All Repeats of Vanderwaltozyma polyspora mitochondrion
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S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_009638 | (TAA)5tgataattttaatattattaatttatttaataataaat(ATA)5 | c | 138 | 205 | 68 | Design Primer |
2 | NC_009638 | (AAATT)3 | p5 | 434 | 448 | 15 | Design Primer |
3 | NC_009638 | (AATA)3taataatatataaatataataatataataatataataatataataatatagaatataga(AT)7taataatattatatatataaaat(AATA)3taataatataataatatatatagtatatatataattaatataaataatatatagtatat(ATATTA)3(ATTA)3* | c* | 692 | 896 | 205 | Design Primer |
4 | NC_009638 | (TAT)4 | p3 | 1794 | 1805 | 12 | Design Primer |
5 | NC_009638 | (ATTA)3atataaataattatattaataaaatataat(ATA)4tattaagttatataatttaataatatatatataatatatagtatataatatatagtatataatatatagtatataatatatagtt(ATTA)3taatatttataataaatatatataataattattatattattatatataatattagatatatt(TA)6 | c | 2072 | 2296 | 225 | Design Primer |
6 | NC_009638 | (ATTA)3 | p4 | 2587 | 2598 | 12 | Design Primer |
7 | NC_009638 | (AATA)3aaattatttaaaataaataataaattatgaataaaatatatataagatattagcc(TTA)4ataataatatttatcaaatatatatataaataagtatatatttataaatattaattta(AT)8tcaaatacataataatatatattaataaaatatatattattataatatatatattatattaataaaatatatattatttatataatattatataaata(AT)8aaatttataatataataattatataataaataataat(TA)7 | c | 2715 | 3032 | 318 | Design Primer |
8 | NC_009638 | (TAA)4ataacaaccta(T)10 | c | 3159 | 3191 | 33 | Design Primer |
9 | NC_009638 | (GGA)4 | p3 | 4211 | 4222 | 12 | Design Primer |
10 | NC_009638 | (AT)6 | p2 | 4372 | 4383 | 12 | Design Primer |
11 | NC_009638 | (ATA)4 | p3 | 4492 | 4503 | 12 | Design Primer |
12 | NC_009638 | (ATA)4 | p3 | 4727 | 4738 | 12 | Design Primer |
13 | NC_009638 | (TAAT)4aatttatttaataatatattattaatctttatatattataattataattaat(TA)6atttattatgtattatatatataatattttattttatatattatataaattat(TA)6 | c | 4954 | 5098 | 145 | Design Primer |
14 | NC_009638 | (AATA)4 | p4 | 5206 | 5221 | 16 | Design Primer |
15 | NC_009638 | (TA)10 | p2 | 5773 | 5792 | 20 | Design Primer |
16 | NC_009638 | (TAT)4aaatatatataattacaggtgttacatcgttgtctttagttcgtgctgtaaagttttagattaatttcataaacgaacataactcc(AT)7gttataatatatatattt(TA)6tttatatattttatatataattattaataatatattaatttatattattaatataaattatatttaatatatttatatatatttatat(TA)6 | c | 6330 | 6571 | 242 | Design Primer |
17 | NC_009638 | (TAT)4 | p3 | 6729 | 6740 | 12 | Design Primer |
18 | NC_009638 | (AT)6 | p2 | 7382 | 7393 | 12 | Design Primer |
19 | NC_009638 | (ATA)4taatatttt(ATA)4 | c | 7530 | 7562 | 33 | Design Primer |
20 | NC_009638 | (ATT)4 | p3 | 8676 | 8687 | 12 | Design Primer |
21 | NC_009638 | (TA)10 | p2 | 9667 | 9686 | 20 | Design Primer |
22 | NC_009638 | (ATA)4aaattattatagatatatattctagtaatagataaaagtatgtatagttaaattatcaggaa(AAT)4 | c | 9918 | 10003 | 86 | Design Primer |
23 | NC_009638 | (TA)6atattataaatttaat(TA)6 | c | 10678 | 10717 | 40 | Design Primer |
24 | NC_009638 | (ATTT)3attattatttaatatattaaatttattatttatttaattaaatataat(ATA)5taataata(TTAT)3tatttaatttatttattatttattaataataaataatataataatataataatataataatataataat(ATA)5(TAA)4 | c | 11373 | 11563 | 191 | Design Primer |
25 | NC_009638 | (AT)7aataa(AT)6aaataataatatt(AATA)3 | c | 11763 | 11818 | 56 | Design Primer |
26 | NC_009638 | (AATA)3 | p4 | 11945 | 11956 | 12 | Design Primer |
27 | NC_009638 | (AAT)4tatatataattaaata(TAAT)3 | c | 13163 | 13202 | 40 | Design Primer |
28 | NC_009638 | (ATA)4(ATAAT)3*aatatacatattaataatatatatattattaatatatattatctatataatatatattaataattaagattatatatatattg(TA)6attaatatataataatattattgtataatatactta(AT)6aaataatatatatattgtatataattatatataaataatatatatattgtatataattatatatataatatatatataaataatatttattag(AT)6 | c* | 13360 | 13628 | 269 | Design Primer |
29 | NC_009638 | (ATATA)3 | p5 | 14727 | 14741 | 15 | Design Primer |
30 | NC_009638 | (AT)7 | p2 | 14970 | 14983 | 14 | Design Primer |
31 | NC_009638 | (AATA)4 | p4 | 15220 | 15235 | 16 | Design Primer |
32 | NC_009638 | (AT)6(AAAT)3(AT)7* | c* | 15417 | 15452 | 36 | Design Primer |
33 | NC_009638 | (TTA)4 | p3 | 16469 | 16480 | 12 | Design Primer |
34 | NC_009638 | (TTAT)3 | p4 | 17285 | 17296 | 12 | Design Primer |
35 | NC_009638 | (A)10 | p1 | 17685 | 17694 | 10 | Design Primer |
36 | NC_009638 | (ATAA)3(AT)7*(TAAA)4*ta(AT)8 | c* | 17872 | 17929 | 58 | Design Primer |
37 | NC_009638 | (TTAA)3ttatta(AAT)4 | c | 18041 | 18070 | 30 | Design Primer |
38 | NC_009638 | (AT)8 | p2 | 18209 | 18224 | 16 | Design Primer |
39 | NC_009638 | (ATAA)3tatatttatttatatttatattaataatattcataatacatttaattaatatataat(TAA)4ta(TAT)5aagtaatatata(AT)7 | c | 19045 | 19168 | 124 | Design Primer |
40 | NC_009638 | (ATATA)3catac(TA)7ttatatataatatttatctaattatatttataattatatatttattttta(AT)7 | c | 19319 | 19416 | 98 | Design Primer |
41 | NC_009638 | (TTAA)3taatataattaatatat(TTAA)3 | c | 19721 | 19761 | 41 | Design Primer |
42 | NC_009638 | (ATA)4 | p3 | 20168 | 20179 | 12 | Design Primer |
43 | NC_009638 | (AT)7 | p2 | 20484 | 20497 | 14 | Design Primer |
44 | NC_009638 | (ATTA)4tagatatatataatatattaataattaaatattataaataatattttataataatataaat(ATA)4taatatt(ATA)4ttataataatataaatatt(ATA)4ttattttaataataatatatatttatagataaattaaatattaatatattatattaataatataaaattgataataaatataaa(AT)6 | c | 21149 | 21383 | 235 | Design Primer |