ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Phoenix dactylifera mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_016740(T)10p17319732810Design Primer
2NC_016740(T)10p18690869910Design Primer
3NC_016740(ATT)4p3192011921212Design Primer
4NC_016740(TGAC)3p4214842149512Design Primer
5NC_016740(TTAT)3p4256252563612Design Primer
6NC_016740(TCTT)3p4289612897212Design Primer
7NC_016740(ATTC)3p4307523076312Design Primer
8NC_016740(CTCTA)3p5360063602015Design Primer
9NC_016740(CTTG)3p4391053911612Design Primer
10NC_016740(GCTT)3p4498804989112Design Primer
11NC_016740(AT)6aaaaaaaata(AT)6c557185575134Design Primer
12NC_016740(A)10p1587995880810Design Primer
13NC_016740(CTTT)3p4620566206712Design Primer
14NC_016740(AGG)4p3642496426012Design Primer
15NC_016740(CTTT)3p4658336584412Design Primer
16NC_016740(TTTTA)3p5667326674615Design Primer
17NC_016740(TAG)4p3674946750512Design Primer
18NC_016740(TACT)3p4678596787012Design Primer
19NC_016740(AGC)4p3760047601512Design Primer
20NC_016740(TA)9p2765287654518Design Primer
21NC_016740(GA)6p2877348774512Design Primer
22NC_016740(T)11p1911369114611Design Primer
23NC_016740(TTAG)3p4988459885612Design Primer
24NC_016740(T)10p110037210038110Design Primer
25NC_016740(T)13p110363210364413Design Primer
26NC_016740(TCA)5p310568410569815Design Primer
27NC_016740(ATTCTA)3p611036911038618Design Primer
28NC_016740(T)10p111388711389610Design Primer
29NC_016740(TTCA)3p411899611900712Design Primer
30NC_016740(CTT)4p312999413000512Design Primer
31NC_016740(T)12p113211813212912Design Primer
32NC_016740(TATC)3p413331713332812Design Primer
33NC_016740(CCGG)3p413368513369612Design Primer
34NC_016740(AGA)4p314466314467412Design Primer
35NC_016740(GGTC)3p414628014629112Design Primer
36NC_016740(CAGT)3gccctcgattgttccagatagaaggatcatggcgccccggaaccatgacatc(CAG)4c14683114690676Design Primer
37NC_016740(A)10p114884614885510Design Primer
38NC_016740(T)11p115061215062211Design Primer
39NC_016740(AGG)4p315279915281012Design Primer
40NC_016740(AATG)3p416136616137712Design Primer
41NC_016740(CGTA)3p416862616863712Design Primer
42NC_016740(ATACC)3p517173217174615Design Primer
43NC_016740(GAG)5p317693317694715Design Primer
44NC_016740(AAT)5p317894817896215Design Primer
45NC_016740(TTC)4p318380518381612Design Primer
46NC_016740(ATAA)3aaaaagaaaaatga(AAAT)3aaggaagtacgtcgattctgtttgaaacaaagaca(GCAG)3c18669118677585Design Primer
47NC_016740(GAG)4p318789018790112Design Primer
48NC_016740(T)10p119172019172910Design Primer
49NC_016740(A)11p119898919899911Design Primer
50NC_016740(A)10p121506721507610Design Primer
51NC_016740(TTTC)3p422159922161012Design Primer
52NC_016740(GAA)4p322530722531812Design Primer
53NC_016740(CTA)4p322976122977212Design Primer
54NC_016740(ACT)4p322987822988912Design Primer
55NC_016740(CATT)3p423641223642312Design Primer
56NC_016740(GAAG)3p423703123704212Design Primer
57NC_016740(T)10p123860123861010Design Primer
58NC_016740(T)10p124247824248710Design Primer
59NC_016740(T)10p124297224298110Design Primer
60NC_016740(GTT)4p324722524723612Design Primer
61NC_016740(AAAAG)3p524919024920415Design Primer
62NC_016740(GAAT)3p428435028436112Design Primer
63NC_016740(TGGG)3p428885228886312Design Primer
64NC_016740(TA)6tttatttatttttatttatatttttatattataaatatagt(TA)7c29425829432467Design Primer
65NC_016740(TC)6p229706929708012Design Primer
66NC_016740(T)10p130123430124310Design Primer
67NC_016740(A)10p130463430464310Design Primer
68NC_016740(A)10p130513430514310Design Primer
69NC_016740(T)11p130674430675411Design Primer
70NC_016740(TA)8p231031231032716Design Primer
71NC_016740(TTCC)3p431100931102012Design Primer
72NC_016740(TTGC)3p431408531409612Design Primer
73NC_016740(GAA)4p331670831671912Design Primer
74NC_016740(A)10p131834631835510Design Primer
75NC_016740(AGCA)3p432649132650212Design Primer
76NC_016740(T)10p133499633500510Design Primer
77NC_016740(TCGG)3p433675033676112Design Primer
78NC_016740(GAA)4p334455434456512Design Primer
79NC_016740(A)11p134650434651411Design Primer
80NC_016740(T)10p134678034678910Design Primer
81NC_016740(AT)7(TAAGT)3*c*34911034913728Design Primer
82NC_016740(TGT)4p335944335945412Design Primer
83NC_016740(GCAA)3p436019236020312Design Primer
84NC_016740(TAGC)3p436149036150112Design Primer
85NC_016740(TAACC)3p536644436645815Design Primer
86NC_016740(ACCT)3gttttcagtggcaagatcaatcaaacaaaataggctcaagagaagaacctgtt(TTC)5c36689836697780Design Primer
87NC_016740(CTATA)3p536728836730215Design Primer
88NC_016740(AGT)4p336961936963012Design Primer
89NC_016740(GAAA)3p438208538209612Design Primer
90NC_016740(TTAT)4t(AATA)4c38946138949333Design Primer
91NC_016740(ACT)4p339172239173312Design Primer
92NC_016740(GAAT)3p439289839290912Design Primer
93NC_016740(CTA)5p340063040064415Design Primer
94NC_016740(CTA)4p340319740320812Design Primer
95NC_016740(TTA)8atattaatc(TAA)5c40355140359848Design Primer
96NC_016740(TTCA)3p440375040376112Design Primer
97NC_016740(AGTT)3p440390040391112Design Primer
98NC_016740(TTA)4p340454040455112Design Primer
99NC_016740(CATT)3p440618140619212Design Primer
100NC_016740(CAAG)3p440685840686912Design Primer
101NC_016740(AAAG)3p441175241176312Design Primer
102NC_016740(T)10p141422541423410Design Primer
103NC_016740(T)10ccactttttttcttcaaatcaaaaaattccta(T)10acgtaggtcgtcgattcggcattgg(A)11c43261143269888Design Primer
104NC_016740(T)10p143333443334310Design Primer
105NC_016740(A)10p144053644054510Design Primer
106NC_016740(TATT)3p444161544162612Design Primer
107NC_016740(TA)8p244381244382716Design Primer
108NC_016740(A)10p144454944455810Design Primer
109NC_016740(GAGC)3p444484844485912Design Primer
110NC_016740(T)11p144595744596711Design Primer
111NC_016740(TATT)5tatatttatatat(ATAA)3c45337245341645Design Primer
112NC_016740(TTTCA)3p545581845583215Design Primer
113NC_016740(A)10p145628945629810Design Primer
114NC_016740(T)10p145787745788610Design Primer
115NC_016740(T)10p146371046371910Design Primer
116NC_016740(TCCCCT)3p647035747037418Design Primer
117NC_016740(CCCTT)3p547316947318315Design Primer
118NC_016740(T)11p147887447888411Design Primer
119NC_016740(AT)8p247936447937916Design Primer
120NC_016740(A)11p147960047961011Design Primer
121NC_016740(T)10p147980247981110Design Primer
122NC_016740(C)10(T)11c48078848080821Design Primer
123NC_016740(TATC)3p448205848206912Design Primer
124NC_016740(CGGC)3p448376048377112Design Primer
125NC_016740(GCCT)3p448591848592912Design Primer
126NC_016740(A)10p149293449294310Design Primer
127NC_016740(A)11p150250250251211Design Primer
128NC_016740(AGAGAA)3p651241451243118Design Primer
129NC_016740(CAAG)3p451607151608212Design Primer
130NC_016740(A)10p152036452037310Design Primer
131NC_016740(ACAA)3p452100152101212Design Primer
132NC_016740(A)10p153183853184710Design Primer
133NC_016740(T)10p154204854205710Design Primer
134NC_016740(TTCC)3p454492354493412Design Primer
135NC_016740(A)10p154991454992310Design Primer
136NC_016740(T)10p155054455055310Design Primer
137NC_016740(CTCA)3p455266555267612Design Primer
138NC_016740(TCAT)3p455306555307612Design Primer
139NC_016740(AAGA)3p455858155859212Design Primer
140NC_016740(AATG)3p456095056096112Design Primer
141NC_016740(CTAT)3p456240856241912Design Primer
142NC_016740(T)11p156750156751111Design Primer
143NC_016740(CGTT)3p456963856964912Design Primer
144NC_016740(T)10p157719757720610Design Primer
145NC_016740(T)10p157901257902110Design Primer
146NC_016740(TCAT)3p457985557986612Design Primer
147NC_016740(AGAT)3p458403158404212Design Primer
148NC_016740(AAG)4p359239259240312Design Primer
149NC_016740(AAGG)3ctagctgtcctatcagtgcggacaagccagtctgcccat(GCAA)3c59332759338963Design Primer
150NC_016740(A)10tgaaaaaaacaaaatagactttatatataaaaaaagaaatggaaatgcaggagactcttcttcccttttccctcctccccttccttcgct(C)10c594696594805110Design Primer
151NC_016740(ATAG)3p460335060336112Design Primer
152NC_016740(TTTC)3p460825860826912Design Primer
153NC_016740(TTG)5p361144061145415Design Primer
154NC_016740(TC)6p261752261753312Design Primer
155NC_016740(A)10p162760962761810Design Primer
156NC_016740(GCTA)3p463039663040712Design Primer
157NC_016740(T)11p163184063185011Design Primer
158NC_016740(TTA)4p364065764066812Design Primer
159NC_016740(GAAG)3p464079164080212Design Primer
160NC_016740(TAT)6p364311864313518Design Primer
161NC_016740(CATC)3p464847964849012Design Primer
162NC_016740(GA)6p265482665483712Design Primer
163NC_016740(TAG)5p365569965571315Design Primer
164NC_016740(T)10p165790965791810Design Primer
165NC_016740(A)13p166570966572113Design Primer
166NC_016740(TTCA)3p467333667334712Design Primer
167NC_016740(A)10p167348267349110Design Primer
168NC_016740(AACA)3p467475067476112Design Primer
169NC_016740(TGCT)3p467536667537712Design Primer
170NC_016740(TCGG)3p467600267601312Design Primer
171NC_016740(TGAT)3p467728267729312Design Primer
172NC_016740(A)10p168887468888310Design Primer
173NC_016740(TAGA)3p469414069415112Design Primer
174NC_016740(AGCG)3p469460369461412Design Primer
175NC_016740(TTA)4p369479769480812Design Primer
176NC_016740(T)10p169737069737910Design Primer
177NC_016740(CTT)4p370012770013812Design Primer
178NC_016740(T)10p170131170132010Design Primer
179NC_016740(AGTC)3p470615670616712Design Primer
180NC_016740(ATTG)3p470719970721012Design Primer
181NC_016740(GGAA)3p470824370825412Design Primer
182NC_016740(AAAG)3p471003671004712Design Primer
183NC_016740(T)10p171159171160010Design Primer
184NC_016740(AT)7agggtaagggtatataata(AT)6c71196471200845Design Primer
185NC_016740(AACT)3p471315971317012Design Primer