Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Zea perennis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_008331(ATG)4p31997200812Design Primer
2NC_008331(CAAG)3p47446745712Design Primer
3NC_008331(T)13acttattaaattctctgtcttgctaaacacaaatccttcttttcttgtatagacg(A)10c8988906578Design Primer
4NC_008331(CTTG)3p4155111552212Design Primer
5NC_008331(A)10p1160101601910Design Primer
6NC_008331(TAAGTG)3aacgaaatgctga(TTGC)3c182921833443Design Primer
7NC_008331(TTAT)3p4202862029712Design Primer
8NC_008331(TAC)4p3265182652912Design Primer
9NC_008331(A)10p1302323024110Design Primer
10NC_008331(AGT)10p3330303305930Design Primer
11NC_008331(TCT)4p3355953560612Design Primer
12NC_008331(TTTC)4p4372563727116Design Primer
13NC_008331(CCAGAA)3p6384843850118Design Primer
14NC_008331(CTTTA)19p5388263892095Design Primer
15NC_008331(AT)6p2413564136712Design Primer
16NC_008331(AGT)4p3441474415812Design Primer
17NC_008331(GTATA)3p5474544746815Design Primer
18NC_008331(AAAGCT)3p6486784869518Design Primer
19NC_008331(ATAGT)3p5517685178215Design Primer
20NC_008331(TGGAA)3p5549115492515Design Primer
21NC_008331(AGGC)3p4569005691112Design Primer
22NC_008331(GCGTA)3p5582395825315Design Primer
23NC_008331(CTAGG)3p5600126002615Design Primer
24NC_008331(TACTT)3p5617786179215Design Primer
25NC_008331(CAAG)3p4624766248712Design Primer
26NC_008331(TTC)4p3644876449812Design Primer
27NC_008331(TACTA)5agatgtttcagttcgctaggttgtctct(TGCC)3c678216788565Design Primer
28NC_008331(GAT)4p3770047701512Design Primer
29NC_008331(TTTGA)8p5826928273140Design Primer
30NC_008331(TTC)4p3834368344712Design Primer
31NC_008331(A)11p1867588676811Design Primer
32NC_008331(TATAG)3p5891198913315Design Primer
33NC_008331(ATTC)3p4895358954612Design Primer
34NC_008331(ATAGA)3p5904739048715Design Primer
35NC_008331(TAGA)3p4945459455612Design Primer
36NC_008331(TATAT)11p5988839893755Design Primer
37NC_008331(ATT)4p310007810008912Design Primer
38NC_008331(TCTTTA)3p610608510610218Design Primer
39NC_008331(TTCT)4p410994410995916Design Primer
40NC_008331(TTGGA)3p511142811144215Design Primer
41NC_008331(A)10p111294011294910Design Primer
42NC_008331(ACTTAG)3p611645711647418Design Primer
43NC_008331(TATAGA)4p611734411736724Design Primer
44NC_008331(ACTTT)13p511907211913665Design Primer
45NC_008331(GAAA)3p411943211944312Design Primer
46NC_008331(TTGC)3p412235712236812Design Primer
47NC_008331(GGCC)3p412384212385312Design Primer
48NC_008331(TAGTAC)6p612430012433536Design Primer
49NC_008331(CCAC)3p412550212551312Design Primer
50NC_008331(TATTAC)5t(ATGGAA)8c12597612605479Design Primer
51NC_008331(TTAA)3p412648212649312Design Primer
52NC_008331(GTGA)3p412882112883212Design Primer
53NC_008331(AGGCAG)3p613825813827518Design Primer
54NC_008331(AAG)4p314107214108312Design Primer
55NC_008331(TCATA)3p514164414165815Design Primer
56NC_008331(GTC)4p314248914250012Design Primer
57NC_008331(CT)6p214301514302612Design Primer
58NC_008331(GATAG)5p514705614708025Design Primer
59NC_008331(GTATA)3p515260315261715Design Primer
60NC_008331(ACCCA)17p515300115308585Design Primer
61NC_008331(GCCT)5p415359515361420Design Primer
62NC_008331(ACTAT)9p515479915484345Design Primer
63NC_008331(A)14p115768915770214Design Primer
64NC_008331(TCCAA)4p515858815860720Design Primer
65NC_008331(T)10p116567116568010Design Primer
66NC_008331(T)12p116796616797712Design Primer
67NC_008331(GAAAT)3p516951816953215Design Primer
68NC_008331(CTAC)4p417004317005816Design Primer
69NC_008331(TTATG)5p517021417023825Design Primer
70NC_008331(CTCA)3p417275417276512Design Primer
71NC_008331(AAAG)3p417681517682612Design Primer
72NC_008331(TTGAA)3p517748817750215Design Primer
73NC_008331(AAAG)3p418813818814912Design Primer
74NC_008331(GA)6p219017219018312Design Primer
75NC_008331(A)10p119039119040010Design Primer
76NC_008331(CTTG)3p419185719186812Design Primer
77NC_008331(TTACTT)3p619278319280018Design Primer
78NC_008331(TTTAC)3p519307719309115Design Primer
79NC_008331(CTAAC)4p520027720029620Design Primer
80NC_008331(TTTCC)7p520327920331335Design Primer
81NC_008331(TATGGT)5p620489420492330Design Primer
82NC_008331(A)10p120690120691010Design Primer
83NC_008331(TGCCAT)7p620844020848142Design Primer
84NC_008331(AGCC)3p420928920930012Design Primer
85NC_008331(AAGA)3p421234121235212Design Primer
86NC_008331(ATGGAA)3p621360521362218Design Primer
87NC_008331(ATACA)3p521386621388015Design Primer
88NC_008331(TACTA)7p521407721411135Design Primer
89NC_008331(A)10p121500521501410Design Primer
90NC_008331(CT)6p221784221785312Design Primer
91NC_008331(CCTAT)26p5218199218328130Design Primer
92NC_008331(AGGA)3p421996921998012Design Primer
93NC_008331(TACTT)3p522882822884215Design Primer
94NC_008331(GAA)4p323470823471912Design Primer
95NC_008331(TCAAA)8p523542423546340Design Primer
96NC_008331(ATC)4p324114024115112Design Primer
97NC_008331(TACTT)6p524902024904930Design Primer
98NC_008331(ATAGT)6ata(TATAG)3c24956324961048Design Primer
99NC_008331(ACAG)3p425179725180812Design Primer
100NC_008331(TCTA)4p425300125301616Design Primer
101NC_008331(ATGC)3p425316825317912Design Primer
102NC_008331(CTTT)3p425613325614412Design Primer
103NC_008331(ATCAA)3p525962525963915Design Primer
104NC_008331(GAAA)3p426440426441512Design Primer
105NC_008331(ACA)4p326555626556712Design Primer
106NC_008331(TTC)4p326768326769412Design Primer
107NC_008331(GCAA)3p427338627339712Design Primer
108NC_008331(CTTA)3p427738527739612Design Primer
109NC_008331(TTGG)3p428081628082712Design Primer
110NC_008331(ACCTT)3p528118928120315Design Primer
111NC_008331(CCCCA)3p528455128456515Design Primer
112NC_008331(GATT)3p428565628566712Design Primer
113NC_008331(TGGGA)5p529253629256025Design Primer
114NC_008331(T)10p129808929809810Design Primer
115NC_008331(TCGC)3p430358430359512Design Primer
116NC_008331(TTTCA)3p530504130505515Design Primer
117NC_008331(TACTCA)3p630821530823218Design Primer
118NC_008331(CTAAG)3p531071031072415Design Primer
119NC_008331(ACTAT)3p531203831205215Design Primer
120NC_008331(ATCTAA)3p631249931251618Design Primer
121NC_008331(ATACA)4p531325631327520Design Primer
122NC_008331(GGAT)3p431501831502912Design Primer
123NC_008331(GGCT)3p431785931787012Design Primer
124NC_008331(ACTAC)3p532319132320515Design Primer
125NC_008331(AAAG)3p432539932541012Design Primer
126NC_008331(TTGGA)3p532639432640815Design Primer
127NC_008331(TGAG)3p432835232836312Design Primer
128NC_008331(TATAG)3p534360134361515Design Primer
129NC_008331(TAAA)3p434585934587012Design Primer
130NC_008331(AGT)4p334652034653112Design Primer
131NC_008331(CTTAAT)4p635016035018324Design Primer
132NC_008331(AGA)4p335358535359612Design Primer
133NC_008331(CAGT)3p435569435570512Design Primer
134NC_008331(CTGT)3p435653035654112Design Primer
135NC_008331(TTAGT)3p535700435701815Design Primer
136NC_008331(ATG)4p335746135747212Design Primer
137NC_008331(CAAG)3p436291036292112Design Primer
138NC_008331(A)10p136727836728710Design Primer
139NC_008331(AATG)3p436807936809012Design Primer
140NC_008331(AAAG)3p436942736943812Design Primer
141NC_008331(CTGA)3p437178737179812Design Primer
142NC_008331(TAATA)3p537561237562615Design Primer
143NC_008331(AAAGT)3p537624637626015Design Primer
144NC_008331(TCAAA)3p538349238350615Design Primer
145NC_008331(GAATGG)3p638754438756118Design Primer
146NC_008331(TAAG)3p438911838912912Design Primer
147NC_008331(TCTT)3acctggataatggaacatgctctagaagcccgcttttagaagctttatccgtcgttccagcccctcttgggat(AATGAA)3c391042391144103Design Primer
148NC_008331(TATT)3p439126039127112Design Primer
149NC_008331(TAAGT)3p539425339426715Design Primer
150NC_008331(GACT)3p440173640174712Design Primer
151NC_008331(CTAAT)3p540257240258615Design Primer
152NC_008331(T)10p140278140279010Design Primer
153NC_008331(TTAGT)4p541034541036420Design Primer
154NC_008331(AAT)4ataaagatataatata(TAT)5c41065141069343Design Primer
155NC_008331(A)10p141214641215510Design Primer
156NC_008331(TATAG)3p541324941326315Design Primer
157NC_008331(TATTA)3p541406241407615Design Primer
158NC_008331(AACAA)4p541951341953220Design Primer
159NC_008331(GGAT)3p442111242112312Design Primer
160NC_008331(GGCT)3p442395342396412Design Primer
161NC_008331(ACTAC)3p542928542929915Design Primer
162NC_008331(AAAG)3p443149343150412Design Primer
163NC_008331(TCTTT)3gggtgtagtcggacattccactttgttaag(TTCTT)3c43771943777860Design Primer
164NC_008331(T)10agttcgcactgctctttctctctaaattgcatcaaagaaaat(AG)6c43854843861164Design Primer
165NC_008331(GAGC)3p444131044132112Design Primer
166NC_008331(TTAAG)3p544829444830815Design Primer
167NC_008331(TTCTA)3p545009845011215Design Primer
168NC_008331(TTCTAT)3p645169645171318Design Primer
169NC_008331(TAGCC)3p545199045200415Design Primer
170NC_008331(C)10p145406845407710Design Primer
171NC_008331(AAAG)3p445598645599712Design Primer
172NC_008331(TCTTAT)24p6456309456452144Design Primer
173NC_008331(GTATTC)3p646419046420718Design Primer
174NC_008331(TACTA)12p546443246449160Design Primer
175NC_008331(ATACA)3p546997346998715Design Primer
176NC_008331(TAGC)3gtttttaa(GCTG)3c47115447118532Design Primer
177NC_008331(G)12p147258247259312Design Primer
178NC_008331(T)11p147442047443011Design Primer
179NC_008331(AACG)3p447865847866912Design Primer
180NC_008331(AACTT)3p548022748024115Design Primer
181NC_008331(TTC)6p348516248517918Design Primer
182NC_008331(GCTT)3p448620348621412Design Primer
183NC_008331(TTCT)3p449033249034312Design Primer
184NC_008331(TGTT)3p449280349281412Design Primer
185NC_008331(ATAAGG)3p649889149890818Design Primer
186NC_008331(CTCTCG)3p650104450106118Design Primer
187NC_008331(ACT)4p350340350341412Design Primer
188NC_008331(TATAG)4p550359150361020Design Primer
189NC_008331(TAG)4p350374050375112Design Primer
190NC_008331(TATCTA)19p6504796504909114Design Primer
191NC_008331(TAAGGA)3p650525250526918Design Primer
192NC_008331(GATAAA)3p650791350793018Design Primer
193NC_008331(GTAGA)3p550865550866915Design Primer
194NC_008331(T)10p151098751099610Design Primer
195NC_008331(CCGAT)7p551543851547235Design Primer
196NC_008331(CTC)4gttgttgccgtggagaaagaccgtattcacgtctagttgaaatagatgcaagtcctcggccgc(TACTA)14c516030516174145Design Primer
197NC_008331(CTTG)3p451717551718612Design Primer
198NC_008331(ACTAA)3p551815851817215Design Primer
199NC_008331(TACTA)5p551887951890325Design Primer
200NC_008331(TTCTC)3p552480352481715Design Primer
201NC_008331(TAGGGT)16p653351853361396Design Primer
202NC_008331(TAA)4p353380553381612Design Primer
203NC_008331(TACTA)4taacgcacacgtttcattattgttgctttactat(ATATG)3c53491053497869Design Primer
204NC_008331(ACC)4p353658753659812Design Primer
205NC_008331(AAGA)4p453672453673916Design Primer
206NC_008331(TTCCTT)3p653820553822218Design Primer
207NC_008331(TGGT)3p453840453841512Design Primer
208NC_008331(AAGTA)4p553893653895520Design Primer
209NC_008331(GCCC)3p454261954263012Design Primer
210NC_008331(GAAAT)3p554765254766615Design Primer
211NC_008331(ATTTC)3attt(AGTAG)7c54838054843354Design Primer
212NC_008331(T)11p154929754930711Design Primer
213NC_008331(GAA)4p355261855262912Design Primer
214NC_008331(TCAAA)8p555333455337340Design Primer
215NC_008331(ATC)4p355905055906112Design Primer
216NC_008331(GTA)4p356691156692212Design Primer