ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Thalassiosira oceanica CCMP1005 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_014808(AAAT)3p43621363212Design Primer
2NC_014808(TTTA)3p43897390812Design Primer
3NC_014808(TA)6p25724573512Design Primer
4NC_014808(TTA)4p3198501986112Design Primer
5NC_014808(T)10p1202162022510Design Primer
6NC_014808(AATA)3p4215402155112Design Primer
7NC_014808(TA)6p2255212553212Design Primer
8NC_014808(A)11p1267802679011Design Primer
9NC_014808(TTAT)3p4275912760212Design Primer
10NC_014808(TTTA)3tggagcttattcaggattaggttcatcgttataatgatctaatatgaataaattagttgtaaagtatataaggtaaataaaaaatttatttactt(TA)10aagtaaaattagtaattattttttagaaaaatttttaaattcttcatataaatcatcac(CAT)4c3198732184198Design Primer
11NC_014808(AAAT)3p4412154122612Design Primer
12NC_014808(T)10p1428274283610Design Primer
13NC_014808(TA)7p2441654417814Design Primer
14NC_014808(AATT)3p4446934470412Design Primer
15NC_014808(TA)7p2506525066514Design Primer
16NC_014808(TTAA)3p4522545226512Design Primer
17NC_014808(TTTA)3p4544595447012Design Primer
18NC_014808(ATTT)3p4580435805412Design Primer
19NC_014808(AAGA)3p4587855879612Design Primer
20NC_014808(ATTA)3p4627606277112Design Primer
21NC_014808(AATT)3p4779867799712Design Primer
22NC_014808(ATTG)3p4872518726212Design Primer
23NC_014808(TAT)4p3884318844212Design Primer
24NC_014808(AAT)4p3890808909112Design Primer
25NC_014808(AT)6p2895338954412Design Primer
26NC_014808(TA)7p2967979681014Design Primer
27NC_014808(TA)8p2978249783916Design Primer
28NC_014808(TAAAAA)3p611008711010418Design Primer
29NC_014808(AAAT)3p411333211334312Design Primer
30NC_014808(TA)6p212254412255512Design Primer
31NC_014808(ATT)4p312299812300912Design Primer
32NC_014808(TAA)4p312364512365612Design Primer
33NC_014808(CAAT)3p412482712483812Design Primer
34NC_014808(AATT)3p413409213410312Design Primer