Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Floydiella terrestris chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_014346(A)10p132633510Design Primer
2NC_014346(A)10p11294130310Design Primer
3NC_014346(A)11p11996200611Design Primer
4NC_014346(TCTTTT)3p62704272118Design Primer
5NC_014346(C)10p15886589510Design Primer
6NC_014346(A)10p16215622410Design Primer
7NC_014346(GATG)3p48878888912Design Primer
8NC_014346(CTT)4p39387939812Design Primer
9NC_014346(A)10p1145801458910Design Primer
10NC_014346(T)10p1188531886210Design Primer
11NC_014346(T)10p1214372144610Design Primer
12NC_014346(AAGA)3p4217562176712Design Primer
13NC_014346(A)13p1220252203713Design Primer
14NC_014346(A)10p1277982780710Design Primer
15NC_014346(T)10p1290262903510Design Primer
16NC_014346(T)10p1292352924410Design Primer
17NC_014346(T)10p1312483125710Design Primer
18NC_014346(T)11p1326943270411Design Primer
19NC_014346(CTTT)3p4331283313912Design Primer
20NC_014346(T)10p1335073351610Design Primer
21NC_014346(A)10ggcttttgcccgagctctgctcgggtgtaacccgaacctcgtttttgaaaaagggctccttttc(T)10c347723485584Design Primer
22NC_014346(A)10p1361653617410Design Primer
23NC_014346(A)10p1371533716210Design Primer
24NC_014346(A)11p1374633747311Design Primer
25NC_014346(TCAAAA)5p6388383886730Design Primer
26NC_014346(T)12p1460824609312Design Primer
27NC_014346(A)10p1513545136310Design Primer
28NC_014346(T)11p1521255213511Design Primer
29NC_014346(A)10p1543845439310Design Primer
30NC_014346(T)11attaactttttcctttttaaaaatttttaaaaacgaaaagcctgttttataaaggcctt(A)10c545545463380Design Primer
31NC_014346(A)10p1553825539110Design Primer
32NC_014346(A)10p1565395654810Design Primer
33NC_014346(AAC)5p3581485816215Design Primer
34NC_014346(T)11p1585455855511Design Primer
35NC_014346(T)10p1612766128510Design Primer
36NC_014346(T)11p1619046191411Design Primer
37NC_014346(A)10p1643126432110Design Primer
38NC_014346(AAAG)3p4645746458512Design Primer
39NC_014346(A)10p1653176532610Design Primer
40NC_014346(ATTTTG)4aaaaaagggcccctgctttttaaagagctacgtgagggttttttcatttaaataaagagggctttttaaaaggttgcacccctgcct(A)10c6604366163121Design Primer
41NC_014346(T)10p1673216733010Design Primer
42NC_014346(T)10p1677396774810Design Primer
43NC_014346(AAAG)3p4699456995612Design Primer
44NC_014346(A)10gctccgctttttaaagagggcctataaaattcagaggcctt(A)10c712427130261Design Primer
45NC_014346(T)11cagttttaaaacgttctatttaaagaaactac(TCTTTT)5c717607183273Design Primer
46NC_014346(T)10p1751007510910Design Primer
47NC_014346(AAAGAA)3aaagagctccgcccttcttttttacagaaaaaggttcgggcctctgcct(A)10c752577533377Design Primer
48NC_014346(A)11p1772097721911Design Primer
49NC_014346(AAAGAA)4p6808288085124Design Primer
50NC_014346(CTTTTT)4p6818298185224Design Primer
51NC_014346(GAATTT)3p6836708368718Design Primer
52NC_014346(T)11p1856588566811Design Primer
53NC_014346(T)13p1859608597213Design Primer
54NC_014346(TCAAAA)11p6864978656266Design Primer
55NC_014346(T)10p1883028831110Design Primer
56NC_014346(A)10p1921369214510Design Primer
57NC_014346(A)10p1950879509610Design Primer
58NC_014346(A)11p1995409955011Design Primer
59NC_014346(AAAAGG)3p610212510214218Design Primer
60NC_014346(A)12p110304710305812Design Primer
61NC_014346(TTTTCT)4tttaaaaaggctatcttcttttttttc(T)10c10426710432761Design Primer
62NC_014346(TCAAAA)5p610940210943130Design Primer
63NC_014346(T)11p111025711026711Design Primer
64NC_014346(A)10p111151011151910Design Primer
65NC_014346(TCTTTT)4p611378311380624Design Primer
66NC_014346(A)10p111555511556410Design Primer
67NC_014346(CAAAAA)3p612072912074618Design Primer
68NC_014346(A)10p112131512132410Design Primer
69NC_014346(AAG)4p312539812540912Design Primer
70NC_014346(A)10p112735112736010Design Primer
71NC_014346(TCAAAA)9p613127213132554Design Primer
72NC_014346(A)11p113283813284811Design Primer
73NC_014346(A)10p113319213320110Design Primer
74NC_014346(T)10p113748813749710Design Primer
75NC_014346(A)10p113825213826110Design Primer
76NC_014346(A)10p114889614890510Design Primer
77NC_014346(T)10p115153815154710Design Primer
78NC_014346(A)11p115188715189711Design Primer
79NC_014346(T)11p115722415723411Design Primer
80NC_014346(A)15p115744415745815Design Primer
81NC_014346(A)10p115838515839410Design Primer
82NC_014346(AAAAAG)4p616200416202724Design Primer
83NC_014346(T)12p116318916320012Design Primer
84NC_014346(T)10p116437016437910Design Primer
85NC_014346(T)10p116452216453110Design Primer
86NC_014346(T)11p116468116469111Design Primer
87NC_014346(T)10p116485616486510Design Primer
88NC_014346(CCTCTT)3(CTTTTT)3c16759716763236Design Primer
89NC_014346(A)10p116964616965510Design Primer
90NC_014346(A)11p117038417039411Design Primer
91NC_014346(A)10gaaattttgcttt(A)12c17166017169435Design Primer
92NC_014346(A)10p117816517817410Design Primer
93NC_014346(T)10p117839217840110Design Primer
94NC_014346(T)10p118117118118010Design Primer
95NC_014346(TTAA)3p418309518310612Design Primer
96NC_014346(AAAAGA)3p618675918677618Design Primer
97NC_014346(A)10p119227319228210Design Primer
98NC_014346(T)11p119394419395411Design Primer
99NC_014346(TCTTTT)3p619547119548818Design Primer
100NC_014346(T)10p119682119683010Design Primer
101NC_014346(T)10p119790719791610Design Primer
102NC_014346(T)10p120001620002510Design Primer
103NC_014346(TAGAA)3p520023420024815Design Primer
104NC_014346(A)10p120079520080410Design Primer
105NC_014346(T)10p120271420272310Design Primer
106NC_014346(TCAAAA)3p620369920371618Design Primer
107NC_014346(A)10p120410720411610Design Primer
108NC_014346(A)10p120424220425110Design Primer
109NC_014346(A)10p120442720443610Design Primer
110NC_014346(A)10p120551520552410Design Primer
111NC_014346(A)10p120662720663610Design Primer
112NC_014346(T)10p121069021069910Design Primer
113NC_014346(T)10p121153421154310Design Primer
114NC_014346(A)11gaaaaagggtgcgactcgaacctttttctgtaaaaaagaagggcggagctctttttctttttc(CTTTT)3tctttaaaaaggcctctgaatttaataggcccttaatctttttgggcggaactttttaataagggcttcattcattttaagggcctcgcc(A)11c211689211878190Design Primer
115NC_014346(T)10p121374621375510Design Primer
116NC_014346(T)12p121549321550412Design Primer
117NC_014346(TCAAAA)3p622010422012118Design Primer
118NC_014346(T)10p122159422160310Design Primer
119NC_014346(TCAAAA)3p622814422816118Design Primer
120NC_014346(AAAG)3p422866122867212Design Primer
121NC_014346(A)10p123625223626110Design Primer
122NC_014346(A)10p123911623912510Design Primer
123NC_014346(A)11p124007224008211Design Primer
124NC_014346(T)10p124176324177210Design Primer
125NC_014346(A)10p124346724347610Design Primer
126NC_014346(AG)6p224383124384212Design Primer
127NC_014346(A)10gtctttaaaaacgggcttttctttttttaagaaaaagagttt(A)10cattccaaacggtgagagaaatcttcttttttcaaaaacaaggaaaaccctttaaaaaccggtttttcttttttagagattttgaaaaac(A)10c246224246385162Design Primer
128NC_014346(T)10p124993024993910Design Primer
129NC_014346(TTCT)3p425314725315812Design Primer
130NC_014346(TTCA)3p425499625500712Design Primer
131NC_014346(TTTC)3p425714425715512Design Primer
132NC_014346(AAAG)3p425923725924812Design Primer
133NC_014346(CAA)4p326296826297912Design Primer
134NC_014346(A)10gaggatattttgaaaaaaatga(T)10c26519626523742Design Primer
135NC_014346(A)10gcatttttagaaatccttttgaatgaaaagaaaatgtttctaaaagaaaaaaca(T)10c26736526743874Design Primer
136NC_014346(T)16p126947626949116Design Primer
137NC_014346(T)11p126990826991811Design Primer
138NC_014346(T)10p127016027016910Design Primer
139NC_014346(A)10p127171027171910Design Primer
140NC_014346(A)11ctcactctagaaaccaaaattagcccttctttaaacagagggggcca(T)10c27244127250868Design Primer
141NC_014346(T)10p127274427275310Design Primer
142NC_014346(A)10tagaatttcataaagaggctataaaacgcttttcgtaaaggggctaaaaacttggcttttgcaaaagccaaaaaagaagcttaagcttg(T)14c276558276670113Design Primer
143NC_014346(A)16p127743727745216Design Primer
144NC_014346(A)10p127895027895910Design Primer
145NC_014346(A)10p127944927945810Design Primer
146NC_014346(A)10p128044328045210Design Primer
147NC_014346(A)11p128165828166811Design Primer
148NC_014346(A)11p128194428195411Design Primer
149NC_014346(A)10p128270728271610Design Primer
150NC_014346(T)14agaggaaaaacgaaaccatcccttgaatttaaaagaaaagtcattttaagacattc(CATT)3c29039029047182Design Primer
151NC_014346(AAAG)3p429866029867112Design Primer
152NC_014346(A)10p130210030210910Design Primer
153NC_014346(T)11caaaatgtcctttttttggctctttttaaaaaaggaaaaagagggacttaaaaaagtttttttattt(A)10c30277630286388Design Primer
154NC_014346(TTTTGA)5p630446830449730Design Primer
155NC_014346(CTTT)3p430514030515112Design Primer
156NC_014346(T)13p130791530792713Design Primer
157NC_014346(A)11p130804630805611Design Primer
158NC_014346(T)10p130880630881510Design Primer
159NC_014346(A)10p131257231258110Design Primer
160NC_014346(T)10p131315731316610Design Primer
161NC_014346(TTTTCT)5p631374131377030Design Primer
162NC_014346(T)10p131441731442610Design Primer
163NC_014346(A)11p131664531665511Design Primer
164NC_014346(T)11p131675931676911Design Primer
165NC_014346(A)10p131741231742110Design Primer
166NC_014346(TTTTGA)3p632015732017418Design Primer
167NC_014346(TTTTGA)5p632048032050930Design Primer
168NC_014346(A)10p132103432104310Design Primer
169NC_014346(T)10p132166532167410Design Primer
170NC_014346(A)10p132262632263510Design Primer
171NC_014346(A)10gattttaagcagtgtttttagcaaataatagaattttttgaattttttttaagtgcaaccctttaaaaagccctcttttaaaaggaaaaga(AAAAGG)4c322846322970125Design Primer
172NC_014346(T)10p132321432322310Design Primer
173NC_014346(A)10cgttctctcttttttctttttat(A)10tggctttaaacgg(A)14c32650532657470Design Primer
174NC_014346(GCC)4p332680732681812Design Primer
175NC_014346(CAAAAA)4p633076333078624Design Primer
176NC_014346(TTCTT)3p533203133204515Design Primer
177NC_014346(A)10gaaaaagagctccacc(A)10c33280633284136Design Primer
178NC_014346(T)11p133369633370611Design Primer
179NC_014346(A)11p133523833524811Design Primer
180NC_014346(T)10p133575833576710Design Primer
181NC_014346(GGTTCG)4p633630533632824Design Primer
182NC_014346(A)10p133759133760010Design Primer
183NC_014346(T)10p133793833794710Design Primer
184NC_014346(C)10p133813533814410Design Primer
185NC_014346(CTTT)5p433831133833020Design Primer
186NC_014346(A)13p134279534280713Design Primer
187NC_014346(TTTTTG)5p634473234476130Design Primer
188NC_014346(T)10p134626634627510Design Primer
189NC_014346(A)11p134663534664511Design Primer
190NC_014346(AAAG)4p434712434713916Design Primer
191NC_014346(AAGAG)3p535112235113615Design Primer
192NC_014346(T)11atttcaaaaaagagcccataaaaattc(T)11c35773735778549Design Primer
193NC_014346(TCTTTT)3tttttaaaggcctcttaattctataggctctctttaaaaagcggagctctttataaagggcaatggcccttattctgtaaaaaagaagggcggagc(TCTTTT)4tctttaaaaaggcctcttaaattttatgagctcttctcttattaaaaggagggtttggctttttagaaagggtcttactctttctt(A)10c359921360154234Design Primer
194NC_014346(TCTT)3p436195736196812Design Primer
195NC_014346(TTTTGA)4p636253136255424Design Primer
196NC_014346(T)10p136330836331710Design Primer
197NC_014346(A)10p136558736559610Design Primer
198NC_014346(GAAAAG)8aaaaagaaaaaggaaaaa(GAAAAG)5c36604236613796Design Primer
199NC_014346(T)11p136828036829011Design Primer
200NC_014346(T)10p136854136855010Design Primer
201NC_014346(AAAG)3p436965536966612Design Primer
202NC_014346(AAG)4p336977336978412Design Primer
203NC_014346(T)10p137101937102810Design Primer
204NC_014346(T)11p137117637118611Design Primer
205NC_014346(T)13p137430237431413Design Primer
206NC_014346(T)11p137474537475511Design Primer
207NC_014346(A)10p138038138039010Design Primer
208NC_014346(T)13p138060638061813Design Primer
209NC_014346(A)11p138247038248011Design Primer
210NC_014346(T)10p138494738495610Design Primer
211NC_014346(CTTT)3p439064139065212Design Primer
212NC_014346(AAAAAG)4p639439439441724Design Primer
213NC_014346(A)10ctttttgaagt(C)10c39648439651431Design Primer
214NC_014346(T)10p139887639888510Design Primer
215NC_014346(T)10p140401640402510Design Primer
216NC_014346(T)10gaattc(A)11c40651440654027Design Primer
217NC_014346(A)13p140829840831013Design Primer
218NC_014346(T)10p140909140910010Design Primer
219NC_014346(T)11p140972340973311Design Primer
220NC_014346(A)10p140998540999410Design Primer
221NC_014346(T)13p141052541053713Design Primer
222NC_014346(T)10p141151841152710Design Primer
223NC_014346(T)10p141256641257510Design Primer
224NC_014346(CTTTT)3p541529041530415Design Primer
225NC_014346(A)10p141609641610510Design Primer
226NC_014346(A)10p141906941907810Design Primer
227NC_014346(T)16p142198442199916Design Primer
228NC_014346(T)10p142217942218810Design Primer
229NC_014346(T)10aaagcagagagggccggaaaaattgaagaggcccgaaccaaaaaaaattagaaggtgagggcccctgctttttaaagaactccg(TTTTGA)5c424152424275124Design Primer
230NC_014346(TCTT)3p443176543177612Design Primer
231NC_014346(TTCA)3p443253443254512Design Primer
232NC_014346(AAAACA)3p643496643498318Design Primer
233NC_014346(A)10p143588143589010Design Primer
234NC_014346(A)10p143786243787110Design Primer
235NC_014346(T)11p143971243972211Design Primer
236NC_014346(T)10p144099444100310Design Primer
237NC_014346(A)17p144239144240717Design Primer
238NC_014346(TCTTTT)5p644610344613230Design Primer
239NC_014346(T)11p144849644850611Design Primer
240NC_014346(A)10p144869244870110Design Primer
241NC_014346(T)10caaaaaaaagagtgaacg(TTTC)3c45229645233540Design Primer
242NC_014346(T)10p145439145440010Design Primer
243NC_014346(A)10p145509845510710Design Primer
244NC_014346(TTTCT)3p545558145559515Design Primer
245NC_014346(AAAAAG)3p646225246226918Design Primer
246NC_014346(T)11p146292346293311Design Primer
247NC_014346(T)11p146328246329211Design Primer
248NC_014346(A)10p146625946626810Design Primer
249NC_014346(A)10p146683046683910Design Primer
250NC_014346(A)10p147012847013710Design Primer
251NC_014346(A)12p147159747160812Design Primer
252NC_014346(AAG)4p347188147189212Design Primer
253NC_014346(A)10p147566347567210Design Primer
254NC_014346(TCTT)3p447828947830012Design Primer
255NC_014346(AGAAAA)4p648282848285124Design Primer
256NC_014346(T)10p148483948484810Design Primer
257NC_014346(T)13p149245449246613Design Primer
258NC_014346(A)11p149290049291011Design Primer
259NC_014346(A)10cttttttaagaaaaaatctttttcaaagtcccctttttttacagaagaaaaaaggatgttttgaaaagctccttt(TC)6c49356449366097Design Primer
260NC_014346(A)10p149390149391010Design Primer
261NC_014346(T)10p149407749408610Design Primer
262NC_014346(A)10p149482649483510Design Primer
263NC_014346(T)10p149658549659410Design Primer
264NC_014346(A)11p149963849964811Design Primer
265NC_014346(TTTCTT)4p650305850308124Design Primer
266NC_014346(AAAAAG)5p650577450580330Design Primer
267NC_014346(CTTT)3p450747450748512Design Primer
268NC_014346(A)10p151028251029110Design Primer
269NC_014346(T)11p151160451161411Design Primer
270NC_014346(T)10p151729151730010Design Primer
271NC_014346(A)11p151801251802211Design Primer