Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Tripsacum dactyloides mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_008362(ACTTC)7p53056309035Design Primer
2NC_008362(ATAAG)8p55395543440Design Primer
3NC_008362(TTTGAC)5p6125941262330Design Primer
4NC_008362(ATAAG)3p5127901280415Design Primer
5NC_008362(ATAAGA)36p61494215157216Design Primer
6NC_008362(CTTT)3p4154751548612Design Primer
7NC_008362(TAAGA)11p5188601891455Design Primer
8NC_008362(AGT)4p3232902330112Design Primer
9NC_008362(TAT)4p3251712518212Design Primer
10NC_008362(GATTA)5(TATTA)9c322363230570Design Primer
11NC_008362(TAGAG)10p5325423259150Design Primer
12NC_008362(TCTTTA)28p63904339210168Design Primer
13NC_008362(A)10p1407964080510Design Primer
14NC_008362(AATG)3p4415974160812Design Primer
15NC_008362(AAAG)3p4429454295612Design Primer
16NC_008362(TCTA)3p4463694638012Design Primer
17NC_008362(TAAAG)14p5499415001070Design Primer
18NC_008362(AAGC)3p4519765198712Design Primer
19NC_008362(TACTA)11p5529475300155Design Primer
20NC_008362(A)10p1605796058810Design Primer
21NC_008362(AGTC)3p4616356164612Design Primer
22NC_008362(ACTAA)6p5649666499530Design Primer
23NC_008362(CAAG)3p4661156612612Design Primer
24NC_008362(T)11acttattaaattctctgtcttgctagacacaaatccttcttttcttgtatagacg(A)10c676526772776Design Primer
25NC_008362(ATAGAG)6p6728257286036Design Primer
26NC_008362(CTTG)3p4741987420912Design Primer
27NC_008362(A)10p1747067471510Design Primer
28NC_008362(TAAGTG)4p6769937701624Design Primer
29NC_008362(TATTGG)4p6782717829424Design Primer
30NC_008362(TTAT)3cccaa(CTAAAT)8c789907905465Design Primer
31NC_008362(A)10p1845638457210Design Primer
32NC_008362(TACC)3p4863138632412Design Primer
33NC_008362(CTGA)3p4880838809412Design Primer
34NC_008362(TACTTA)14p6885658864884Design Primer
35NC_008362(AACAA)3p5987789879215Design Primer
36NC_008362(TACTAA)13tactct(TACTAA)12tactct(TACTAA)12c104340104573234Design Primer
37NC_008362(ATAAAA)33p6113270113467198Design Primer
38NC_008362(TAGC)3p412217312218412Design Primer
39NC_008362(TGTT)3p412718512719612Design Primer
40NC_008362(ACCT)4p413021813023316Design Primer
41NC_008362(TATAC)13p513161113167565Design Primer
42NC_008362(TCCAT)7p513861513864935Design Primer
43NC_008362(TATAG)11p514843414848855Design Primer
44NC_008362(T)10agttcgcactgctctttctctctaaattgcatcaaagaaaat(AG)6c15385915392264Design Primer
45NC_008362(GAGC)3p415660015661112Design Primer
46NC_008362(ATGAG)5p515739315741725Design Primer
47NC_008362(TTAAGA)11p616420416426966Design Primer
48NC_008362(TTCTA)7p516543916547335Design Primer
49NC_008362(A)14p117359617360914Design Primer
50NC_008362(TATAA)3p517838217839615Design Primer
51NC_008362(AGTA)3p418487618488712Design Primer
52NC_008362(AAAGT)9p518873918878345Design Primer
53NC_008362(ATG)4p318975818976912Design Primer
54NC_008362(GCAA)3p419505619506712Design Primer
55NC_008362(ATCAA)5p519821219823625Design Primer
56NC_008362(TGAA)3p419913219914312Design Primer
57NC_008362(TACTA)22p5200231200340110Design Primer
58NC_008362(ACC)4p320291620292712Design Primer
59NC_008362(AAGA)3p420305320306412Design Primer
60NC_008362(TCCTTA)3p620452720454418Design Primer
61NC_008362(TGGT)3p420472420473512Design Primer
62NC_008362(AAGTA)34p5205241205410170Design Primer
63NC_008362(TCTAAG)5(TATAAG)19c208023208166144Design Primer
64NC_008362(A)13p121102221103413Design Primer
65NC_008362(T)10p121168421169310Design Primer
66NC_008362(AAGA)3p421464621465712Design Primer
67NC_008362(TAAA)3p422545522546612Design Primer
68NC_008362(AAGA)3p422566322567412Design Primer
69NC_008362(TCTTT)13tgtagtacc(TATTAG)21c230604230803200Design Primer
70NC_008362(ACT)4p323343023344112Design Primer
71NC_008362(ACTC)3p424285924287012Design Primer
72NC_008362(CCATTT)24p6245638245781144Design Primer
73NC_008362(CAA)4p324889324890412Design Primer
74NC_008362(TCGC)3p425958025959112Design Primer
75NC_008362(TAGCCC)7p625987725991842Design Primer
76NC_008362(CTAAGT)15p626131626140590Design Primer
77NC_008362(TTC)4p326202126203212Design Primer
78NC_008362(GGGC)3p426776626777712Design Primer
79NC_008362(CCAA)3p427142727143812Design Primer
80NC_008362(AAGA)3p427647227648312Design Primer
81NC_008362(ACTAA)3p527738927740315Design Primer
82NC_008362(ACAG)3p427786627787712Design Primer
83NC_008362(ACTG)3p427869527870612Design Primer
84NC_008362(CCGG)3p427984327985412Design Primer
85NC_008362(TCT)4p328081228082312Design Primer
86NC_008362(ATTAAG)20p6284210284329120Design Primer
87NC_008362(AAAG)3p428771528772612Design Primer
88NC_008362(TATTA)11p529271029276455Design Primer
89NC_008362(CTTCTG)4p629866329868624Design Primer
90NC_008362(CTT)4p330369430370512Design Primer
91NC_008362(TGAG)3p430763130764212Design Primer
92NC_008362(ACCAT)14p530909730916670Design Primer
93NC_008362(AAGA)3p431060231061312Design Primer
94NC_008362(A)10p131579131580010Design Primer
95NC_008362(TTCTAA)8p631695131699848Design Primer
96NC_008362(TAA)4p331775831776912Design Primer
97NC_008362(ATATA)26p5318911319040130Design Primer
98NC_008362(GAC)4p332538832539912Design Primer
99NC_008362(AATACG)11p632894532901066Design Primer
100NC_008362(TTGG)3p433156033157112Design Primer
101NC_008362(TAAG)3p433519633520712Design Primer
102NC_008362(CAATA)16p533720933728880Design Primer
103NC_008362(AAAGT)6p534480534483430Design Primer
104NC_008362(TATAC)9p534958634963045Design Primer
105NC_008362(ATAGT)18aaagatccgcagtacaggtgtaacagcaatcaagctact(AAGGAA)9c358656358838183Design Primer
106NC_008362(GTAGA)15p536220636228075Design Primer
107NC_008362(TTTGA)12p536540336546260Design Primer
108NC_008362(TTC)4p336616736617812Design Primer
109NC_008362(ACAG)3p436901536902612Design Primer
110NC_008362(TCTTA)3p537550937552315Design Primer
111NC_008362(AAAGT)6p537836637839530Design Primer
112NC_008362(CTATT)3p538007838009215Design Primer
113NC_008362(AAAG)3p438264238265312Design Primer
114NC_008362(TTA)4p338428538429612Design Primer
115NC_008362(TATAAG)3p638556238557918Design Primer
116NC_008362(AAG)4p338889438890512Design Primer
117NC_008362(T)10p139681239682110Design Primer
118NC_008362(TTAGTA)6p639721439724936Design Primer
119NC_008362(CAGA)3p440299940301012Design Primer
120NC_008362(TATAG)26p5411081411210130Design Primer
121NC_008362(AAT)4ataaagatataatata(TAT)5c41149841154043Design Primer
122NC_008362(A)10p141300041300910Design Primer
123NC_008362(CTATGG)3p641738041739718Design Primer
124NC_008362(TAACCT)15p641849941858890Design Primer
125NC_008362(ATAAG)30p5418974419123150Design Primer
126NC_008362(ATGA)3p442244942246012Design Primer
127NC_008362(TACTA)21p5422729422833105Design Primer
128NC_008362(ACTAA)6p542481842484730Design Primer
129NC_008362(TTTCAC)4p643325643327924Design Primer
130NC_008362(TTCC)3p443652343653412Design Primer
131NC_008362(CTGAAA)5p643803243806130Design Primer
132NC_008362(ACGAA)7p543907643911035Design Primer
133NC_008362(TAA)4p344749144750212Design Primer
134NC_008362(TACTA)3taacgcacacgtttcattattgttgctttactat(ATATG)5c44861344868674Design Primer
135NC_008362(TATAG)11p546013446018855Design Primer
136NC_008362(T)10agttcgcactgctctttctctctaaattgcatcaaagaaaat(AG)6c46555946562264Design Primer
137NC_008362(GAGC)3p446830046831112Design Primer
138NC_008362(ATGAG)5p546909346911725Design Primer
139NC_008362(TTAAGA)11p647590447596966Design Primer
140NC_008362(TTCTA)7p547713947717335Design Primer
141NC_008362(A)14p148529648530914Design Primer
142NC_008362(TATAA)3p549008249009615Design Primer
143NC_008362(AGTA)3p449657649658712Design Primer
144NC_008362(AAAGT)9p550043950048345Design Primer
145NC_008362(ATG)4p350145850146912Design Primer
146NC_008362(GCAA)3p450675650676712Design Primer
147NC_008362(ATCAA)5p550991250993625Design Primer
148NC_008362(TGAA)3p451083251084312Design Primer
149NC_008362(TACTA)22p5511931512040110Design Primer
150NC_008362(ACC)4p351461651462712Design Primer
151NC_008362(AAGA)3p451475351476412Design Primer
152NC_008362(TCCTTA)3p651622751624418Design Primer
153NC_008362(TGGT)3p451642451643512Design Primer
154NC_008362(AAGTA)34p5516941517110170Design Primer
155NC_008362(TCTAAG)5(TATAAG)19c519723519866144Design Primer
156NC_008362(A)13p152272252273413Design Primer
157NC_008362(T)10p152338452339310Design Primer
158NC_008362(AAGA)3p452634652635712Design Primer
159NC_008362(TAAA)3p453715553716612Design Primer
160NC_008362(AAGA)3p453736353737412Design Primer
161NC_008362(TCTTT)13tgtagtacc(TATTAG)21c542304542503200Design Primer
162NC_008362(ACT)4p354513054514112Design Primer
163NC_008362(ACTC)3p455455955457012Design Primer
164NC_008362(CCATTT)24p6557338557481144Design Primer
165NC_008362(GAAA)3p456691056692112Design Primer
166NC_008362(ACA)4p356807056808112Design Primer
167NC_008362(TTC)4p357655457656512Design Primer
168NC_008362(GCTT)3p457759957761012Design Primer
169NC_008362(AGGCAG)3p657940657942318Design Primer
170NC_008362(ACTTA)3p558322858324215Design Primer
171NC_008362(T)13p158356658357813Design Primer
172NC_008362(ATCCC)5p558681358683725Design Primer
173NC_008362(ATAGA)15p558798658806075Design Primer
174NC_008362(T)10p159108659109510Design Primer
175NC_008362(TCTT)3p459627359628412Design Primer
176NC_008362(TATGG)14p559771959778870Design Primer
177NC_008362(TATAC)9p559895459899845Design Primer
178NC_008362(TTCTGG)3p660353060354718Design Primer
179NC_008362(CTA)40p3609867609986120Design Primer
180NC_008362(TAATA)14p561045261052170Design Primer
181NC_008362(CACTTT)9p661095961101254Design Primer
182NC_008362(TTTG)3p461165261166312Design Primer
183NC_008362(ATT)4p361234061235112Design Primer
184NC_008362(TTTAG)3p561342661344015Design Primer
185NC_008362(TCCT)3p461395561396612Design Primer
186NC_008362(TAAGTT)6p661547361550836Design Primer
187NC_008362(AG)6p261604661605712Design Primer
188NC_008362(TTCAAT)24p6619816619959144Design Primer
189NC_008362(TCTT)3p462166962168012Design Primer
190NC_008362(ATAGG)9p562478362482745Design Primer
191NC_008362(CTATGG)14p662564662572984Design Primer
192NC_008362(T)10p162727362728210Design Primer
193NC_008362(ACCATA)13p662926062933778Design Primer
194NC_008362(TTAGTT)15p663183963192890Design Primer
195NC_008362(CTTT)3p464330564331612Design Primer
196NC_008362(TGG)4p364385264386312Design Primer
197NC_008362(TTCGT)5p564470064472425Design Primer
198NC_008362(CTTATC)23p6645609645746138Design Primer
199NC_008362(ATAGAA)27p6647756647917162Design Primer
200NC_008362(TGGAT)22p5653291653400110Design Primer
201NC_008362(GTATA)18p565442065450990Design Primer
202NC_008362(GCCCCA)11p665626265632766Design Primer
203NC_008362(AT)6agtgtagttttttgaaggaaatgctgtgaatgaaaaggcttctc(TACTA)3c66448566455571Design Primer
204NC_008362(GGCTT)3p567139267140615Design Primer
205NC_008362(AAG)4p367459767460812Design Primer
206NC_008362(TCGT)3p467939367940412Design Primer
207NC_008362(TACTT)3a(ACTTT)4c68321968325436Design Primer
208NC_008362(A)10p168358368359210Design Primer
209NC_008362(C)10p168541968542810Design Primer
210NC_008362(GCTA)3p468683468684512Design Primer
211NC_008362(ATTGAA)5p670209070211930Design Primer