Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Schizomeris leibleinii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_015645(A)10p112713610Design Primer
2NC_015645(T)12p12661267212Design Primer
3NC_015645(T)13p12930294213Design Primer
4NC_015645(A)10p13236324510Design Primer
5NC_015645(T)11p13534354411Design Primer
6NC_015645(T)10ataaaagctaataaaataaaaggtttttaatttattaaa(T)11aaaagtgcttc(T)10ataaaagctaataaaataaaaggtttttaatttattaattttttttaaaagtgcttctatttttcttagaaaaaaagacgc(T)10c37153886172Design Primer
7NC_015645(T)12cttaaaaatatttttcttctgcttttacgttgtttttgttttcaaattttagaag(A)10c166671674377Design Primer
8NC_015645(T)10p1176691767810Design Primer
9NC_015645(GAAA)3p4216282163912Design Primer
10NC_015645(T)10p1231242313310Design Primer
11NC_015645(A)10p1234062341510Design Primer
12NC_015645(GTTTA)5p5239542397825Design Primer
13NC_015645(A)11p1252342524411Design Primer
14NC_015645(A)10p1323283233710Design Primer
15NC_015645(TATT)3p4327973280812Design Primer
16NC_015645(T)11p1330493305911Design Primer
17NC_015645(TAAAA)3p5337053371915Design Primer
18NC_015645(A)10p1342583426710Design Primer
19NC_015645(T)12p1365183652912Design Primer
20NC_015645(T)11p1392993930911Design Primer
21NC_015645(A)10p1403234033210Design Primer
22NC_015645(A)10tgccagc(T)10actattttttaggggaaatttttttataaaaaacttataaaaaacattctattaatttattttagcataagaatctagactta(T)10attgt(ATA)4c4203042166137Design Primer
23NC_015645(T)11p1428054281511Design Primer
24NC_015645(A)14p1468694688214Design Primer
25NC_015645(TTTA)3p4503935040412Design Primer
26NC_015645(TAA)4p3511365114712Design Primer
27NC_015645(T)11p1513045131411Design Primer
28NC_015645(T)10p1521395214810Design Primer
29NC_015645(A)10p1545315454010Design Primer
30NC_015645(ATT)6p3558965591318Design Primer
31NC_015645(AT)7p2561845619714Design Primer
32NC_015645(A)10p1568475685610Design Primer
33NC_015645(ATTT)3p4638006381112Design Primer
34NC_015645(T)11agaaaaagaatttttgaatagaaaaatatttatttttcttcaataattgtaaaaattaaaaattaaataatatttttttaataaaac(T)10c6754667653108Design Primer
35NC_015645(T)10p1680196802810Design Primer
36NC_015645(A)11p1681736818311Design Primer
37NC_015645(AAT)4p3697506976112Design Primer
38NC_015645(T)11p1715177152711Design Primer
39NC_015645(T)10p1723817239010Design Primer
40NC_015645(A)12p1728987290912Design Primer
41NC_015645(AAG)4p3788127882312Design Primer
42NC_015645(T)12p1801108012112Design Primer
43NC_015645(T)10p1802918030010Design Primer
44NC_015645(ACAA)3p4831998321012Design Primer
45NC_015645(T)11aaccgcccttttagggtccaagttatttggaaatgtacattacatagacggtttttagaagttaatatggaaacttctagatttatgc(A)10c8404184149109Design Primer
46NC_015645(A)10p1846068461510Design Primer
47NC_015645(T)10p1859148592310Design Primer
48NC_015645(A)11tatttaaaataaagacaaatggaaatttaatactttattataagtatttggggaaaaataaattaaaaatttc(T)10c862968638994Design Primer
49NC_015645(A)10tgaaatagaaaaagatgttagtctctttttcttatagtgtttttcttttataaaagaaaaaaacacttacgtgta(T)10c881358822995Design Primer
50NC_015645(T)11p1900169002611Design Primer
51NC_015645(A)10p1914619147010Design Primer
52NC_015645(TAT)4p3933689337912Design Primer
53NC_015645(A)10p1991339914210Design Primer
54NC_015645(TTTA)3p4992779928812Design Primer
55NC_015645(A)10ctttag(T)10c10042510045026Design Primer
56NC_015645(A)12p110257710258812Design Primer
57NC_015645(TTA)4p310289610290712Design Primer
58NC_015645(A)10p110311210312110Design Primer
59NC_015645(ATT)4p310340710341812Design Primer
60NC_015645(T)11p110675610676611Design Primer
61NC_015645(T)10p110690310691210Design Primer
62NC_015645(A)10p110835510836410Design Primer
63NC_015645(CAAA)3p411491211492312Design Primer
64NC_015645(TGTTT)3p511810411811815Design Primer
65NC_015645(T)10p111830611831510Design Primer
66NC_015645(TAT)4tactttgctttaatttcgtgttataaacatttagtattattcta(T)11c12009712016367Design Primer
67NC_015645(T)11p112169912170911Design Primer
68NC_015645(A)10p112438212439110Design Primer
69NC_015645(T)12p112701412702512Design Primer
70NC_015645(A)10p113065113066010Design Primer
71NC_015645(T)11p113090813091811Design Primer
72NC_015645(AAC)4p313213613214712Design Primer
73NC_015645(A)10p113428113429010Design Primer
74NC_015645(TAA)4p313614813615912Design Primer
75NC_015645(TAA)4p314154514155612Design Primer
76NC_015645(A)10p114391714392610Design Primer
77NC_015645(TA)7p214468014469314Design Primer
78NC_015645(A)14p114509914511214Design Primer
79NC_015645(T)10p114571614572510Design Primer
80NC_015645(A)10p114814414815310Design Primer
81NC_015645(TTA)4p314850814851912Design Primer
82NC_015645(A)10p114975614976510Design Primer
83NC_015645(A)10p115020015020910Design Primer
84NC_015645(T)10p115042315043210Design Primer
85NC_015645(AAT)4p315096215097312Design Primer
86NC_015645(T)10p115110715111610Design Primer
87NC_015645(AATT)3p415214115215212Design Primer
88NC_015645(ATTG)3p415588715589812Design Primer
89NC_015645(T)11p115789615790611Design Primer
90NC_015645(A)10p115802515803410Design Primer
91NC_015645(A)16p115816715818216Design Primer
92NC_015645(AAAT)3p415979815980912Design Primer
93NC_015645(AATT)4ttatatttgattaaatgctttttttcctatgacaaatgtgtgcctttctcttaataagtgtttttttctaaacaaaaaaccacttagtggt(TAA)5c160152160273122Design Primer
94NC_015645(A)14p116122016123314Design Primer
95NC_015645(T)10aaagtttatatatgtaaatattttaacttttta(T)10c16566116571353Design Primer
96NC_015645(T)10cctcgtataaaaaattttttgattataaaaaaatcagggtatagcgttcagaaaatccagaaaaaacaatttttactttttta(T)10c166171166273103Design Primer
97NC_015645(A)10p117189217190110Design Primer
98NC_015645(T)10p117248417249310Design Primer
99NC_015645(A)14p117308517309814Design Primer
100NC_015645(GAA)4p317351817352912Design Primer
101NC_015645(A)10tactttgttagtataactcattaactaac(A)10c17403217408049Design Primer
102NC_015645(A)11gaaaaaag(TA)6ttactatattgtactttttaaaacaatatacaga(AT)6c17522317529977Design Primer
103NC_015645(T)10p117569817570710Design Primer
104NC_015645(A)10p117644817645710Design Primer
105NC_015645(ACA)4p317757617758712Design Primer
106NC_015645(A)11p117776517777511Design Primer
107NC_015645(A)10p117922317923210Design Primer
108NC_015645(T)10p118026518027410Design Primer
109NC_015645(A)10p118098418099310Design Primer
110NC_015645(T)10p118198318199210Design Primer
111NC_015645(AATT)3p418263318264412Design Primer