Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Zea mays subsp. mays mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_007982(CTCTA)4p54498451720Design Primer
2NC_007982(ATTTC)3p55247526115Design Primer
3NC_007982(ACGAG)3p55390540415Design Primer
4NC_007982(ATC)4p3125211253212Design Primer
5NC_007982(ATAAGG)3p6165561657318Design Primer
6NC_007982(CTCTCG)3p6186961871318Design Primer
7NC_007982(ATAGA)3taggtatctctgtggatagagataaagatagggatccctcgaaatatatggaaaaagtgcacttttt(TAC)4c209812107494Design Primer
8NC_007982(TATAG)3p5212522126615Design Primer
9NC_007982(TAG)4p3213682137912Design Primer
10NC_007982(TCATA)6p5266762670530Design Primer
11NC_007982(GTC)4p3275372754812Design Primer
12NC_007982(CT)6p2280642807512Design Primer
13NC_007982(TAGC)3p4313903140112Design Primer
14NC_007982(ATGAGT)3p6345663458318Design Primer
15NC_007982(GGAT)3p4430294304012Design Primer
16NC_007982(ACTAC)3p5512395125315Design Primer
17NC_007982(AAAG)3p4534285343912Design Primer
18NC_007982(CTGA)3p4656836569412Design Primer
19NC_007982(TAATA)3p5694696948315Design Primer
20NC_007982(AAAGT)3p5701137012715Design Primer
21NC_007982(A)10p1768667687510Design Primer
22NC_007982(C)10p1787017871010Design Primer
23NC_007982(GCTA)3p4801128012312Design Primer
24NC_007982(ATAGT)5p5867858680925Design Primer
25NC_007982(AATACG)3p6870358705218Design Primer
26NC_007982(TA)6p2926029261312Design Primer
27NC_007982(TAAGA)4p5933029332120Design Primer
28NC_007982(ATAAGA)4p6947949481724Design Primer
29NC_007982(CTTT)3p4951249513512Design Primer
30NC_007982(G)10p1970309703910Design Primer
31NC_007982(ATAGAA)3p6993899940618Design Primer
32NC_007982(CTTAA)3p510280910282315Design Primer
33NC_007982(GCTC)3p410978710979812Design Primer
34NC_007982(CT)6attttctttgatgcaatttagagagaaagagcagtgcgaact(A)10c11250211256564Design Primer
35NC_007982(AAAAG)3p511332911334315Design Primer
36NC_007982(CTTT)3p411958111959212Design Primer
37NC_007982(TGTAG)3p512176612178015Design Primer
38NC_007982(CATC)3p412997912999012Design Primer
39NC_007982(TTAGAT)3p613249213250918Design Primer
40NC_007982(CTATA)3p513281613283015Design Primer
41NC_007982(ATAGT)3p513295613297015Design Primer
42NC_007982(GATT)3p413833713834812Design Primer
43NC_007982(TTTGC)3p514687414688815Design Primer
44NC_007982(T)10p115582515583410Design Primer
45NC_007982(A)10p116180216181110Design Primer
46NC_007982(AATG)3p416260316261412Design Primer
47NC_007982(CTGA)3p416630316631412Design Primer
48NC_007982(TAATA)3p517008917010315Design Primer
49NC_007982(AAAGT)3p517073317074715Design Primer
50NC_007982(GAATGG)3p618206318208018Design Primer
51NC_007982(TAAG)3p418364718365812Design Primer
52NC_007982(TCTT)3p418557018558112Design Primer
53NC_007982(TATT)3p418578118579212Design Primer
54NC_007982(TAAGT)5p518877318879725Design Primer
55NC_007982(GACT)3p419629419630512Design Primer
56NC_007982(T)10p119734019734910Design Primer
57NC_007982(TTTAG)5p520412020414425Design Primer
58NC_007982(GAAA)3p420774920776012Design Primer
59NC_007982(ACA)4p320891620892712Design Primer
60NC_007982(TTC)4p321105021106112Design Primer
61NC_007982(GCAA)3p421673821674912Design Primer
62NC_007982(CTTA)3p422072722073812Design Primer
63NC_007982(TCCTG)3p522672922674315Design Primer
64NC_007982(TATAT)4p523194523196420Design Primer
65NC_007982(ATT)4p323310523311612Design Primer
66NC_007982(ATCAA)3p523566923568315Design Primer
67NC_007982(AGA)4p324164224165312Design Primer
68NC_007982(CAGT)3p424374224375312Design Primer
69NC_007982(CTGT)3p424457624458712Design Primer
70NC_007982(TTAGT)3p524505024506415Design Primer
71NC_007982(CTCTA)4p524800824802720Design Primer
72NC_007982(ATTTC)3p524875724877115Design Primer
73NC_007982(ACGAG)3p524890024891415Design Primer
74NC_007982(TGGC)3p425146925148012Design Primer
75NC_007982(CAAT)3(CAATC)4*c*25992625995328Design Primer
76NC_007982(ACTAC)3p526453426454815Design Primer
77NC_007982(TACTAG)3p626507426509118Design Primer
78NC_007982(AAG)4p326520926522012Design Primer
79NC_007982(TCTTTA)3p626589126590818Design Primer
80NC_007982(TTCT)3p426975526976612Design Primer
81NC_007982(TTGGA)3p527124627126015Design Primer
82NC_007982(A)10p127276327277210Design Primer
83NC_007982(ACTTAG)3p627628727630418Design Primer
84NC_007982(TATAGA)3p627717927719618Design Primer
85NC_007982(ACTTT)3p527889227890615Design Primer
86NC_007982(GAAA)3p427919727920812Design Primer
87NC_007982(TTGC)3p428212628213712Design Primer
88NC_007982(TAGTAC)3p628407528409218Design Primer
89NC_007982(TATTAC)4t(ATGGAA)4c28575928580749Design Primer
90NC_007982(GTGA)3p428857928859012Design Primer
91NC_007982(TAGTAC)3p629697929699618Design Primer
92NC_007982(AATTC)3p529753729755115Design Primer
93NC_007982(GATA)3p429899229900312Design Primer
94NC_007982(AGTAT)3p529952929954315Design Primer
95NC_007982(ATCAT)3p529976529977915Design Primer
96NC_007982(TTTCAC)3p630563630565318Design Primer
97NC_007982(GTA)4p330786430787512Design Primer
98NC_007982(GGGCC)3p531236831238215Design Primer
99NC_007982(ATAA)3p431412331413412Design Primer
100NC_007982(GCAA)3tcagcatttcgtt(CACTTA)3c31608231612443Design Primer
101NC_007982(ATCCT)4p531640631642520Design Primer
102NC_007982(T)10p131843331844210Design Primer
103NC_007982(CGGC)3p432306232307312Design Primer
104NC_007982(T)10p132540932541810Design Primer
105NC_007982(T)10p133581833582710Design Primer
106NC_007982(TCTAT)3p533687833689215Design Primer
107NC_007982(TATAG)4p534112134114020Design Primer
108NC_007982(CCTGG)3p534185234186615Design Primer
109NC_007982(TAAA)3p434339034340112Design Primer
110NC_007982(AGT)4p334405134406212Design Primer
111NC_007982(T)10p134891034891910Design Primer
112NC_007982(ATAGT)4p535254035255920Design Primer
113NC_007982(GCCT)3p435481235482312Design Primer
114NC_007982(ATTCC)3p535679735681115Design Primer
115NC_007982(TAGCTT)3p636303836305518Design Primer
116NC_007982(ACT)4p336759536760612Design Primer
117NC_007982(TA)6p237039737040812Design Primer
118NC_007982(TATAG)3p537187037188415Design Primer
119NC_007982(GTAAA)6p537287537290430Design Primer
120NC_007982(TTCTGG)3p637323037324718Design Primer
121NC_007982(AGAA)3p437446237447312Design Primer
122NC_007982(AGA)4p337611037612112Design Primer
123NC_007982(CTCCA)3p537639037640415Design Primer
124NC_007982(CTA)6p337864737866418Design Primer
125NC_007982(TTTG)3p438023638024712Design Primer
126NC_007982(TTTC)3p438035038036112Design Primer
127NC_007982(ATT)4p338090338091412Design Primer
128NC_007982(TTAGT)4(ATAGT)5c38197738202145Design Primer
129NC_007982(TCCT)3p438254038255112Design Primer
130NC_007982(ATAGG)8p538420238424140Design Primer
131NC_007982(AG)6p238459338460412Design Primer
132NC_007982(T)10p138746538747410Design Primer
133NC_007982(TATAG)7p538835838839235Design Primer
134NC_007982(TTCCAT)3p638883938885618Design Primer
135NC_007982(TCTT)3p439011439012512Design Primer
136NC_007982(ATGGG)3p539218439219815Design Primer
137NC_007982(ATGGCA)3p639398539400218Design Primer
138NC_007982(ACCATA)5p639750339753230Design Primer
139NC_007982(GTTAG)3p540211240212615Design Primer
140NC_007982(GTAAA)3p540932840934215Design Primer
141NC_007982(AAAGTA)3p640962540964218Design Primer
142NC_007982(CAAG)3p441055841056912Design Primer
143NC_007982(T)10p141203141204010Design Primer
144NC_007982(TC)6p241224841225912Design Primer
145NC_007982(CTTT)3p441424341425412Design Primer
146NC_007982(GCGTA)3p542069342070715Design Primer
147NC_007982(CCTTC)3cc(TTATAG)3c42514242517635Design Primer
148NC_007982(TTC)4p342697142698212Design Primer
149NC_007982(CCTGC)3p543012643014015Design Primer
150NC_007982(TACTA)4p543032743034620Design Primer
151NC_007982(AGCT)3p443282143283212Design Primer
152NC_007982(TAG)4p343326443327512Design Primer
153NC_007982(TATCTA)7p643432143436242Design Primer
154NC_007982(TAAGGA)5p643469243472130Design Primer
155NC_007982(GATAAA)3p643736143737818Design Primer
156NC_007982(GTAGA)3p543809043810415Design Primer
157NC_007982(AGGA)3p443985143986212Design Primer
158NC_007982(T)10p144042444043310Design Primer
159NC_007982(TTCAA)3p544588344589715Design Primer
160NC_007982(CTTT)3p444656144657212Design Primer
161NC_007982(TGAG)3p445063445064512Design Primer
162NC_007982(TACTT)3p545587745589115Design Primer
163NC_007982(ATAGT)3p545640545641915Design Primer
164NC_007982(ACAG)3p445863345864412Design Primer
165NC_007982(TCTA)4p445982645984116Design Primer
166NC_007982(TGAG)3tccactgtttacgttacaactagcagtagcgtgtcaattctagtcagaaaaaaagctttccattgattcatgata(GTGCC)3c462915463016102Design Primer
167NC_007982(ACCTT)3p546464646466015Design Primer
168NC_007982(AAGC)3p446650246651312Design Primer
169NC_007982(GAA)6p346753346755018Design Primer
170NC_007982(CTATA)3p546973146974515Design Primer
171NC_007982(TAAGT)3p547249447250815Design Primer
172NC_007982(TCGT)3p447405647406712Design Primer
173NC_007982(TGGAT)3p547541547542915Design Primer
174NC_007982(TGAA)3p447579647580712Design Primer
175NC_007982(CTATA)3p547620547621915Design Primer
176NC_007982(T)12p147857647858712Design Primer
177NC_007982(GAA)4p348189748190812Design Primer
178NC_007982(TCAAA)3p548261348262715Design Primer
179NC_007982(CTTTA)3p548354548355915Design Primer
180NC_007982(CTC)4gttgttgccgtggagaaagaccgtattcacgtctagttgaaatagatgcaagtcctcggccgc(TACTA)5c484968485067100Design Primer
181NC_007982(GAAAT)3p548552648554015Design Primer
182NC_007982(ACTAA)3p548708748710115Design Primer
183NC_007982(TACTA)4p548779648781520Design Primer
184NC_007982(TTCT)3p449442849443912Design Primer
185NC_007982(TGTT)3p449689449690512Design Primer
186NC_007982(TAGGGT)6p650164650168136Design Primer
187NC_007982(TAA)4p350187350188412Design Primer
188NC_007982(TACTA)4taacgcacacgtttcattattgttgctttactat(ATATG)3c50297350304169Design Primer
189NC_007982(ACC)4p350464550465612Design Primer
190NC_007982(AAGA)3p450478250479312Design Primer
191NC_007982(TTCCTT)3p650625950627618Design Primer
192NC_007982(TGGT)3p450646350647412Design Primer
193NC_007982(AAGTA)3p550699050700415Design Primer
194NC_007982(GCCC)3p451067151068212Design Primer
195NC_007982(TAGA)3p451835051836112Design Primer
196NC_007982(AGAA)3p452048852049912Design Primer
197NC_007982(CAGATA)3p652163552165218Design Primer
198NC_007982(TACTT)3p552481452482815Design Primer
199NC_007982(ATAGT)3p552534252535615Design Primer
200NC_007982(ACAG)3p452757052758112Design Primer
201NC_007982(TCTA)4p452876352877816Design Primer
202NC_007982(TGAG)3tccactgtttacgttacaactagcagtagcgtgtcaattctagtcagaaaaaaagctttccattgattcatgata(GTGCC)3c531852531953102Design Primer
203NC_007982(ACCTT)3p553358353359715Design Primer
204NC_007982(AAGC)3p453543953545012Design Primer
205NC_007982(GAA)6p353647053648718Design Primer
206NC_007982(CTT)4p353895653896712Design Primer
207NC_007982(ATAGTA)6p654093254096736Design Primer
208NC_007982(TCGC)3p454358454359512Design Primer
209NC_007982(T)10p154873354874210Design Primer
210NC_007982(ATA)5tatattatatcttta(TAT)4c55019655023742Design Primer
211NC_007982(ACTAA)3p555052555053915Design Primer
212NC_007982(CTATA)3p555151255152615Design Primer
213NC_007982(ATG)4p356272656273712Design Primer
214NC_007982(T)12p156619256620312Design Primer