ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Thraustotheca clavata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022179	ATTT	3	1182	1193	12	25 %	75 %	0 %	8 %	53331037
2	NC_022179	AAAT	3	2870	2880	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331038
3	NC_022179	TAAT	3	4279	4290	12	50 %	50 %	0 %	8 %	53331039
4	NC_022179	AATA	3	5716	5726	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331039
5	NC_022179	AATT	3	6158	6168	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_022179	TTTA	3	7459	7469	11	25 %	75 %	0 %	9 %	53331041
7	NC_022179	AATA	3	10078	10088	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_022179	TATT	3	11897	11908	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022179	TTTA	3	12133	12144	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_022179	TTAA	3	12151	12162	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_022179	TTTA	3	16905	16915	11	25 %	75 %	0 %	9 %	53331040
12	NC_022179	TAAA	3	17273	17283	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_022179	AATA	3	17957	17969	13	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_022179	AATT	3	18662	18672	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_022179	ATAA	3	19450	19460	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331037
16	NC_022179	TACA	3	19642	19653	12	50 %	25 %	25 %	8 %	53331037
17	NC_022179	TAAA	3	20257	20267	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_022179	AATT	3	20853	20863	11	50 %	50 %	0 %	9 %	53331039
19	NC_022179	ATTT	3	22624	22635	12	25 %	75 %	0 %	0 %	53331039
20	NC_022179	CCAT	3	23003	23014	12	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
21	NC_022179	TTAA	3	23613	23624	12	50 %	50 %	0 %	8 %	53331040
22	NC_022179	TAAA	3	25015	25025	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331038
23	NC_022179	ATTT	3	25069	25080	12	25 %	75 %	0 %	8 %	53331038
24	NC_022179	AATT	3	27101	27112	12	50 %	50 %	0 %	8 %	53331038
25	NC_022179	AATT	4	27489	27504	16	50 %	50 %	0 %	6 %	53331040
26	NC_022179	AAAT	3	28155	28165	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331040
27	NC_022179	TAAA	3	28306	28318	13	75 %	25 %	0 %	7 %	53331040
28	NC_022179	TATT	4	28498	28513	16	25 %	75 %	0 %	6 %	53331040
29	NC_022179	AAAT	3	29753	29764	12	75 %	25 %	0 %	8 %	53331038
30	NC_022179	TAAA	3	30269	30279	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331038
31	NC_022179	ATTT	3	32199	32210	12	25 %	75 %	0 %	8 %	53331039
32	NC_022179	TATT	3	32313	32323	11	25 %	75 %	0 %	9 %	53331039
33	NC_022179	AATT	3	32445	32457	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_022179	TTAT	5	32941	32959	19	25 %	75 %	0 %	5 %	53331037
35	NC_022179	AATT	3	33630	33640	11	50 %	50 %	0 %	9 %	53331037
36	NC_022179	TTTA	3	34948	34959	12	25 %	75 %	0 %	8 %	53331039
37	NC_022179	TTAT	3	37736	37746	11	25 %	75 %	0 %	9 %	53331037
38	NC_022179	TTTA	3	37996	38007	12	25 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_022179	AATT	3	38037	38047	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_022179	TTTA	3	39453	39463	11	25 %	75 %	0 %	9 %	53331037
41	NC_022179	TAAA	3	39819	39829	11	75 %	25 %	0 %	9 %	53331040
42	NC_022179	ACCT	3	43548	43559	12	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
43	NC_022179	TAAA	3	44458	44469	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_022179	AAAT	3	44693	44704	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022179	TTTA	3	46512	46522	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Thraustotheca clavata mitochondrion