All Repeats of Nakaseomyces delphensis mitochondrion
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S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_012619 | (ATAA)3 | p4 | 36 | 47 | 12 | Design Primer |
2 | NC_012619 | (ATA)6 | p3 | 159 | 176 | 18 | Design Primer |
3 | NC_012619 | (AT)10aatattactatatattatatatatattttt(AATA)3atcatatgagattaataaaaatattaataaaaaataatata(AAT)5 | c | 291 | 408 | 118 | Design Primer |
4 | NC_012619 | (ATA)4 | p3 | 569 | 580 | 12 | Design Primer |
5 | NC_012619 | (TAT)4(AAT)4 | c | 715 | 738 | 24 | Design Primer |
6 | NC_012619 | (ATA)4 | p3 | 1079 | 1090 | 12 | Design Primer |
7 | NC_012619 | (TA)6tccggaatacatacatatatcatatgtatgtattccggaattattaattaatag(TAA)5tattatta(AT)9t(ATA)4 | c | 1545 | 1664 | 120 | Design Primer |
8 | NC_012619 | (AT)6gtatatattccgggataacttattataatatattacatattata(AAT)5 | c | 1821 | 1891 | 71 | Design Primer |
9 | NC_012619 | (ATAA)3 | p4 | 2141 | 2152 | 12 | Design Primer |
10 | NC_012619 | (AT)10aaataggggttatagttaaattggtagaacaattgtgttgcatgcaatagatatgagttcaattctcattaactcc(AT)7(ATTA)3*tagaaactataattcaattggttagaatagtattttgataaggtaccaatataggttcgattcctgttagtttc(AT)6aaat(ATA)4 | c* | 2381 | 2602 | 222 | Design Primer |
11 | NC_012619 | (TA)10 | p2 | 2791 | 2810 | 20 | Design Primer |
12 | NC_012619 | (TTA)4ataatatagtatatataatattatgatataa(TATAAT)3ataatatta(TAT)4atatgatatatatattaattatatgggggtatatta(TATAT)3(TA)6* | c* | 3083 | 3222 | 140 | Design Primer |
13 | NC_012619 | (ATA)4tgatattattataagtttatataattaatattatatggtatattttatatatatgatgtg(AT)6 | c | 3366 | 3449 | 84 | Design Primer |
14 | NC_012619 | (AT)6t(TA)6 | c | 3896 | 3920 | 25 | Design Primer |
15 | NC_012619 | (TAT)4 | p3 | 5047 | 5058 | 12 | Design Primer |
16 | NC_012619 | (AT)7 | p2 | 5997 | 6010 | 14 | Design Primer |
17 | NC_012619 | (TAT)4 | p3 | 6907 | 6918 | 12 | Design Primer |
18 | NC_012619 | (TTATA)4ttaacaattagttaccgggataataa(TAT)4 | c | 7091 | 7148 | 58 | Design Primer |
19 | NC_012619 | (TAT)4cccgggtattaatacttattaattataattattataatctatataatataataataatctatataatcattatatat(ATA)4tat(TA)6 | c | 7299 | 7414 | 116 | Design Primer |
20 | NC_012619 | (ATA)6aagttatattagctcaattggtagagcattcgttttgtaatcgaaaggtttaaggttcaaatccttaatataacattaat(ATA)5atcatcatataac(TA)6(ATA)4*attataatcattatataactaatatatatataacccggcataattacattaatataatgtaattatgccggatattaaattactat(TATAA)3(AT)6*aatatacaatatatctcatatacaaataatatattatattaatatacaatatatatata(AT)6aaaatatatatattataatttagaatat(ATA)4 | c* | 7757 | 8126 | 370 | Design Primer |
21 | NC_012619 | (TTATA)4 | p5 | 8358 | 8377 | 20 | Design Primer |
22 | NC_012619 | (TA)6 | p2 | 8703 | 8714 | 12 | Design Primer |
23 | NC_012619 | (TAT)4 | p3 | 8993 | 9004 | 12 | Design Primer |
24 | NC_012619 | (AT)7 | p2 | 9242 | 9255 | 14 | Design Primer |
25 | NC_012619 | (ATAAT)3gtattatataaatatatctaaattatataataagaatatatatat(TAA)5ttttaatatatatattaatataatatatattaataattaataataatattaataatatatattatatatt(ATA)4 | c | 9436 | 9592 | 157 | Design Primer |
26 | NC_012619 | (AAT)4 | p3 | 10748 | 10759 | 12 | Design Primer |
27 | NC_012619 | (TAATAT)4 | p6 | 10905 | 10928 | 24 | Design Primer |
28 | NC_012619 | (ATA)4tcatataataatatataataattataatatattttattaaatattatagtata(AT)8 | c | 11228 | 11308 | 81 | Design Primer |
29 | NC_012619 | (ATA)4 | p3 | 11443 | 11454 | 12 | Design Primer |
30 | NC_012619 | (TA)6atacaaatatatatcaaaatatataatatctatattaataaagaattatatt(TA)6 | c | 11813 | 11888 | 76 | Design Primer |
31 | NC_012619 | (AT)7gataatatattataatattgtaataattaatatgaataataagtataccggtttatttatatatttatatatataaataaaccggataatatatg(TA)6atatctatatataaatatatattataagaataataatatataaataatatgatataaatatataaatatttataattattaataatatataatttttata(TAAT)4aagggtatcccggtatatttatatacatagtatataaatataccgggtatatatactattaatata(AT)13aatatatatctaatatcatataataatat(ATA)4ctatatatcta(TATAT)3tacggtcttctttatacttaatataatctataattaaataatttaataaatatataataatataggatatatgaataattatattataat(TAA)4 | c | 12029 | 12526 | 498 | Design Primer |
32 | NC_012619 | (ATA)4 | p3 | 12641 | 12652 | 12 | Design Primer |
33 | NC_012619 | (ATA)6 | p3 | 12814 | 12831 | 18 | Design Primer |
34 | NC_012619 | (AT)7 | p2 | 12988 | 13001 | 14 | Design Primer |
35 | NC_012619 | (TA)6 | p2 | 13687 | 13698 | 12 | Design Primer |
36 | NC_012619 | (TAA)4 | p3 | 14169 | 14180 | 12 | Design Primer |
37 | NC_012619 | (AATT)3gaataaatatatatattaataatctattaaatagtaatattaatctattaaatt(ATA)7 | c | 14498 | 14584 | 87 | Design Primer |
38 | NC_012619 | (ATA)4 | p3 | 14777 | 14788 | 12 | Design Primer |
39 | NC_012619 | (TAA)4 | p3 | 15075 | 15086 | 12 | Design Primer |
40 | NC_012619 | (TA)7 | p2 | 15342 | 15355 | 14 | Design Primer |
41 | NC_012619 | (AT)6(TATAT)3* | c* | 15602 | 15623 | 22 | Design Primer |
42 | NC_012619 | (TTA)4 | p3 | 16395 | 16406 | 12 | Design Primer |
43 | NC_012619 | (TATT)3 | p4 | 16955 | 16966 | 12 | Design Primer |
44 | NC_012619 | (AATA)3 | p4 | 17530 | 17541 | 12 | Design Primer |
45 | NC_012619 | (TA)7(TATAT)5*(TA)7* | c* | 17701 | 17744 | 44 | Design Primer |
46 | NC_012619 | (AT)7tatataataattattatattatat(TTATA)4ataatataatagaattaccggaatacattcatattttataaatatgtatgtattccgaataataaatatataaatatatatgataa(AT)9ggttataattaaacataataa(TAT)5 | c | 17933 | 18130 | 198 | Design Primer |
47 | NC_012619 | (TAT)7 | p3 | 18252 | 18272 | 21 | Design Primer |
48 | NC_012619 | (TAA)4 | p3 | 18698 | 18709 | 12 | Design Primer |
49 | NC_012619 | (AATATA)3 | p6 | 19527 | 19544 | 18 | Design Primer |
50 | NC_012619 | (AT)9ttatatgaatatataaggtatagtccaaggtattagtaataatattgaagcaatacttcaaatatta(AT)10tatatattaatatccattataatattctta(AT)7aataattataataatat(TA)7 | c | 19725 | 19904 | 180 | Design Primer |
51 | NC_012619 | (TTAT)3 | p4 | 20427 | 20438 | 12 | Design Primer |
52 | NC_012619 | (TAT)5aattaatataaaggggatataaatatatctgtatatacccgggacaattataattgtcccgggtatccctat(TA)6(ATT)5ataaattataaatataatatttaattaaatattataatattatatatg(ATATT)3attatattatatgatataatagaataatagtcccggaatacatctctttaagagatgtattccgggttctatattttaattataatatattatatatta(TATAT)4 | c | 20705 | 21000 | 296 | Design Primer |
53 | NC_012619 | (TAT)4atatattataagtatattattactatattaaataag(TA)9catattaaacccggaatatttacatat(ATTA)3 | c | 21146 | 21250 | 105 | Design Primer |
54 | NC_012619 | (TAT)5 | p3 | 21399 | 21413 | 15 | Design Primer |
55 | NC_012619 | (AATTAT)3 | p6 | 21603 | 21620 | 18 | Design Primer |
56 | NC_012619 | (AT)7(TA)8ctatatataat(ATTA)3 | c | 21747 | 21799 | 53 | Design Primer |
57 | NC_012619 | (TAA)5 | p3 | 22069 | 22083 | 15 | Design Primer |
58 | NC_012619 | (TA)8tt(ATATG)3 | c | 22732 | 22764 | 33 | Design Primer |
59 | NC_012619 | (AT)6tatataacatatatgatattatagtataatataatattattatatacccggaccataacatcatagatgttatggtccgggtttaacattatta(TATAAT)3tattattataatatcatatatatgatatatctaatatgatatatattatgtatagata(AT)6aatatgatatgatataattatatataatatattatatgatatatatatgatatatatata(ATATG)3tatatatattacccggatcaataactttatattaaagttattgatccgggattactattatattattgttatta(TAT)4actattat(TA)8(TAT)4*atattaa(ATATG)4 | c* | 22898 | 23313 | 416 | Design Primer |
60 | NC_012619 | (TA)7(TAT)4* | c* | 23508 | 23531 | 24 | Design Primer |
61 | NC_012619 | (TATAA)3 | p5 | 23676 | 23690 | 15 | Design Primer |
62 | NC_012619 | (ATA)4attttaataattaaaataattaa(AT)11(TA)7 | c | 23802 | 23872 | 71 | Design Primer |
63 | NC_012619 | (AATA)4ataaaaaataataatgtttaaataatattcttataaatatcttccccggaacaaaaacatccctaaagatgtttttgttccggggttattatat(TA)6ttatatactttaaatat(TA)6ttatattttatatattatatatacaatagatacccggtatattcatatatattatatatgaatataccgggtaaccctttatataat(TA)9t(TA)6ttatatattatattttatcatattatatttataa(ATATT)3tatgattaatattatattatatcatattaggtatatattatatataccatattatatatggtatatataccgg(AAT)4tataataa(TAATT)6taataagattattatataattataatatattataatattatattattatatattatatattcata(AT)6tattatactatactatatagtatattattatatatattctataatat(TA)7 | c | 24192 | 24770 | 579 | Design Primer |
64 | NC_012619 | (TA)6 | p2 | 25132 | 25143 | 12 | Design Primer |
65 | NC_012619 | (AT)6aatatataatattcatatattatactatatatatatgatcatatcatattta(TATAT)3agatatatcttattattatataatat(TA)6 | c | 25290 | 25406 | 117 | Design Primer |
66 | NC_012619 | (AT)7aaataaaaataacctatataatattatatatacttattattatctttataatttatataatatattataatattatatattataatgattatat(TA)6catatatatatgtatatacctaatatatccggtatatattc(AT)7ggatatataccggaataacctatatataatatatattccccggaacaaaaacatctttagggatgtttttgttccggggttaatatgta(TAT)4 | c | 25799 | 26074 | 276 | Design Primer |
67 | NC_012619 | (TAT)6 | p3 | 26234 | 26251 | 18 | Design Primer |
68 | NC_012619 | (TAA)4ttaatagtcttataacccggcatatattaatatataatattaatatatatcgggtaatattataaatataataatatataaataatatcc(ATATA)3 | c | 27199 | 27315 | 117 | Design Primer |
69 | NC_012619 | (ATA)4(ATAATT)3*atagaatattataacataataacccggaataatcatatatataatatatgattattccgggtaatagattatataatattatattcataatagatat(TA)6 | c* | 27516 | 27651 | 136 | Design Primer |
70 | NC_012619 | (TAA)4 | p3 | 27793 | 27804 | 12 | Design Primer |
71 | NC_012619 | (TA)6at(TA)6gtttat(ATA)5 | c | 28031 | 28077 | 47 | Design Primer |
72 | NC_012619 | (TA)9 | p2 | 28201 | 28218 | 18 | Design Primer |
73 | NC_012619 | (ATA)4 | p3 | 28446 | 28457 | 12 | Design Primer |
74 | NC_012619 | (TA)7ata(ATT)4ataattatatatta(AT)6agtatattattaataatc(TAT)6 | c | 28744 | 28834 | 91 | Design Primer |
75 | NC_012619 | (AT)6tattatatatag(TA)6aatattattatatttataattataataatatag(TATAT)3tatttagatataatatgatatgatacccggtccatataca(AT)6 | c | 29069 | 29204 | 136 | Design Primer |
76 | NC_012619 | (TAT)4attatatattataatataatatatttaaatattaatatatatataatatta(TAT)9 | c | 29461 | 29550 | 90 | Design Primer |
77 | NC_012619 | (TAA)4tacaaattaaattataatattctttaaaatatattctttttatacccggaatatatac(AT)6gtatatattccgggatatctattatctatatattatataatattattataaatattatatattattcttattattctataa(TAT)5aata(AT)6aatataataattattataaaaaatatcta(ATT)4(TA)6*atatatgatatattatatactttatcatattactcggaatatttatatataataatatataaatattccaggatatatatataata(AT)6aaatattctataaatattataatattttataaatattt(TTA)5 | c* | 30414 | 30810 | 397 | Design Primer |
78 | NC_012619 | (AT)6 | p2 | 30965 | 30976 | 12 | Design Primer |
79 | NC_012619 | (ATTATA)3atgagtcgtagactaataggtaagttaccaaaatttgagtttggagtttgtttgttcgaatcaaaccgattcaataatattatt(ATAA)3atatatatataaactatattataattttataattatataaaaaatatatatataatg(TA)6aatattatatatatactatattattataatatataatattatattgttatataatatattaatattagagatata(TATAT)3 | c | 31108 | 31380 | 273 | Design Primer |
80 | NC_012619 | (ATT)4 | p3 | 31682 | 31693 | 12 | Design Primer |
81 | NC_012619 | (TA)6aattatttattataataaatatatt(ATATA)5atgagagagtattgtttaaaggtaaaacagttgtcttttaagcaacccatgcttggttcgaatccagctattctc(AT)10(TAT)5*atattatattaggatatat(TA)6 | c* | 31830 | 32029 | 200 | Design Primer |
82 | NC_012619 | (AT)6 | p2 | 32132 | 32143 | 12 | Design Primer |
83 | NC_012619 | (TAA)4tatatatattattataggatctatagcttaatagtaaagtcctattttgtcataatagaggatatcagtgcaaatctgattagattcg(TA)13(ATA)5* | c* | 32332 | 32469 | 138 | Design Primer |
84 | NC_012619 | (TAT)4 | p3 | 32669 | 32680 | 12 | Design Primer |
85 | NC_012619 | (TA)6ttatatatatattagttatatatatat(TA)8g(TAT)4tacccggaatattcac(AT)6gtgaatattccggg(TA)6 | c | 33038 | 33159 | 122 | Design Primer |
86 | NC_012619 | (TAT)4 | p3 | 33281 | 33292 | 12 | Design Primer |
87 | NC_012619 | (TAT)4 | p3 | 33409 | 33420 | 12 | Design Primer |
88 | NC_012619 | (TAAAT)3atttaatattgtatattat(ATA)4 | c | 33675 | 33720 | 46 | Design Primer |
89 | NC_012619 | (ATTA)3 | p4 | 34302 | 34313 | 12 | Design Primer |
90 | NC_012619 | (TA)7 | p2 | 34572 | 34585 | 14 | Design Primer |
91 | NC_012619 | (AT)6 | p2 | 35024 | 35035 | 12 | Design Primer |
92 | NC_012619 | (AT)6tataata(ATAATT)3 | c | 35212 | 35248 | 37 | Design Primer |
93 | NC_012619 | (AT)6gtatatataccggataataacatatatctaattatattagataattatatata(ATAGT)3 | c | 35484 | 35563 | 80 | Design Primer |
94 | NC_012619 | (TAT)4aaatataatatatattatctaatatataaatataatatctaatatataataatatatataaatatatattatattattaatataatagtat(TA)6gtatataaaatagtataaatatagtagtagtatatcccggaatatatag(AT)6 | c | 35733 | 35908 | 176 | Design Primer |
95 | NC_012619 | (AT)6tacatataatattattataa(AT)6 | c | 36252 | 36295 | 44 | Design Primer |
96 | NC_012619 | (TA)6(ATATA)4*taatataat(ATATA)4taaatatat(ATA)4taataa(TAT)6aaaatataatat(ATATA)4 | c* | 36409 | 36541 | 133 | Design Primer |
97 | NC_012619 | (ATAAT)6(AT)8*aatctatatttaatattttaatat(TAA)5 | c* | 36717 | 36799 | 83 | Design Primer |
98 | NC_012619 | (ATATA)3(AT)7* | c* | 36904 | 36927 | 24 | Design Primer |