Compound Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_004309 | (T)10atctcaaatattgtggatattaaaccaaaaaatat(AATAA)3 | c | 3082 | 3141 | 60 | Design Primer |
| 2 | NC_004309 | (AATA)3tttttataaatttttaatttt(AATA)3tttttataaatttttaatttt(AATA)3tttttataaattttaatttttataaataattatataaatattctaaactgtacacaatttatatatttattaatataaatatca(AT)6ttattaatataaatatatgaatttaaaaataatgtat(TAAA)3 | c | 7146 | 7368 | 223 | Design Primer |
| 3 | NC_004309 | (TATTT)3tattatttatattgctattaattatttaaagagattattttatttaa(ATTT)3ttaatattaga(ATTT)3ttaatattaga(ATTT)3 | c | 18960 | 19079 | 120 | Design Primer |
| 4 | NC_004309 | (AT)6tttaattattaattataatttttataaattttataaatttttatttttattaatttttattttttatttattaacgata(AT)6 | c | 26759 | 26861 | 103 | Design Primer |
| 5 | NC_004309 | (TAAAA)3attaataatataaatattaaaagttaatagtatataatagaattacaaattttgataggtttaataaattaagtaaattaataaaaattaat(TAAAA)3ataaaat(TAAAA)3ataaattatgtaaatattaaagttaatagtatataatagaattacaaattttgataa(ATAAT)4 | c | 30872 | 31092 | 221 | Design Primer |
| 6 | NC_004309 | (AATAA)3ataaaaaaattaattatatttttaatataaattttttaatagaatttaatct(AATA)4atatttatataattataatataaataaatatatataataaaaataatatttatatatttataaaataaaaat(AATAA)3ataaaaaaattaattatattttaaatatagattttttaatagaattaaatagaatttaatct(AATA)6ataaaatatattatataaaaaataatatttatataaataaaaataaaa(AAT)4 | c | 31243 | 31558 | 316 | Design Primer |
| 7 | NC_004309 | (TTAT)3aatata(TTAT)3aatatttatttatatatt(ATA)4attcttaaatttataataatatattaatttatatacttcattatatatttttatatatatt(ATA)4 | c | 34888 | 35020 | 133 | Design Primer |
| 8 | NC_004309 | (ATATT)3ttaatatttatttttataatattatatttttaaataaattatattttaatatttatttttataatattatatttttaaataatattatatttta(ATATT)3 | c | 37769 | 37892 | 124 | Design Primer |
| 9 | NC_004309 | (TAA)4atattagtattttataaaaatgatactcaacaaaaaaatt(AATA)3 | c | 46051 | 46114 | 64 | Design Primer |
| 10 | NC_004309 | (AATA)3ttaatttaataaaaaatataatc(AATAA)3a(AAAT)3aaaataaatatttataaat(TAAA)3 | c | 46795 | 46888 | 94 | Design Primer |
| 11 | NC_004309 | (AATAA)3a(AAAT)3aaaataaattaaattaattaataataattaaatatatattattaaaatt(AATAA)3a(AAAT)3aaaataaat(TAAA)3 | c | 52394 | 52519 | 126 | Design Primer |
| 12 | NC_004309 | (TATAT)3aaaaaatattaaaaatataaaaaatattaaaaaaataaat(TAAA)3atattatatataaaattattaattattcatgaaatatattctttaatattctattttt(AATA)3ttaat(TTAA)3 | c | 54431 | 54584 | 154 | Design Primer |
| 13 | NC_004309 | (TAATAT)3t(TAAAA)3 | c | 62533 | 62566 | 34 | Design Primer |
| 14 | NC_004309 | (A)10tatattt(ATAAAA)3aataaaatttttataaaaataaaaaaaata(AAAAT)3 | c | 62673 | 62752 | 80 | Design Primer |
| 15 | NC_004309 | (ATT)4aaatatattatttcaaaattcatattaggtatataactaataaaaataatttttaatatttaatataat(AAATA)3aaaatttaaattttataaaat(TAAATA)3 | c | 64251 | 64385 | 135 | Design Primer |
| 16 | NC_004309 | (AATA)3aaaataaat(TAAA)3 | c | 72094 | 72126 | 33 | Design Primer |
| 17 | NC_004309 | (ATAA)3aatataaaataaaat(ATAAA)3 | c | 73436 | 73477 | 42 | Design Primer |