ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Agrotis ipsilon mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022185	TTTAT	3	130	144	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_022185	T	14	255	268	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53320708
3	NC_022185	TAT	5	706	720	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320708
4	NC_022185	AATT	5	961	980	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320708
5	NC_022185	ATT	4	1031	1043	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320708
6	NC_022185	AT	6	1059	1070	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320708
7	NC_022185	T	14	1252	1265	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53320708
8	NC_022185	AATT	3	1562	1572	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320708
9	NC_022185	TAT	4	2042	2053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320708
10	NC_022185	GAAA	3	2249	2260	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53320708
11	NC_022185	ATT	4	2865	2877	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320708
12	NC_022185	AATT	3	3281	3293	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320708
13	NC_022185	AATT	3	3737	3747	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320708
14	NC_022185	AT	18	3828	3864	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_022185	ATT	4	3903	3914	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_022185	AATT	4	3949	3964	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320708
17	NC_022185	T	22	3963	3984	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	53320708
18	NC_022185	TAA	4	4042	4053	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320708
19	NC_022185	TAT	4	4647	4658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320708
20	NC_022185	TAT	5	6020	6034	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_022185	ATT	4	6436	6447	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320709
22	NC_022185	TAAA	3	6461	6472	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	53320709
23	NC_022185	AATT	3	6479	6489	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320709
24	NC_022185	A	13	7000	7012	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	53320709
25	NC_022185	TTA	4	7286	7297	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320709
26	NC_022185	ATA	7	7391	7411	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320709
27	NC_022185	TAA	4	7425	7436	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320709
28	NC_022185	TGAA	3	7479	7489	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320709
29	NC_022185	TAAA	3	7759	7770	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320709
30	NC_022185	TAA	4	7829	7841	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320709
31	NC_022185	TAA	4	8037	8047	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320709
32	NC_022185	AAAT	4	8103	8118	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	53320709
33	NC_022185	ATTAAT	3	8401	8418	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	53320709
34	NC_022185	ATC	4	8519	8530	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320709
35	NC_022185	AATT	3	8796	8808	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320709
36	NC_022185	AT	7	9014	9027	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320709
37	NC_022185	TAAA	3	9042	9052	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320709
38	NC_022185	AAAT	3	9126	9136	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320709
39	NC_022185	AAAAT	3	9215	9228	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	53320709
40	NC_022185	TA	7	9255	9267	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320709
41	NC_022185	AT	6	9404	9414	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320709
42	NC_022185	AT	7	9697	9711	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320709
43	NC_022185	A	13	9738	9750	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	53320709
44	NC_022185	TTAT	3	10211	10222	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53320709
45	NC_022185	AT	7	10315	10330	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320709
46	NC_022185	TTTA	3	10390	10400	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320709
47	NC_022185	ATA	4	10457	10468	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320709
48	NC_022185	ATTAAT	3	10543	10559	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320709
49	NC_022185	T	14	10846	10859	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53320709
50	NC_022185	TTA	4	11142	11152	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320709
51	NC_022185	TAA	5	11151	11165	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320709
52	NC_022185	TTA	4	11171	11182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320709
53	NC_022185	TAT	5	11278	11291	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320709
54	NC_022185	ATT	5	11573	11586	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320709
55	NC_022185	TTA	4	11620	11630	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320709
56	NC_022185	ATTAA	3	11715	11729	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	53320709
57	NC_022185	CTAAT	3	12156	12171	16	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	53320709
58	NC_022185	TAAAA	3	12409	12422	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	53320709
59	NC_022185	TAAAT	4	12427	12446	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	53320709
60	NC_022185	TAA	4	12447	12457	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320709
61	NC_022185	TA	14	12816	12842	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_022185	TTTA	3	12852	12862	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_022185	ATTTA	4	12885	12904	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
64	NC_022185	AAAT	3	13220	13231	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022185	TTTTA	3	13305	13319	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_022185	ATAA	4	13647	13662	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_022185	AATT	4	13810	13825	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_022185	AATT	3	14098	14109	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_022185	TTA	4	14163	14174	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_022185	AATT	3	14177	14187	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_022185	AATT	3	14198	14209	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022185	AAATT	3	14375	14389	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_022185	T	26	15069	15094	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_022185	ATTA	3	15213	15225	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_022185	TA	7	15249	15264	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_022185	AT	14	15283	15308	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Agrotis ipsilon mitochondrion