ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Compound Repeats of Carica papaya chloroplast

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S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_010323(TGTA)3aaaaagcttcacaaaaaagtggtaaaaacttatttcgaaaaaaaaaaatctaaaatattagaacataatgaaagtatgatac(TAAA)3aagtatgatac(TAAA)4attcataaa(T)12c247400154Design Primer
2NC_010323(TTAT)3g(TTAT)3c4834485825Design Primer
3NC_010323(T)13ga(TTTC)3c6237626327Design Primer
4NC_010323(A)12gggaaagcccttctttacttttttatactttacttttttttgtatagattattattttatagattattattttaatattatat(TA)6c87558861107Design Primer
5NC_010323(TTAT)3tatgtattatgtttttaatatattttatattctaattc(TAT)5(ATA)4c9276935277Design Primer
6NC_010323(TTAAA)3gaatgatcaatttcgtttct(TTTA)3c109661101247Design Primer
7NC_010323(TTAT)3atttttatatattc(TTTATA)3c541895423244Design Primer
8NC_010323(TTTA)3tat(ATAA)3agataggtttagtttaattaactattaattaaaact(ATTA)3c548255489975Design Primer
9NC_010323(AAT)5aaataatcaaaaaagtggattattatacatctatttcatttataaagatgaataagtccatttatttagttctacatttcttgtacctattag(AT)6c6282662945120Design Primer