Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Silene vulgaris mitochondrion chromosome 1

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_016406(TAAG)3p44161417212Design Primer
2NC_016406(TCTT)3p44506451712Design Primer
3NC_016406(CTTT)3p44950496112Design Primer
4NC_016406(AGGAAT)3p67667768418Design Primer
5NC_016406(AAAAG)7p58324835835Design Primer
6NC_016406(CTTT)3atttaaatgaaattaaaataaatttt(TTAAA)3c117211177353Design Primer
7NC_016406(CTTC)3p4135031351412Design Primer
8NC_016406(C)11p1209102092011Design Primer
9NC_016406(A)10p1211482115710Design Primer
10NC_016406(ATA)4p3217092172012Design Primer
11NC_016406(A)10p1226842269310Design Primer
12NC_016406(TA)6p2236822369312Design Primer
13NC_016406(TTTC)3p4244982450912Design Primer
14NC_016406(TA)6p2280892810012Design Primer
15NC_016406(A)10p1305423055110Design Primer
16NC_016406(CAATA)3p5348233483715Design Primer
17NC_016406(A)12p1367253673612Design Primer
18NC_016406(TCCTA)3p5494284944215Design Primer
19NC_016406(CTTT)3p4505065051712Design Primer
20NC_016406(CTAG)3p4534215343212Design Primer
21NC_016406(ACTG)3p4552525526312Design Primer
22NC_016406(A)12p1558645587512Design Primer
23NC_016406(AGAA)3p4581035811412Design Primer
24NC_016406(ACGA)3p4595075951812Design Primer
25NC_016406(TA)6p2614096142012Design Primer
26NC_016406(A)10p1629696297810Design Primer
27NC_016406(AT)6p2644226443312Design Primer
28NC_016406(TCAGGC)3p6666096662618Design Primer
29NC_016406(AAGA)3p4720367204712Design Primer
30NC_016406(CTATA)3p5730357304915Design Primer
31NC_016406(A)11p1747127472211Design Primer
32NC_016406(TAAAT)3ta(TAT)4c785697859729Design Primer
33NC_016406(T)12p1812388124912Design Primer
34NC_016406(CAAAG)3p5824058241915Design Primer
35NC_016406(CTT)4p3847138472412Design Primer
36NC_016406(CTT)4p3858468585712Design Primer
37NC_016406(GAA)4p3875128752312Design Primer
38NC_016406(AGAAT)4p5880928811120Design Primer
39NC_016406(AAC)4p3890918910212Design Primer
40NC_016406(AAGA)3p4954379544812Design Primer
41NC_016406(CTTC)3p4973469735712Design Primer
42NC_016406(GTA)4p310240510241612Design Primer
43NC_016406(TA)6p210359410360512Design Primer
44NC_016406(TTCT)3p410609610610712Design Primer
45NC_016406(AAGA)3p411270711271812Design Primer
46NC_016406(TTTA)3p411479711480812Design Primer
47NC_016406(CTTAA)3p511766011767415Design Primer
48NC_016406(T)13p112334312335513Design Primer
49NC_016406(TA)6p212396512397612Design Primer
50NC_016406(TTC)4p312784912786012Design Primer
51NC_016406(A)10p112984912985810Design Primer
52NC_016406(TAAAT)3p513377213378615Design Primer
53NC_016406(CGAT)3p413707113708212Design Primer
54NC_016406(A)12p114224014225112Design Primer
55NC_016406(ATTAAA)3p614288114289818Design Primer
56NC_016406(T)13p114841514842713Design Primer
57NC_016406(AGAA)3p414943614944712Design Primer
58NC_016406(TTA)4p315310415311512Design Primer
59NC_016406(AAG)4p315469315470412Design Primer
60NC_016406(TATG)3p415611815612912Design Primer
61NC_016406(TATGA)3p515911515912915Design Primer
62NC_016406(ATTAA)3p516167016168415Design Primer
63NC_016406(A)10p116245416246310Design Primer
64NC_016406(GAAAA)4ggggataaactccttaaagaagaatctttagtaaccttttttttgatgtcacagtctttattctttt(TTA)4c16654516664399Design Primer
65NC_016406(AT)6p217022917024012Design Primer
66NC_016406(GGTT)4p417477117478616Design Primer
67NC_016406(A)10p117726217727110Design Primer
68NC_016406(GAAAA)4ggggataaactccttaaagaagaatctttagtaaccttttttttgatgtcacagtctttattctttt(TTA)4c18135318145199Design Primer
69NC_016406(CAAAG)4p518368918370820Design Primer
70NC_016406(GAAAT)6p519661219664130Design Primer
71NC_016406(TCGT)3p419944219945312Design Primer
72NC_016406(ATTGG)3p519957319958715Design Primer
73NC_016406(CTTT)3p420410220411312Design Primer
74NC_016406(GGCAAA)4p621300021302324Design Primer
75NC_016406(ATATA)3p521455721457115Design Primer
76NC_016406(A)11p121551021552011Design Primer
77NC_016406(A)10p121604121605010Design Primer
78NC_016406(TTTAA)3aaaatttattttaatttcatttaaat(AAAG)3c22048622053853Design Primer
79NC_016406(T)10p122437822438710Design Primer
80NC_016406(T)10p122534422535310Design Primer
81NC_016406(TCCTA)3p522593622595015Design Primer
82NC_016406(TAAGTA)3p622895522897218Design Primer
83NC_016406(AAGGA)3p523240023241415Design Primer
84NC_016406(TTATA)3p524250424251815Design Primer
85NC_016406(TAT)4p324278824279912Design Primer
86NC_016406(A)10p124602424603310Design Primer
87NC_016406(TCCTA)3p524656224657615Design Primer
88NC_016406(TATTA)3p525253725255115Design Primer
89NC_016406(ATA)4p325746325747412Design Primer
90NC_016406(CTTT)3p426232826233912Design Primer
91NC_016406(T)10p126823226824110Design Primer
92NC_016406(A)10p127532927533810Design Primer
93NC_016406(CCGC)3p427548727549812Design Primer
94NC_016406(AGGAT)3p528275628277015Design Primer
95NC_016406(TA)6p228873128874212Design Primer
96NC_016406(A)10p129118429119310Design Primer
97NC_016406(TAGCA)3p529193429194815Design Primer
98NC_016406(GGCC)3p429312329313412Design Primer
99NC_016406(CCCAA)6p529444729447630Design Primer
100NC_016406(AAACTA)3p629501229502918Design Primer
101NC_016406(A)10p129652929653810Design Primer
102NC_016406(AGAA)3p429893229894312Design Primer
103NC_016406(TGCC)3p430351030352112Design Primer
104NC_016406(ATC)4p330697830698912Design Primer
105NC_016406(GA)7p230994930996214Design Primer
106NC_016406(A)10p132388632389510Design Primer
107NC_016406(TA)6p232462832463912Design Primer
108NC_016406(CTA)4p332581632582712Design Primer
109NC_016406(TTAAA)3p532928932930315Design Primer
110NC_016406(ATA)4p333165233166312Design Primer
111NC_016406(ATTTA)3p533414533415915Design Primer
112NC_016406(TAG)4tataggaagggtaatgcaatgatgagtggttctcgactgaccaccctctatctgaacctgaatctgactaagccggtc(TAG)5c336703336807105Design Primer
113NC_016406(AGGT)3p433706533707612Design Primer
114NC_016406(AAG)4p333910633911712Design Primer
115NC_016406(CTTT)3p434278634279712Design Primer
116NC_016406(TAA)4p334338134339212Design Primer
117NC_016406(GTA)4p334812034813112Design Primer
118NC_016406(TA)6p234930934932012Design Primer
119NC_016406(AATT)3cttttttaatattttaattttaaaaaaattctattagtg(A)10c35112335118361Design Primer
120NC_016406(TATTG)10p535551435556350Design Primer
121NC_016406(GAAA)3p436716736717812Design Primer
122NC_016406(T)10p137340137341010Design Primer
123NC_016406(GCC)4p338073638074712Design Primer
124NC_016406(TTTAA)3tatttt(ATA)4c38570838574033Design Primer
125NC_016406(ATA)4p338792038793112Design Primer
126NC_016406(ATA)4p338974238975312Design Primer