ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Thraustotheca clavata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022179	ATA	4	2693	2705	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331040
2	NC_022179	ATT	4	2794	2804	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331038
3	NC_022179	TAA	4	3040	3050	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331038
4	NC_022179	ATA	4	3208	3218	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331038
5	NC_022179	TAA	4	3346	3357	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331038
6	NC_022179	TAA	4	3361	3372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331038
7	NC_022179	CAA	4	3375	3386	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53331038
8	NC_022179	ATA	4	5569	5580	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331039
9	NC_022179	TAT	4	11322	11333	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_022179	TAA	4	13013	13023	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_022179	ATA	5	14259	14274	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_022179	ATT	4	15021	15032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331038
13	NC_022179	TTA	4	15936	15946	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331040
14	NC_022179	TTA	4	16729	16741	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53331040
15	NC_022179	ATA	4	16794	16805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331040
16	NC_022179	ATA	4	18684	18694	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_022179	ATT	4	18823	18834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331037
18	NC_022179	AAT	4	18919	18930	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331037
19	NC_022179	ACA	4	20027	20038	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53331037
20	NC_022179	ATT	4	20360	20370	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_022179	TAA	4	20997	21007	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331039
22	NC_022179	TAT	4	21667	21677	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_022179	TAA	6	21886	21902	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53331039
24	NC_022179	TAA	4	25637	25648	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331038
25	NC_022179	TAA	4	25784	25794	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_022179	TAA	4	26634	26644	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331038
27	NC_022179	TAT	4	27004	27015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331038
28	NC_022179	TAA	4	27371	27382	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331040
29	NC_022179	ATA	5	29456	29470	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53331039
30	NC_022179	TTA	4	29980	29991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331038
31	NC_022179	ATA	8	30131	30154	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331038
32	NC_022179	TAT	4	32469	32480	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331037
33	NC_022179	TAT	4	33033	33043	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331037
34	NC_022179	TAT	4	33720	33730	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331037
35	NC_022179	AAT	4	33934	33946	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_022179	TTA	4	34432	34442	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331038
37	NC_022179	AAT	4	35003	35015	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331039
38	NC_022179	ATT	5	35631	35645	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_022179	TAT	4	37074	37085	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331037
40	NC_022179	TGG	4	37162	37173	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53331037
41	NC_022179	AAT	4	38272	38283	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331037
42	NC_022179	ATT	4	39370	39381	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331037
43	NC_022179	TAT	4	39567	39578	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331037
44	NC_022179	TAA	4	39996	40008	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331040
45	NC_022179	ATA	4	40295	40305	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_022179	AAT	4	40788	40798	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331040
47	NC_022179	TAA	4	41572	41583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331038
48	NC_022179	TAT	5	42328	42343	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_022179	ATA	4	45269	45280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_022179	AAT	4	47045	47055	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Thraustotheca clavata mitochondrion