ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Spirodela polyrhiza chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_015891(TTAT)3p4667712Design Primer
2NC_015891(C)10p15407541610Design Primer
3NC_015891(A)10p16614662310Design Primer
4NC_015891(AT)7p28031804414Design Primer
5NC_015891(AT)6aaattaaat(A)12c9948998033Design Primer
6NC_015891(TTAA)3aaatattaaaaaatattatatgtatatgattctataaatcatgaatatattatattacgatttttg(TAT)4agtc(TAT)4c1032110426106Design Primer
7NC_015891(T)11p1119271193711Design Primer
8NC_015891(TA)6p2145781458912Design Primer
9NC_015891(T)10p1153751538410Design Primer
10NC_015891(A)10p1160381604710Design Primer
11NC_015891(T)10p1165171652610Design Primer
12NC_015891(TAA)4p3178671787812Design Primer
13NC_015891(A)12p1186141862512Design Primer
14NC_015891(T)11p1208232083311Design Primer
15NC_015891(T)10p1284792848810Design Primer
16NC_015891(TTA)5p3300583007215Design Primer
17NC_015891(T)10ctattataaaagtttttaaatggcataacataaatatatatgaagatacaatcaattgaagaaaataatctcaactagatc(A)10c3031930419101Design Primer
18NC_015891(T)11p1319923200211Design Primer
19NC_015891(TTA)4p3334213343212Design Primer
20NC_015891(A)10p1335903359910Design Primer
21NC_015891(AT)13p2337203374526Design Primer
22NC_015891(T)11p1360973610711Design Primer
23NC_015891(A)14p1366843669714Design Primer
24NC_015891(TAG)4p3373073731812Design Primer
25NC_015891(A)12tagatatatatattttgtatatattttgatttgaaaaa(AT)6c411574121862Design Primer
26NC_015891(T)10p1465144652310Design Primer
27NC_015891(TTTC)3p4480294804012Design Primer
28NC_015891(A)10p1490134902210Design Primer
29NC_015891(TA)7p2516245163714Design Primer
30NC_015891(AT)7p2517425175514Design Primer
31NC_015891(TAT)4p3520355204612Design Primer
32NC_015891(TTAA)3p4563845639512Design Primer
33NC_015891(A)10p1565785658710Design Primer
34NC_015891(TTAT)3p4607736078412Design Primer
35NC_015891(T)10p1665946660310Design Primer
36NC_015891(A)12p1673096732012Design Primer
37NC_015891(AATG)3p4679876799812Design Primer
38NC_015891(A)13p1723487236013Design Primer
39NC_015891(TTC)4p3739187392912Design Primer
40NC_015891(TA)8p2742597427416Design Primer
41NC_015891(T)12p1759527596312Design Primer
42NC_015891(TTA)4p3780417805212Design Primer
43NC_015891(A)11p1784377844711Design Primer
44NC_015891(TA)11p2788177883822Design Primer
45NC_015891(AATA)4p4842548426916Design Primer
46NC_015891(TTTA)3p4871068711712Design Primer
47NC_015891(AAT)4ataaataataaatatatatttattatttaat(ATAA)3tataataaataaaattaaaataatat(TAA)4c10147610156893Design Primer
48NC_015891(GCAAT)3p510706010707415Design Primer
49NC_015891(T)11p110746610747611Design Primer
50NC_015891(AAAAT)3p511526111527515Design Primer
51NC_015891(A)11p111941911942911Design Primer
52NC_015891(GAAT)3p412037512038612Design Primer
53NC_015891(ATAA)3atattctaat(ATAA)3c12303712307034Design Primer
54NC_015891(ATT)4p312391612392712Design Primer
55NC_015891(AATA)3p412886112887212Design Primer
56NC_015891(TTGA)3p413134813135912Design Primer
57NC_015891(T)11p113285113286111Design Primer
58NC_015891(CATT)3p413962413963512Design Primer
59NC_015891(T)11p114058214059211Design Primer
60NC_015891(ATTTT)3p514473614475015Design Primer
61NC_015891(A)11p115253515254511Design Primer
62NC_015891(CATTG)3p515293615295015Design Primer
63NC_015891(TTA)4atattattttaattttatttattata(TTAT)3attaaataataaatatatatttattattta(TAT)4c15844315853492Design Primer