(ATA)8aattc(TAAT)4tatatatttctttt(TTTA)5(TA)8*c*1528915539251Design Primer
38NC_018056(TA)8ttctaatataaat(AATA)3c157221576241Design Primer
39NC_018056(ATCT)3atttatttatctatctatttatctatta(TTTC)3(TTTA)4tttctcccgccggtcacaaacacagatttaattaactgtgtataaatgtgccggcggg(TATT)4tatctatttattgattgatttatg(TA)8aaaat(TA)6aatatatatattttaatataaaaaaatataataattaattatttttgtaaataaattatatctaaataaattttatataaataaat(TA)6atataagctctcttagcttaatggttaaagcataatacttctaatattaggattccatgttcaaatcatggagagagtattagtactataag(TAA)4ttcttctttcttattg(ATTT)4(TAA)4c1596216406445Design Primer
40NC_018056(TATT)4tatat(ATA)6c165461658439Design Primer
41NC_018056(AATT)5gatattaaataaatagataataaaaattattataataaatatatttatataaaaaaaaataaataataataa(ATATT)7ttat(ATAA)3taaatatatatatctaaaatattataatatatatatctaaa(AT)6c1675116946196Design Primer
42NC_018056(AT)6aaatataatatctttttatatattattatatatataaatataatattacaatata(TATC)5tatttatttcccccgccggtcacaaacacagattaactgtgtaatatttgtgaccggcggg(TATT)3c1709817257160Design Primer
43NC_018056(TATT)3tatatattaaattaattaaataataataaatattaataatataaagcttttatttttgttaaataaaaaataattc(TA)9aaaaaaataataaataaaaatatttaa(AT)6c1736817512145Design Primer
44NC_018056(AT)7p2178721788514Design Primer
45NC_018056(TATG)7tatatatgtctgtata(TATG)3tattaaaagtaataatataattttatatattatatataatatatatatactataaaaaaatata(TAAT)6tattataaaaa(ATATT)3c1806618235170Design Primer
46NC_018056(AT)6p2183931840412Design Primer
47NC_018056(AATT)6aata(AAT)4c185231856240Design Primer
48NC_018056(AATA)3atgaatgaataaaaaagattatataaataa(AT)9aaaataaataaaaattatagttcccg(C)10c189231901896Design Primer
49NC_018056(AAAT)4taatc(AATT)7c191311917949Design Primer
50NC_018056(AAT)4aaag(AAAT)3c195341956128Design Primer
51NC_018056(AAT)5attataaaagatattttaattagtaaaccaatttatgaacatacagtaaataaattaaatattaaattttattatt(ATA)5aattaaaaaataataatataaataattattatataaatatagtatcaaaattaataaatttattaaataatg(ATA)4c1981320002190Design Primer
52NC_018056(AAT)8attaataaatta(AAT)5c202662031651Design Primer
53NC_018056(TAAT)3tattatattttattatat(TA)6atatt(TA)9ttttttataatattttataatatttgattatattttatctttttattttttttatgtaataatattcta(T)13aattaattatctgctatattatttctattttataatat(TTATA)3ttttattatattctataatatttatattatattaaattatataata(T)12aactaactattatcatttttatttatatttttcctcttttatttaaatatagtccaaaaagttttaatttaattaactatgtaatttaatctaatc(TAATT)9c2070621104399Design Primer
54NC_018056(AATA)3p4212672127812Design Primer
55NC_018056(TAA)5p3214252143915Design Primer
56NC_018056(AT)7aattatattattaataattattataaaaataataaatacccggcaaaataaaatggccccatttaaacacagataagctgtgtttgtgacc(ATTTT)3gccggggttaaaatatataatatattatattttgg(TATAT)6tgtat(AATA)5taaaa(AT)6aaattagaataatatatatataactttctacttctttttaatataaaataaa(ATTCT)4attatattaataataattatatataatttctttgta(AAT)4tatattctattatattatatattataagtaataatatc(TA)6tctaaataaaaaaaaataacaatttcaatatatattatatatatctaatctatagatttatatcttatctttataattctaaataa(AAAT)3(AAT)4*taactaaaattaatttaataatatatataatttatatattcttaataatatataataaataataaataataa(TATT)5ataaaaaaaaataaaataatcacaaatacagattaac(TTAAT)3(TTAAC)4ttaattgtataatatttatgtgaatatttctttatttatatatttctata(AAT)4atc(TA)6ttaaagtataaaaaaggtatacataataatatataaaaaaagtaataata(AT)6c*2163322439807Design Primer
57NC_018056(AT)6aaatatctccaacccccttatctaaaaaataagagaagggtat(TA)6c225902265667Design Primer
58NC_018056(AT)7ctacataaataatatat(AATA)4(AT)6*ctacataaataatatat(AATA)3tatatctaaataatatatatctcga(AT)7ctacataaataatatat(AATA)3tatatctaaataatatatatctcga(AT)7aaatatatataaacatataaataatattagtaatatatctaaatatataataataaaaaatatttatg(TAAA)4c*2279723072276Design Primer
59NC_018056(TAAT)3p4232332324412Design Primer
60NC_018056(C)10acttaggggggt(G)10c234612349232Design Primer
61NC_018056(TAAT)6ataagatatatc(TA)7c238872393650Design Primer
62NC_018056(AATT)5attat(TAA)6tatttttctaatattatttaatataatattatttatattttaatatataattattatata(ATT)4tacctcggcaaaataataataaacacagatttaattaactcttcgggtccccgcccccctta(G)10cggggactgtgtaatataatattttgtgcgaatatttttttata(TAT)4c2571825960243Design Primer
63NC_018056(TATCT)4p5264722649120Design Primer
64NC_018056(TAAT)3p4266112662212Design Primer
65NC_018056(ATA)4ttta(ATT)4c275402756728Design Primer
66NC_018056(A)10p1278992790810Design Primer
67NC_018056(AAT)4p3287832879412Design Primer
68NC_018056(ATTA)4p4291492916416Design Primer
69NC_018056(TA)6p2293362934712Design Primer
70NC_018056(AT)8p2296662968116Design Primer
71NC_018056(ATTA)6ttttttaaataatataattcta(TATT)3c301183017558Design Primer
72NC_018056(TAT)4p3302883029912Design Primer
73NC_018056(AAAAT)7ggttacaaacatagattaactgtataatatttatacaggtacttatttatatttaattacctcggcag(AATAA)5aatattatattacacagatttaattaactgtgtttaattgtgctgctttactttatcgggaatattta(ATT)6tattatatta(ATATT)3c3063230870239Design Primer
74NC_018056(ATATT)3p5310013101515Design Primer
75NC_018056(TTATA)5tatcttaataaaataataataaatatagcttaattttataatatttatagccaccgccccccccttatgggggggggcgggaggcctagaagaatat(TTA)4c3115431287134Design Primer
76NC_018056(TA)8p2314013141616Design Primer
77NC_018056(TAT)5taatattatataatattatatataatattatttatttaccccgccggtcacaaacacagattaactgtgtaatatttgtgccggcggg(TATT)3atttttaata(ATT)4c3167331809137Design Primer
78NC_018056(ATATA)3catatattatataaatctaaaatatctaat(ATA)5c321063216560Design Primer
79NC_018056(TTTATA)6p6323593239436Design Primer
80NC_018056(ATTTT)3gccggggttattaataaaaaaattaataaattaactcttcaaaataaaataataataaattattgttatattaaatattctataaactcctttttttta(T)11attaaaataaaaataataaaaataaaatatatctacataaataataaataaaaaagccccccatccattaataatggatggggggggtccggagagg(TA)6(ATATA)3*c*3270132944244Design Primer
81NC_018056(TAAA)3attagaccttatcgtctaatggttacgacatcatctcttcatgttgaaaataccggttcgattccggttaaggttaaaatagt(A)10c3312133225105Design Primer
82NC_018056(ATTT)3p4335633357412Design Primer
83NC_018056(AT)6p2337563376712Design Primer
84NC_018056(A)10p1342023421110Design Primer
85NC_018056(T)12p1353333534412Design Primer
86NC_018056(A)10taattaagatcgtcggttaaataaataatcgcgacagactagtccactaatgggtatctgaaatgatgcttaatgtatagtcgaa(AT)9c3549635608113Design Primer
87NC_018056(ATA)4ttaatattcctcaaaattattaattaatatatttattttataatatcttttttt(TATAA)4(TATT)4c3675936860102Design Primer
88NC_018056(ATTTT)3p5370463706015Design Primer
89NC_018056(TAATA)4taatctttaggtttatttgtttaattaaagaggttttttataattattatatatataaataat(AATA)3c380003809495Design Primer
90NC_018056(AATA)3p4383123832312Design Primer
91NC_018056(TA)6tt(ATAA)3(AAATA)6*c*384493849850Design Primer
92NC_018056(AATA)3(AAT)5*c*388003882223Design Primer
93NC_018056(AT)6aataa(TTAT)3c392243925229Design Primer
94NC_018056(TATT)4p4393773939216Design Primer
95NC_018056(TATT)6tatatatata(AAT)5(AT)7*aaattataaaataataataaaaaaaatataaataaaaaagatctttctttga(T)11atattaatagactgagagatttatttttatagattaatttactataatatttattatatataaatataataaaattatgtaatataatatttgtaat(TATTA)4c*3949739737241Design Primer
96NC_018056(TA)6p2399944000512Design Primer
97NC_018056(TA)8(TAT)6*atatataggaaagtcataaatatataa(ATTAT)4tatataaaaaat(ATAA)3atataat(ATATA)3c*4021940343125Design Primer
98NC_018056(ATTA)5p4404964051520Design Primer
99NC_018056(AAAT)3p4406434065412Design Primer
100NC_018056(AATAT)3atataattacagatagaagccaaagggtcaggcgctttctttgggagaaag(AGTT)3c407564083378Design Primer
101NC_018056(T)12p1410824109312Design Primer
102NC_018056(AT)11aatatataataaataataatat(ATA)4c413584141356Design Primer
103NC_018056(ATA)4tttaaatatttaagtatataataataaagttatatatttaataaagtgata(TATT)3taaatataattttaataaattatgaataaatg(AATA)3aattttaatagtacctgaagagttaatataatatttctaattattttatttaactagtataataaatataataaataattatattttaataatatatat(ATTA)6ataaatatataaaaacccgatggtcacaa(ATATT)3acatagctttaatcagctatatttatgctactttactttatagggaggataaatgaataaataaaaaataataaataataa(AT)7aatatataaaaaaataaaaatatataa(AT)7aata(AAT)5atataaataatataataaattttccacttatatatataataaatggagccgaaa(AT)6c4153242038507Design Primer
104NC_018056(ATATAA)3aaaagtatgtttattatat(A)10tcaataaatatataataataaaaaatatagtataaaataataattaaaaaatatatataaaaaaaggtatataaaaaaaatga(AT)8c4218542330146Design Primer
105NC_018056(TAA)4p3426234263412Design Primer
106NC_018056(AAAT)3p4435984360912Design Primer
107NC_018056(AAAT)4p4438444385916Design Primer
108NC_018056(ATA)4p3447984480912Design Primer
109NC_018056(TAA)4p3449344494512Design Primer
110NC_018056(ATAA)3p4455724558312Design Primer
111NC_018056(TTA)4p3459714598212Design Primer
112NC_018056(ATA)5attatt(ATA)4c461454617733Design Primer
113NC_018056(TAA)4p3468914690212Design Primer
114NC_018056(AAAT)4aattaatttattaattaatttttattatattactattag(ATTACT)3attagattactattactattatatttatatttattatatatttcaaattatattttaatatatatataatt(TA)6atattt(ATAA)3tta(TATAT)4(TAT)4*aaattagccactgtccccttttaaaggatagtggtagacccttaggaataaaagaaataattctat(ATAA)3taattc(TAT)5c*4714547449305Design Primer
115NC_018056(AATT)3aaatgaaaaaaatatatatatttatatttattatattaattatattataacaaattagcggtcac(ATT)6c475594765395Design Primer
116NC_018056(TA)6p2478044781512Design Primer
117NC_018056(ATTA)3tataaataaaaccctttcatttattaataaaataaatggaaaggaagatttaaattatcttcttagtaaatacaaatacaaatat(AAATAC)5aacttt(AATAA)4c4792948081153Design Primer
118NC_018056(ATTA)3atgtacagtcggcgtctcaatatat(ATATA)3c483674841852Design Primer
119NC_018056(TTTA)3attatttttttattttatttatatatatattaaaatttatttttttatatttatatttaatttattaatttttttatataaataatta(T)10atattctttttttc(AT)6tctttattta(TAT)4tttatatttattattaatatttattatataatattattattaatatttagtagcctaaacattacatagctttaatcagccccca(C)11c4943549688254Design Primer
120NC_018056(AATT)3atattatttatttttataataa(T)12c498804992546Design Primer
121NC_018056(TTAA)5tattattaattaaataataaaaatctacataaatattatat(AGTTA)5c501485023386Design Primer
122NC_018056(ATA)5aatat(TAATA)3atcaatataatataaataaaagaaagatatttattctttttttttcatataatagtcc(AT)11gtttaatgttcccggcggtcacatttaaacacagctttaatcagctgtg(TAATA)3tttgtgactattttaccgggtttatattattaattatatatatttttgtttatttaaatataaataatgat(TA)6ttttttttatttgtaataaattatatattttaa(AT)7aaataaaaacataataatataaataaaaacttag(TAATA)6c5034950721373Design Primer
123NC_018056(TAAT)5(ATT)4*c*509805100930Design Primer
124NC_018056(TTTAA)3ttaactg(TATAA)4tatttggactactcacaaatatattat(TTA)6ttgtatattctatatatattattttattatttttcgagttctccccccccaacccttaaagggtt(G)10c5123051391162Design Primer