Compound Compound Repeats of Dekkera bruxellensis mitochondrion
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S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_013147 | (TTTATT)3tatttttatttatttttatttatttttatttttttatt(GATA)3aattgataaatagataaattgatt(GATA)3aattaatagataaattgataaatagataaatt(GATA)3 | c | 3700 | 3847 | 148 | Design Primer |
2 | NC_013147 | (TTAT)3atcgtattctattgatgaggttgttaatcactaccctctctttat(TTCTC)3 | c | 5076 | 5147 | 72 | Design Primer |
3 | NC_013147 | (AT)6ctttatttaaagaataattaatgaaagattattaaagattattattatattgaatacttaatgg(TTAT)3 | c | 5769 | 5856 | 88 | Design Primer |
4 | NC_013147 | (ATA)6atctcttataataataatctctt(ATA)6 | c | 8391 | 8449 | 59 | Design Primer |
5 | NC_013147 | (ATA)6atctctt(ATA)4atctcttataataatat(TAA)4tatgaatatgaataataactatatatctatcataattagataatatatttctatataagatacctatat(ATATA)3 | c | 8729 | 8878 | 150 | Design Primer |
6 | NC_013147 | (ATATT)3agattatatttag(ATATT)3ttatattttttagtattattccttattattaaatattaatataattatatattcttttataaatattataatattaacttacttatattctatatta(TTAT)3 | c | 9765 | 9916 | 152 | Design Primer |
7 | NC_013147 | (TTATC)4ttattttatctt(ATCTA)3(ATCTT)6 | c | 10091 | 10167 | 77 | Design Primer |
8 | NC_013147 | (ATA)4ttaaatgtattagatattattaaatataatattaaatgtataaaatataatattaaatgtattaagtataag(ATATA)3 | c | 10393 | 10491 | 99 | Design Primer |
9 | NC_013147 | (TATAT)4tattccatataatata(ATATT)3 | c | 10878 | 10928 | 51 | Design Primer |
10 | NC_013147 | (TATT)4tatatattggagttatcaggatttgaacctaaactaattgcttgcaaagcaatgattctaccattaaattataaccccatttaatatatattaaatata(TAT)5 | c | 11697 | 11826 | 130 | Design Primer |
11 | NC_013147 | (ATATT)4ataaataattattataaaatataatataagtattataagatatatatt(ATA)4 | c | 14763 | 14842 | 80 | Design Primer |
12 | NC_013147 | (TA)6tttaaatataatatttaaaatatcttatataaaatatgataatataattaaatataatataatctaatctt(ATATA)3atctaatctaatataatctaatataatataatc(TAATA)3 | c | 16245 | 16390 | 146 | Design Primer |
13 | NC_013147 | (CTTT)4tatatcttatatcttattccttcccattttatcctttcatttatctcttttattctattctattatatcttattc(TTAT)11ttttattctttttattcttattttattatattatatctcta(ATTAT)4 | c | 19958 | 20153 | 196 | Design Primer |
14 | NC_013147 | (TAT)6ttaattta(TAT)8 | c | 20376 | 20425 | 50 | Design Primer |
15 | NC_013147 | (TCTTA)3ttttatattatattatcttatcttatttattattcttatatatttatattattatattataaaatataattta(TATT)3taaataatcttattattattttattataatttaatattattatcttat(TAA)4 | c | 20646 | 20805 | 160 | Design Primer |
16 | NC_013147 | (TATAT)6tatttataac(TAT)6ttaattaaaagg(TATAT)3tatttataac(TAT)6ttaattaaaagatataataattataaaaaaaataaatatatctaaataaaatatattagaatt(TAAA)3 | c | 20999 | 21186 | 188 | Design Primer |
17 | NC_013147 | (TATT)3tatatttcttatttttatatttcaca(TATT)3(TTAATC)6tttatcttcattttt(ATCTTA)4 | c | 24002 | 24126 | 125 | Design Primer |
18 | NC_013147 | (ATATA)5(ATCTA)4(ATATA)3 | c | 24607 | 24666 | 60 | Design Primer |
19 | NC_013147 | (TTTA)4tatggactattta(AAT)5taataataatgttaaatacttaatatatattatg(ATATA)4atttt(ATATA)4 | c | 26983 | 27105 | 123 | Design Primer |
20 | NC_013147 | (ATAAAA)3(ATATAA)7 | c | 27315 | 27374 | 60 | Design Primer |
21 | NC_013147 | (AGATA)3agattagataagataaaa(ATAAG)3 | c | 27537 | 27584 | 48 | Design Primer |
22 | NC_013147 | (ATT)4aatattagtattatcattattaatcttaaaattatcatttatattaataa(TAT)7taa(TAT)6taatattt(TTA)5tcattt(ATATTA)3 | c | 28928 | 29078 | 151 | Design Primer |
23 | NC_013147 | (TATAA)3tattatttaatttaat(TATAA)3tttatatttaattaaatataatt(TAATA)8 | c | 30000 | 30108 | 109 | Design Primer |
24 | NC_013147 | (TTA)4tattattatcctattattctctctttatcctctttatacattc(TTA)7ttcttattcttatcttactctttatccattctttatttttatatatttttatacattattcttaatctttattat(TCTTA)3tctttattattcttatt(TTATC)3tttattaaatttttcatcattcttatcatctatttatagatatatag(AT)6 | c | 32525 | 32781 | 257 | Design Primer |
25 | NC_013147 | (AATAT)5atat(TAATA)5 | c | 33032 | 33085 | 54 | Design Primer |
26 | NC_013147 | (TTA)4taattattattataata(ATT)4aatatttcc(ATT)6ctttattatacttattctttaattttattattgtcttataattaactatatatttatatataaataa(ATATTT)3 | c | 33411 | 33563 | 153 | Design Primer |
27 | NC_013147 | (AT)6agatattagatatataagatataatattataaagatatactttaataagatttatatacttag(ATA)5aaataatgatatgatcctataataaaattatattataatt(ATA)4 | c | 33712 | 33853 | 142 | Design Primer |
28 | NC_013147 | (ATA)4gtaatagtaataataactaaagaataatgtataaaaataatag(TAA)4 | c | 34363 | 34429 | 67 | Design Primer |
29 | NC_013147 | (AATAT)3aattaaatatttataatataaatatatatattaattatttaaataataa(AAT)4 | c | 34677 | 34752 | 76 | Design Primer |
30 | NC_013147 | (TTTA)3aatataaattatatattctttttataaatatatattctttttataaatatattataatc(TAATA)4taagatataata(TTAT)3 | c | 35142 | 35256 | 115 | Design Primer |
31 | NC_013147 | (TTAT)3ac(TTATT)3atatac(TTATT)3 | c | 37968 | 38017 | 50 | Design Primer |
32 | NC_013147 | (ATAAT)3atta(TATAC)3 | c | 38342 | 38375 | 34 | Design Primer |
33 | NC_013147 | (TATTA)4tatcatataatttatttattatattatcatttatctcttaagtatattaattattatttatctcttaagtatattaattattatatatctaatatcg(ATTAT)3atataatattatatgatatta(TATTC)5tattatatattatcttattatcatatta(TAT)11tg(TTA)9 | c | 38486 | 38753 | 268 | Design Primer |
34 | NC_013147 | (ATATC)3atatt(ATATC)3 | c | 39017 | 39051 | 35 | Design Primer |
35 | NC_013147 | (TTATA)3tattca(TTAT)3 | c | 39481 | 39513 | 33 | Design Primer |
36 | NC_013147 | (TATTA)4tatatta(TATAT)3 | c | 40771 | 40812 | 42 | Design Primer |
37 | NC_013147 | (ATTATA)4attaatgttattttataaaaatataattaatctaaatagaaataaagataaaaataattct(AATAAA)3 | c | 44112 | 44214 | 103 | Design Primer |
38 | NC_013147 | (TAAT)3tataatacttatatattaaata(TAAT)3 | c | 45041 | 45086 | 46 | Design Primer |
39 | NC_013147 | (TTAAT)7(TTTAT)5 | c | 47474 | 47533 | 60 | Design Primer |
40 | NC_013147 | (ATAA)5atag(ATAA)3 | c | 48490 | 48525 | 36 | Design Primer |
41 | NC_013147 | (ATTTA)4attttattttattta(ATTTT)3 | c | 49062 | 49111 | 50 | Design Primer |
42 | NC_013147 | (ATT)4aaatactctattaaatactctattata(ATT)4 | c | 49310 | 49360 | 51 | Design Primer |
43 | NC_013147 | (ATAAT)4aattatcttataatataatctatttaaatatataatatattataatatactataacatatattagatataac(ATAA)3 | c | 49525 | 49628 | 104 | Design Primer |
44 | NC_013147 | (TAA)7tattaatata(AAT)11tataatattaataaa(AAT)11attaatctaaaagagataataaataataaaaatataaaatctatgaatcaaataagaaattattcaataaaaataaaaggaata(AAT)4 | c | 51195 | 51402 | 208 | Design Primer |
45 | NC_013147 | (AATA)3taataattataataatataaataattataataatttaaaaacatttaaattaattaaaaataattatattaattcaattagtttaaattta(AAT)4 | c | 51858 | 51972 | 115 | Design Primer |
46 | NC_013147 | (TTTA)3gatcctttaatttattctttatattattgtatataatac(AT)7ttaatatatacctaatataatctaatatattttgaatataatctta(ATATT)3aagaatatatatttatatatag(AAAT)3atataaaatataaaatataaaatataaaaagaatataattaaaataagataaatataaaataaaatataataat(ATATA)4(TAATA)3 | c | 52509 | 52777 | 269 | Design Primer |
47 | NC_013147 | (TA)6(ATTT)4ataataaattatcaatagtagaaatattatatatttttaataataaaatataattatataatatataataatatttaataatataaataattatata(TAT)4 | c | 53593 | 53729 | 137 | Design Primer |
48 | NC_013147 | (ATTT)7(ATTA)3(ATTT)4ctttatttattctttag(ATTT)3aattca(ATTTT)3 | c | 54529 | 54634 | 106 | Design Primer |
49 | NC_013147 | (ATTTA)6atatataaattctaattataatattattatatagtataagaataaataaagaagtaaa(TTAAT)3ataca(TATT)3atttatataacttatat(TATAA)5 | c | 56004 | 56165 | 162 | Design Primer |
50 | NC_013147 | (TATTA)5(TATTC)3 | c | 57563 | 57602 | 40 | Design Primer |
51 | NC_013147 | (TTA)5tatataatatcctttttattaattgaat(TAAATA)7ttaatataaatataaatattaatataaatatacattgaattataatatattaatacatatataaatatgtaattaataaaaataa(ATTAT)3 | c | 58998 | 59182 | 185 | Design Primer |
52 | NC_013147 | (AAT)4tt(ATTAAG)9 | c | 59691 | 59758 | 68 | Design Primer |
53 | NC_013147 | (TATTA)5tattctttatcccttatttatttcttatttaattcttttttatatataacatatatagatattaata(TATAT)3ataatttataataatattataattataagataagat(AATATA)3 | c | 61695 | 61855 | 161 | Design Primer |
54 | NC_013147 | (TAAT)5(TTAT)6 | c | 62774 | 62817 | 44 | Design Primer |
55 | NC_013147 | (TA)6cctttatatttatattatttct(ATATA)5atttaatatgtagaatataataaaatagatatatatattataaaaaatataatgaattat(AATA)3aaattataataaaaagaataaataaaaggta(AAAT)3 | c | 63835 | 64008 | 174 | Design Primer |
56 | NC_013147 | (TAAAAT)3att(ATATA)3 | c | 64873 | 64908 | 36 | Design Primer |
57 | NC_013147 | (AATAT)4ataatt(TAAA)5 | c | 65209 | 65254 | 46 | Design Primer |
58 | NC_013147 | (TATAA)3ttttatctaatttaatttaatattatttaatttaatgc(TA)6tttaatcttaatataaaatatataaaaataagaaatatgataagagatataaaatatataaaaataaggaataaaataagataggataaaaa(ATATG)3atata(ATATG)3 | c | 65596 | 65787 | 192 | Design Primer |
59 | NC_013147 | (ATTT)3ataaataattttaatttatttctaatataaatgt(ATAAA)4taattttaatttatttctaatataaatgt(ATAAA)4taataaaataatgaataaaaaaataaataataaaaagaatg(AAAT)4 | c | 66110 | 66281 | 172 | Design Primer |
60 | NC_013147 | (TAATT)5taataaaaaa(TAATC)3 | c | 66568 | 66617 | 50 | Design Primer |
61 | NC_013147 | (ATAA)3aaaataattaa(AT)6 | c | 70092 | 70126 | 35 | Design Primer |
62 | NC_013147 | (TA)7aattaatatattactactaattaaatataaatgttgataaagaatcgggtctccacctcctgctggttcatagaaagctgtattaaagtttctatc(TAA)4 | c | 72133 | 72254 | 122 | Design Primer |
63 | NC_013147 | (TTA)5tttatattctttttatctaataataatatctttttatttataaatattatttataa(TATT)3attata(ATT)6 | c | 73113 | 73219 | 107 | Design Primer |
64 | NC_013147 | (TTTA)4tatgtgcacaatcatgatttgaacatgaattaatagctcatgaggctactgtgttatccaattacaccatcgtgctataatataaatata(AATATT)3 | c | 75088 | 75211 | 124 | Design Primer |
65 | NC_013147 | (ATTAT)7caaccttcaataaatatattattaacctttaattcc(TTATA)4 | c | 75819 | 75909 | 91 | Design Primer |
66 | NC_013147 | (AATAA)3aaaataaaattatagaataagagaataaaaaggataaaataaaaagag(AAT)6 | c | 76372 | 76452 | 81 | Design Primer |