Compound Repeats of Silene noctiflora chloroplast
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S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_016728 | (T)10cttattattgtattatttaaataattctattaactaaataattctattttttat(TTA)4 | c | 28441 | 28516 | 76 | Design Primer |
2 | NC_016728 | (T)11(A)12 | c | 33367 | 33389 | 23 | Design Primer |
3 | NC_016728 | (A)10gaaacgttatagttctaatttaaaattagaattttatttatatccttattatcttttttcttt(TCAG)3 | c | 65290 | 65374 | 85 | Design Primer |
4 | NC_016728 | (ATA)4aaatagaatataattagttagttaatataattctttaaataatag(AAT)4atcatatatattgcatatatgaacatcatattaatatgataataaaattgcaat(A)10 | c | 102013 | 102145 | 133 | Design Primer |
5 | NC_016728 | (A)10cagcttaagcaatgaattggctaatagaattaccgttctaaacaaagaattagacaattattggacttctaacaatgaac(A)10 | c | 103758 | 103857 | 100 | Design Primer |
6 | NC_016728 | (A)11g(A)12tctaaattgagttttttaagaatttggggaaataaaaatctaatag(A)10 | c | 105293 | 105372 | 80 | Design Primer |
7 | NC_016728 | (A)12cattaatggaaagtccaattcgagtacttggattgagagacgaatccattg(A)11gaaaaagatttggct(GAAAAA)3 | c | 105612 | 105718 | 107 | Design Primer |
8 | NC_016728 | (TCTTTT)3tcagccaaatctttttc(T)11caatggattcgtctctcaatccaagtactcgaattggactttccattaatg(T)12 | c | 125395 | 125503 | 109 | Design Primer |
9 | NC_016728 | (T)10ctattagatttttatttccccaaattcttaaaaaactcaatttaga(T)12c(T)11 | c | 125743 | 125822 | 80 | Design Primer |
10 | NC_016728 | (T)10gttcattgttagaagtccaataattgtctaattctttgtttagaacggtaattctattagccaattcattgcttaagctg(T)10 | c | 127258 | 127357 | 100 | Design Primer |
11 | NC_016728 | (T)10attgcaattttattatcatattaatatgatgttcatatatgcaatatatatga(TAT)4tctattatttaaagaattatattaactaactaattatattctatt(TTA)4 | c | 128970 | 129101 | 132 | Design Primer |