ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Vanderwaltozyma polyspora mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_009638(TAA)5tgataattttaatattattaatttatttaataataaat(ATA)5c13820568Design Primer
2NC_009638(AAATT)3p543444815Design Primer
3NC_009638(AATA)3taataatatataaatataataatataataatataataatataataatatagaatataga(AT)7taataatattatatatataaaat(AATA)3taataatataataatatatatagtatatatataattaatataaataatatatagtatat(ATATTA)3(ATTA)3*c*692896205Design Primer
4NC_009638(TAT)4p31794180512Design Primer
5NC_009638(ATTA)3atataaataattatattaataaaatataat(ATA)4tattaagttatataatttaataatatatatataatatatagtatataatatatagtatataatatatagtatataatatatagtt(ATTA)3taatatttataataaatatatataataattattatattattatatataatattagatatatt(TA)6c20722296225Design Primer
6NC_009638(ATTA)3p42587259812Design Primer
7NC_009638(AATA)3aaattatttaaaataaataataaattatgaataaaatatatataagatattagcc(TTA)4ataataatatttatcaaatatatatataaataagtatatatttataaatattaattta(AT)8tcaaatacataataatatatattaataaaatatatattattataatatatatattatattaataaaatatatattatttatataatattatataaata(AT)8aaatttataatataataattatataataaataataat(TA)7c27153032318Design Primer
8NC_009638(TAA)4ataacaaccta(T)10c3159319133Design Primer
9NC_009638(GGA)4p34211422212Design Primer
10NC_009638(AT)6p24372438312Design Primer
11NC_009638(ATA)4p34492450312Design Primer
12NC_009638(ATA)4p34727473812Design Primer
13NC_009638(TAAT)4aatttatttaataatatattattaatctttatatattataattataattaat(TA)6atttattatgtattatatatataatattttattttatatattatataaattat(TA)6c49545098145Design Primer
14NC_009638(AATA)4p45206522116Design Primer
15NC_009638(TA)10p25773579220Design Primer
16NC_009638(TAT)4aaatatatataattacaggtgttacatcgttgtctttagttcgtgctgtaaagttttagattaatttcataaacgaacataactcc(AT)7gttataatatatatattt(TA)6tttatatattttatatataattattaataatatattaatttatattattaatataaattatatttaatatatttatatatatttatat(TA)6c63306571242Design Primer
17NC_009638(TAT)4p36729674012Design Primer
18NC_009638(AT)6p27382739312Design Primer
19NC_009638(ATA)4taatatttt(ATA)4c7530756233Design Primer
20NC_009638(ATT)4p38676868712Design Primer
21NC_009638(TA)10p29667968620Design Primer
22NC_009638(ATA)4aaattattatagatatatattctagtaatagataaaagtatgtatagttaaattatcaggaa(AAT)4c99181000386Design Primer
23NC_009638(TA)6atattataaatttaat(TA)6c106781071740Design Primer
24NC_009638(ATTT)3attattatttaatatattaaatttattatttatttaattaaatataat(ATA)5taataata(TTAT)3tatttaatttatttattatttattaataataaataatataataatataataatataataatataataat(ATA)5(TAA)4c1137311563191Design Primer
25NC_009638(AT)7aataa(AT)6aaataataatatt(AATA)3c117631181856Design Primer
26NC_009638(AATA)3p4119451195612Design Primer
27NC_009638(AAT)4tatatataattaaata(TAAT)3c131631320240Design Primer
28NC_009638(ATA)4(ATAAT)3*aatatacatattaataatatatatattattaatatatattatctatataatatatattaataattaagattatatatatattg(TA)6attaatatataataatattattgtataatatactta(AT)6aaataatatatatattgtatataattatatataaataatatatatattgtatataattatatatataatatatatataaataatatttattag(AT)6c*1336013628269Design Primer
29NC_009638(ATATA)3p5147271474115Design Primer
30NC_009638(AT)7p2149701498314Design Primer
31NC_009638(AATA)4p4152201523516Design Primer
32NC_009638(AT)6(AAAT)3(AT)7*c*154171545236Design Primer
33NC_009638(TTA)4p3164691648012Design Primer
34NC_009638(TTAT)3p4172851729612Design Primer
35NC_009638(A)10p1176851769410Design Primer
36NC_009638(ATAA)3(AT)7*(TAAA)4*ta(AT)8c*178721792958Design Primer
37NC_009638(TTAA)3ttatta(AAT)4c180411807030Design Primer
38NC_009638(AT)8p2182091822416Design Primer
39NC_009638(ATAA)3tatatttatttatatttatattaataatattcataatacatttaattaatatataat(TAA)4ta(TAT)5aagtaatatata(AT)7c1904519168124Design Primer
40NC_009638(ATATA)3catac(TA)7ttatatataatatttatctaattatatttataattatatatttattttta(AT)7c193191941698Design Primer
41NC_009638(TTAA)3taatataattaatatat(TTAA)3c197211976141Design Primer
42NC_009638(ATA)4p3201682017912Design Primer
43NC_009638(AT)7p2204842049714Design Primer
44NC_009638(ATTA)4tagatatatataatatattaataattaaatattataaataatattttataataatataaat(ATA)4taatatt(ATA)4ttataataatataaatatt(ATA)4ttattttaataataatatatatttatagataaattaaatattaatatattatattaataatataaaattgataataaatataaa(AT)6c2114921383235Design Primer