Compound Compound Repeats of Nakaseomyces delphensis mitochondrion
Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_012619 | (AT)10aatattactatatattatatatatattttt(AATA)3atcatatgagattaataaaaatattaataaaaaataatata(AAT)5 | c | 291 | 408 | 118 | Design Primer |
| 2 | NC_012619 | (TAT)4(AAT)4 | c | 715 | 738 | 24 | Design Primer |
| 3 | NC_012619 | (TA)6tccggaatacatacatatatcatatgtatgtattccggaattattaattaatag(TAA)5tattatta(AT)9t(ATA)4 | c | 1545 | 1664 | 120 | Design Primer |
| 4 | NC_012619 | (AT)6gtatatattccgggataacttattataatatattacatattata(AAT)5 | c | 1821 | 1891 | 71 | Design Primer |
| 5 | NC_012619 | (ATA)4tgatattattataagtttatataattaatattatatggtatattttatatatatgatgtg(AT)6 | c | 3366 | 3449 | 84 | Design Primer |
| 6 | NC_012619 | (AT)6t(TA)6 | c | 3896 | 3920 | 25 | Design Primer |
| 7 | NC_012619 | (TTATA)4ttaacaattagttaccgggataataa(TAT)4 | c | 7091 | 7148 | 58 | Design Primer |
| 8 | NC_012619 | (TAT)4cccgggtattaatacttattaattataattattataatctatataatataataataatctatataatcattatatat(ATA)4tat(TA)6 | c | 7299 | 7414 | 116 | Design Primer |
| 9 | NC_012619 | (ATAAT)3gtattatataaatatatctaaattatataataagaatatatatat(TAA)5ttttaatatatatattaatataatatatattaataattaataataatattaataatatatattatatatt(ATA)4 | c | 9436 | 9592 | 157 | Design Primer |
| 10 | NC_012619 | (ATA)4tcatataataatatataataattataatatattttattaaatattatagtata(AT)8 | c | 11228 | 11308 | 81 | Design Primer |
| 11 | NC_012619 | (TA)6atacaaatatatatcaaaatatataatatctatattaataaagaattatatt(TA)6 | c | 11813 | 11888 | 76 | Design Primer |
| 12 | NC_012619 | (AT)7gataatatattataatattgtaataattaatatgaataataagtataccggtttatttatatatttatatatataaataaaccggataatatatg(TA)6atatctatatataaatatatattataagaataataatatataaataatatgatataaatatataaatatttataattattaataatatataatttttata(TAAT)4aagggtatcccggtatatttatatacatagtatataaatataccgggtatatatactattaatata(AT)13aatatatatctaatatcatataataatat(ATA)4ctatatatcta(TATAT)3tacggtcttctttatacttaatataatctataattaaataatttaataaatatataataatataggatatatgaataattatattataat(TAA)4 | c | 12029 | 12526 | 498 | Design Primer |
| 13 | NC_012619 | (AATT)3gaataaatatatatattaataatctattaaatagtaatattaatctattaaatt(ATA)7 | c | 14498 | 14584 | 87 | Design Primer |
| 14 | NC_012619 | (AT)7tatataataattattatattatat(TTATA)4ataatataatagaattaccggaatacattcatattttataaatatgtatgtattccgaataataaatatataaatatatatgataa(AT)9ggttataattaaacataataa(TAT)5 | c | 17933 | 18130 | 198 | Design Primer |
| 15 | NC_012619 | (AT)9ttatatgaatatataaggtatagtccaaggtattagtaataatattgaagcaatacttcaaatatta(AT)10tatatattaatatccattataatattctta(AT)7aataattataataatat(TA)7 | c | 19725 | 19904 | 180 | Design Primer |
| 16 | NC_012619 | (TAT)5aattaatataaaggggatataaatatatctgtatatacccgggacaattataattgtcccgggtatccctat(TA)6(ATT)5ataaattataaatataatatttaattaaatattataatattatatatg(ATATT)3attatattatatgatataatagaataatagtcccggaatacatctctttaagagatgtattccgggttctatattttaattataatatattatatatta(TATAT)4 | c | 20705 | 21000 | 296 | Design Primer |
| 17 | NC_012619 | (TAT)4atatattataagtatattattactatattaaataag(TA)9catattaaacccggaatatttacatat(ATTA)3 | c | 21146 | 21250 | 105 | Design Primer |
| 18 | NC_012619 | (AT)7(TA)8ctatatataat(ATTA)3 | c | 21747 | 21799 | 53 | Design Primer |
| 19 | NC_012619 | (TA)8tt(ATATG)3 | c | 22732 | 22764 | 33 | Design Primer |
| 20 | NC_012619 | (ATA)4attttaataattaaaataattaa(AT)11(TA)7 | c | 23802 | 23872 | 71 | Design Primer |
| 21 | NC_012619 | (AATA)4ataaaaaataataatgtttaaataatattcttataaatatcttccccggaacaaaaacatccctaaagatgtttttgttccggggttattatat(TA)6ttatatactttaaatat(TA)6ttatattttatatattatatatacaatagatacccggtatattcatatatattatatatgaatataccgggtaaccctttatataat(TA)9t(TA)6ttatatattatattttatcatattatatttataa(ATATT)3tatgattaatattatattatatcatattaggtatatattatatataccatattatatatggtatatataccgg(AAT)4tataataa(TAATT)6taataagattattatataattataatatattataatattatattattatatattatatattcata(AT)6tattatactatactatatagtatattattatatatattctataatat(TA)7 | c | 24192 | 24770 | 579 | Design Primer |
| 22 | NC_012619 | (AT)6aatatataatattcatatattatactatatatatatgatcatatcatattta(TATAT)3agatatatcttattattatataatat(TA)6 | c | 25290 | 25406 | 117 | Design Primer |
| 23 | NC_012619 | (AT)7aaataaaaataacctatataatattatatatacttattattatctttataatttatataatatattataatattatatattataatgattatat(TA)6catatatatatgtatatacctaatatatccggtatatattc(AT)7ggatatataccggaataacctatatataatatatattccccggaacaaaaacatctttagggatgtttttgttccggggttaatatgta(TAT)4 | c | 25799 | 26074 | 276 | Design Primer |
| 24 | NC_012619 | (TAA)4ttaatagtcttataacccggcatatattaatatataatattaatatatatcgggtaatattataaatataataatatataaataatatcc(ATATA)3 | c | 27199 | 27315 | 117 | Design Primer |
| 25 | NC_012619 | (TA)6at(TA)6gtttat(ATA)5 | c | 28031 | 28077 | 47 | Design Primer |
| 26 | NC_012619 | (TA)7ata(ATT)4ataattatatatta(AT)6agtatattattaataatc(TAT)6 | c | 28744 | 28834 | 91 | Design Primer |
| 27 | NC_012619 | (AT)6tattatatatag(TA)6aatattattatatttataattataataatatag(TATAT)3tatttagatataatatgatatgatacccggtccatataca(AT)6 | c | 29069 | 29204 | 136 | Design Primer |
| 28 | NC_012619 | (TAT)4attatatattataatataatatatttaaatattaatatatatataatatta(TAT)9 | c | 29461 | 29550 | 90 | Design Primer |
| 29 | NC_012619 | (ATTATA)3atgagtcgtagactaataggtaagttaccaaaatttgagtttggagtttgtttgttcgaatcaaaccgattcaataatattatt(ATAA)3atatatatataaactatattataattttataattatataaaaaatatatatataatg(TA)6aatattatatatatactatattattataatatataatattatattgttatataatatattaatattagagatata(TATAT)3 | c | 31108 | 31380 | 273 | Design Primer |
| 30 | NC_012619 | (TA)6ttatatatatattagttatatatatat(TA)8g(TAT)4tacccggaatattcac(AT)6gtgaatattccggg(TA)6 | c | 33038 | 33159 | 122 | Design Primer |
| 31 | NC_012619 | (TAAAT)3atttaatattgtatattat(ATA)4 | c | 33675 | 33720 | 46 | Design Primer |
| 32 | NC_012619 | (AT)6tataata(ATAATT)3 | c | 35212 | 35248 | 37 | Design Primer |
| 33 | NC_012619 | (AT)6gtatatataccggataataacatatatctaattatattagataattatatata(ATAGT)3 | c | 35484 | 35563 | 80 | Design Primer |
| 34 | NC_012619 | (TAT)4aaatataatatatattatctaatatataaatataatatctaatatataataatatatataaatatatattatattattaatataatagtat(TA)6gtatataaaatagtataaatatagtagtagtatatcccggaatatatag(AT)6 | c | 35733 | 35908 | 176 | Design Primer |
| 35 | NC_012619 | (AT)6tacatataatattattataa(AT)6 | c | 36252 | 36295 | 44 | Design Primer |