ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Dunaliella salina chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_016732(A)11p11692170211Design Primer
2NC_016732(GTTT)3p48105811612Design Primer
3NC_016732(T)12p1113831139412Design Primer
4NC_016732(T)15p1115061152015Design Primer
5NC_016732(A)12p1136691368012Design Primer
6NC_016732(A)10p1156521566110Design Primer
7NC_016732(TA)7p2162181623114Design Primer
8NC_016732(T)13p1169591697113Design Primer
9NC_016732(A)17p1171901720617Design Primer
10NC_016732(A)12p1174301744112Design Primer
11NC_016732(T)15p1176961771015Design Primer
12NC_016732(A)14p1182981831114Design Primer
13NC_016732(T)10p1184561846510Design Primer
14NC_016732(T)13p1186211863313Design Primer
15NC_016732(T)25p1190631908725Design Primer
16NC_016732(GCCC)3p4192351924612Design Primer
17NC_016732(T)14p1271692718214Design Primer
18NC_016732(T)10aattgaaaagaatttattattaatattttcttttatt(TAAA)3c276952775359Design Primer
19NC_016732(AT)7gacccgtgagggcggcccgccaaaattttc(A)11c284732852755Design Primer
20NC_016732(T)11acacaggctttaaatact(A)11c303333037240Design Primer
21NC_016732(T)11p1306163062611Design Primer
22NC_016732(T)15p1308993091315Design Primer
23NC_016732(T)10p1313993140810Design Primer
24NC_016732(T)10p1337313374010Design Primer
25NC_016732(T)11p1343433435311Design Primer
26NC_016732(T)14a(T)13c346513467828Design Primer
27NC_016732(T)15p1352113522515Design Primer
28NC_016732(A)19p1354263544419Design Primer
29NC_016732(TAAATG)10p6370673712660Design Primer
30NC_016732(T)12attttataa(T)17c374803751738Design Primer
31NC_016732(A)11p1377513776111Design Primer
32NC_016732(T)15aattatgatttttgtaggggtttggatgaaa(T)10c380363809156Design Primer
33NC_016732(ATT)4p3386303864112Design Primer
34NC_016732(T)12p1399413995212Design Primer
35NC_016732(T)10p1402394024810Design Primer
36NC_016732(A)10p1438404384910Design Primer
37NC_016732(TTAG)3p4439514396212Design Primer
38NC_016732(T)14p1447624477514Design Primer
39NC_016732(T)16p1454514546616Design Primer
40NC_016732(T)10p1463284633710Design Primer
41NC_016732(ATTT)3p4474984750912Design Primer
42NC_016732(T)11gag(A)14c478324785928Design Primer
43NC_016732(T)14attttttttaaaagaacataaaaatgtatattacatctttaata(T)19agtatagtatttgtaactatctattaatattaatt(AATA)3aaaatttataaaattttactttgctaaaattttttcttttaattatttttagcaagtttattcttctttaacttatttattattataacg(T)13c4878349009227Design Primer
44NC_016732(A)16p1493894940416Design Primer
45NC_016732(A)13p1502565026813Design Primer
46NC_016732(A)19p1504625048019Design Primer
47NC_016732(G)11p1582035821311Design Primer
48NC_016732(T)10atttttatgtacgtatttgtatatacatacaataattaatattaataatgtatattatgcatttaaattattcgtatatatata(T)11c5858758691105Design Primer
49NC_016732(AATA)3p4593625937312Design Primer
50NC_016732(A)12p1615406155112Design Primer
51NC_016732(A)11p1621956220511Design Primer
52NC_016732(TTA)5p3624136242715Design Primer
53NC_016732(G)13p1632876329913Design Primer
54NC_016732(A)12tttataacccgtgagggcaactttataaaatttttttttaccgcttaggctaagacctggttcgtcgt(A)12ttatttcttatt(TTTA)3c6450564620116Design Primer
55NC_016732(TAA)4p3674296744012Design Primer
56NC_016732(T)21aatatctaaaga(T)13aaatttagcctgctacaggaatcgaacccgcaacctttggtttacaaaaccaatactctaccgattgagttaaacaggcttc(A)21tg(A)17c6765867825168Design Primer
57NC_016732(T)13p1682866829813Design Primer
58NC_016732(T)10ctaa(ATTT)3c736147363926Design Primer
59NC_016732(T)10p1738517386010Design Primer
60NC_016732(A)10p1753197532810Design Primer
61NC_016732(A)10p1774987750710Design Primer
62NC_016732(TA)6p2795237953412Design Primer
63NC_016732(A)20tttctttggagccccccctccccgtgagggggctcacgggacaagcttccggt(A)11c811098119284Design Primer
64NC_016732(AT)6p2813088131912Design Primer
65NC_016732(T)10at(A)10tttttcttaagttcaaaaacaa(TTAT)3acaaataaataatatatttgaaacgtttaattat(A)11gaaaatattactttctttctaaaatttatgctagaataaattaaagccataaacac(AT)7c8182381993171Design Primer
66NC_016732(AATA)3p4823518236212Design Primer
67NC_016732(A)13p1831888320013Design Primer
68NC_016732(A)12tttctaaaaagtccgctcgtagagaagaaaattctttaagagaagaaaatttataaaattt(A)11c838738395684Design Primer
69NC_016732(T)17aaggtgagtaggatcttcagagactttatgtttcctaacaaacattagaaataaaaat(A)12c841008418687Design Primer
70NC_016732(A)11p1844868449611Design Primer
71NC_016732(TAA)4p3851048511512Design Primer
72NC_016732(A)14p1865018651414Design Primer
73NC_016732(TTTTTA)3(T)10c878448787128Design Primer
74NC_016732(A)16p1880628807716Design Primer
75NC_016732(T)10p1884758848410Design Primer
76NC_016732(TA)7p2910489106114Design Primer
77NC_016732(T)12p1913779138812Design Primer
78NC_016732(A)13p1917589177013Design Primer
79NC_016732(A)10p1922759228410Design Primer
80NC_016732(T)21p1929199293921Design Primer
81NC_016732(T)14p1935239353614Design Primer
82NC_016732(T)12p1939489395912Design Primer
83NC_016732(GCCC)3gtgagggaaacgtctaaaaaaaaatttccggacaacccgtcccgtga(G)11c943979446670Design Primer
84NC_016732(A)13p1957389575013Design Primer
85NC_016732(A)13p1961849619613Design Primer
86NC_016732(A)11p1972989730811Design Primer
87NC_016732(A)22p1975819760222Design Primer
88NC_016732(T)10p110144510145410Design Primer
89NC_016732(A)12taaatagaaaattccgaaggaatttctcggaagaaattccttcggaattttcttccgaaaaaattatttttctatgttataatag(A)10c102117102223107Design Primer
90NC_016732(A)12p110505210506312Design Primer
91NC_016732(T)11p110600610601611Design Primer
92NC_016732(A)17p110678210679817Design Primer
93NC_016732(AT)7ttgaaatgttttaa(T)12aatc(T)10c10707410712754Design Primer
94NC_016732(TAT)4p310750110751212Design Primer
95NC_016732(T)25p111838911841325Design Primer
96NC_016732(A)11p111863011864011Design Primer
97NC_016732(A)10p111906011906910Design Primer
98NC_016732(T)11p112235312236311Design Primer
99NC_016732(TTC)4gtaggtcacttatggcatgctggtcgtgctcg(TGC)4c12281712287256Design Primer
100NC_016732(A)15cacaaacaaaaatgaaaataattaattttttgttattaaaattcgaatctgatttaaaacattctgctaaattttatttagagatttcataattct(TA)7c123249123373125Design Primer
101NC_016732(T)10p112378712379610Design Primer
102NC_016732(T)13p112712612713813Design Primer
103NC_016732(A)10taagggtacttataagaataaaaacgaaaaagatgagaattgacaaacgaaacaattctgataaattaagaagcaagggaatgttc(A)14c127892128001110Design Primer
104NC_016732(A)10p112842712843610Design Primer
105NC_016732(A)12p112920012921112Design Primer
106NC_016732(AAT)4p313001213002312Design Primer
107NC_016732(TTTTTA)7p613142113146242Design Primer
108NC_016732(A)11p113690813691811Design Primer
109NC_016732(ATATGA)3p614156614158318Design Primer
110NC_016732(A)11p114173314174311Design Primer
111NC_016732(T)11p114614314615311Design Primer
112NC_016732(A)15p114636414637815Design Primer
113NC_016732(T)11cggcgggtctgttttctttgagaaaaatccgcccgtgaggaaaacgtct(A)10c14653414660370Design Primer
114NC_016732(A)14(TA)6c14697914700426Design Primer
115NC_016732(A)10gatagttattc(T)10gctttttttgacatacgatgtccattactagatagatactaaatttatatctagt(A)12c14723114732898Design Primer
116NC_016732(A)10p114745714746610Design Primer
117NC_016732(TA)7(AT)7c14798114800828Design Primer
118NC_016732(A)11p114819614820611Design Primer
119NC_016732(A)27p115066915069527Design Primer
120NC_016732(ATAAAT)9p615125815131154Design Primer
121NC_016732(A)17p115180415182017Design Primer
122NC_016732(T)11at(A)12taacttgggaaaattgagat(A)15c15615015620960Design Primer
123NC_016732(T)11p115631315632311Design Primer
124NC_016732(A)10p115774615775510Design Primer
125NC_016732(A)12p115896015897112Design Primer
126NC_016732(A)12p115958715959812Design Primer
127NC_016732(AT)6p216059416060512Design Primer
128NC_016732(A)17p116096416098017Design Primer
129NC_016732(TTAT)4tttca(T)10c16174116177131Design Primer
130NC_016732(A)14ttttgacccgtgaagggaacatatgaaaatattttaagaatattaaaaat(A)14(CA)6c16205316214290Design Primer
131NC_016732(A)14cacacacaaaaatgccacgtcatccatt(A)10c16332516337652Design Primer
132NC_016732(AAAATA)4p616385916388224Design Primer
133NC_016732(T)13p116435916437113Design Primer
134NC_016732(A)11p116462416463411Design Primer
135NC_016732(A)13p116783516784713Design Primer
136NC_016732(T)10p116978816979710Design Primer
137NC_016732(TTTCT)3p517000917002315Design Primer
138NC_016732(A)16ttttaagtcggacccgtgagggaaaccaaagaaaataaaa(T)12c17053017059768Design Primer
139NC_016732(A)13p117095817097013Design Primer
140NC_016732(A)10p117227317228210Design Primer
141NC_016732(T)10p117248317249210Design Primer
142NC_016732(T)16atttagatttatttttattaaaaaaatatctttataaataaattttagcgaagcaaaaac(A)10c17328017336586Design Primer
143NC_016732(T)11p117350417351411Design Primer
144NC_016732(A)11p117645317646311Design Primer
145NC_016732(T)12(A)13t(A)13c18261418265239Design Primer
146NC_016732(T)11p118766018767011Design Primer
147NC_016732(T)12p118801418802512Design Primer
148NC_016732(GCCC)3p418853418854512Design Primer
149NC_016732(TATGTT)14p618973018981384Design Primer
150NC_016732(A)11p119013719014711Design Primer
151NC_016732(T)11p119582719583711Design Primer
152NC_016732(T)12p119652919654012Design Primer
153NC_016732(T)11p119703319704311Design Primer
154NC_016732(T)18p119761119762818Design Primer
155NC_016732(TAT)4p319918219919312Design Primer
156NC_016732(T)11p119977619978611Design Primer
157NC_016732(TA)6p220191120192212Design Primer
158NC_016732(TTATTT)5p620214220217130Design Primer
159NC_016732(T)10p120503020503910Design Primer
160NC_016732(A)14tttttgat(A)11c20579520582733Design Primer
161NC_016732(T)13p121076321077513Design Primer
162NC_016732(TA)8p221345921347416Design Primer
163NC_016732(TTAT)3p421434721435812Design Primer
164NC_016732(A)10p121457421458310Design Primer
165NC_016732(T)10p121797821798710Design Primer
166NC_016732(T)10aattattatttttttaattattattttttttaattattattttttttaatta(T)13aatta(T)23c220356220458103Design Primer
167NC_016732(T)10gagttataaag(T)11c22117922121032Design Primer
168NC_016732(T)13p122136822138013Design Primer
169NC_016732(CGGG)3ccgttttctcaaagaaaacggacccgccgaaaaaaaatt(A)13c22160222166564Design Primer
170NC_016732(T)14ctc(A)11c22536922539628Design Primer
171NC_016732(T)13p122848922850113Design Primer
172NC_016732(TA)8gaatacatatatataaatatataagttatatataatatataagtttaatta(T)10c22896222903877Design Primer
173NC_016732(T)17p122946322947917Design Primer
174NC_016732(TTA)4p323021123022212Design Primer
175NC_016732(T)10(A)22c23092723095832Design Primer
176NC_016732(A)11p123180323181311Design Primer
177NC_016732(A)21tttcttccgaaaataaaattttataaatttactttgttaattttctaaaaaatt(A)15c23245423254390Design Primer
178NC_016732(A)13tgccattcgtaagtaacttgtctgtttttatattaagtttaattttttatgtg(T)10gtataaaaaaagaggaactatgttacaatatt(A)10tatataaaaatttaaaccttttttgtataaattatggaagtgatattactcctcgtattaat(AAATAA)3aagagtttggagatcttttagaagtttagattagaatctt(A)15c232940233192253Design Primer
179NC_016732(AT)6p223347523348612Design Primer
180NC_016732(A)12p123363923365012Design Primer
181NC_016732(TTATG)3tatagaaaat(A)15c23427023430940Design Primer
182NC_016732(AATT)3p423569023570112Design Primer
183NC_016732(A)10p123716123717010Design Primer
184NC_016732(TA)8p223773623775116Design Primer
185NC_016732(T)12agta(T)14(TTAT)3*c*24318624322540Design Primer
186NC_016732(T)14gaaagt(A)10c24356624359530Design Primer
187NC_016732(T)21p124406124408121Design Primer
188NC_016732(AAT)10p324804124807030Design Primer
189NC_016732(T)12p125276125277212Design Primer
190NC_016732(ATATAA)3p625292725294418Design Primer
191NC_016732(A)10p125450125451010Design Primer
192NC_016732(T)11p125464125465111Design Primer
193NC_016732(ATTCAT)3p625479925481618Design Primer
194NC_016732(T)11p125946625947611Design Primer
195NC_016732(AAATAA)7p626491926496042Design Primer
196NC_016732(ATT)4p326636126637212Design Primer
197NC_016732(T)12p126717326718412Design Primer
198NC_016732(T)10p126794826795710Design Primer
199NC_016732(T)14gaacattcccttgcttcttaatttatcagaattgtttcgtttgtcaattctcatctttttcgtttttattcttataagtaccctta(T)10c268383268492110Design Primer