ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida chauliodes strain NRRL Y-27909 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022176	ATA	4	823	834	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_022176	ATT	4	1965	1975	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_022176	TAT	4	3706	3717	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320699
4	NC_022176	TAA	4	4766	4780	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_022176	AAT	4	5763	5773	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320699
6	NC_022176	ATA	4	5788	5800	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320699
7	NC_022176	ATA	6	6199	6217	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_022176	ATA	5	6414	6427	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_022176	TAT	4	7842	7852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_022176	ATA	5	8152	8165	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_022176	ATA	5	8335	8348	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_022176	TTA	4	8746	8756	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_022176	TAT	4	10765	10775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_022176	AGT	4	11141	11152	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_022176	ATA	5	11417	11431	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_022176	TTA	4	11567	11579	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_022176	TAA	4	12032	12044	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_022176	ATA	4	12709	12719	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_022176	AAT	5	12726	12739	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_022176	ATA	4	12768	12778	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_022176	ATA	4	12813	12823	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_022176	TAA	5	13565	13579	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022176	ATA	4	13581	13593	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_022176	ATA	6	13600	13618	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_022176	AAT	5	14004	14017	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_022176	GTA	4	14337	14348	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022176	TAA	4	14422	14434	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_022176	TAA	4	14657	14669	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_022176	ATA	4	14833	14843	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_022176	AAT	4	15571	15581	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_022176	TTA	4	16157	16168	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_022176	AAT	5	16434	16447	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_022176	ATA	4	17701	17711	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_022176	TCT	4	17836	17847	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022176	ATT	4	18699	18710	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022176	TAT	4	18921	18933	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_022176	TAT	4	18962	18972	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_022176	TAT	4	19357	19368	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_022176	TAA	4	20226	20237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320698
40	NC_022176	TAA	4	20649	20659	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320698
41	NC_022176	ATT	4	21323	21333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320698
42	NC_022176	AGA	4	23139	23149	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53320698
43	NC_022176	TAT	5	23550	23564	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320698
44	NC_022176	ATA	4	26873	26883	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_022176	ATA	5	27648	27662	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_022176	AAT	4	27822	27832	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_022176	ATA	4	28107	28118	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_022176	ATT	4	28840	28852	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_022176	TAT	4	29080	29092	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_022176	TAT	4	29107	29117	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_022176	ATT	4	29253	29264	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_022176	AGA	4	29564	29574	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_022176	ATA	4	31782	31792	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_022176	TAA	4	31972	31984	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_022176	TAC	4	32487	32497	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_022176	TAT	4	33090	33101	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022176	TAT	4	33325	33336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_022176	TAT	5	33417	33431	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_022176	TAT	6	33500	33520	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_022176	TAA	4	34078	34089	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_022176	ATA	4	34631	34641	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320698
62	NC_022176	TAT	5	35855	35868	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_022176	TAT	4	37471	37481	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_022176	TAT	4	37507	37517	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_022176	ATT	4	37711	37721	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_022176	TAT	4	38364	38374	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_022176	TAT	4	38409	38421	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_022176	ATA	4	38660	38671	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_022176	ATA	4	39147	39157	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320698
70	NC_022176	TAT	4	39409	39419	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320698
71	NC_022176	AAG	4	39588	39599	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53320698
72	NC_022176	CAT	4	39786	39797	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320698
73	NC_022176	ATA	4	41787	41799	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_022176	TAA	4	42082	42092	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_022176	AAT	4	42549	42560	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_022176	TAA	4	42879	42890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_022176	ATA	4	44471	44483	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_022176	TAT	4	44639	44651	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_022176	TAT	7	45134	45154	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_022176	TAT	4	46926	46937	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_022176	ATA	4	47349	47360	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320698
82	NC_022176	TAA	4	48031	48042	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320698
83	NC_022176	TAT	5	49474	49487	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_022176	TTA	4	49490	49503	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_022176	TAT	4	49700	49712	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_022176	TAA	4	50136	50147	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_022176	TAT	4	51190	51200	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_022176	TAT	4	51742	51754	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_022176	TAT	4	52022	52032	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_022176	ATT	4	52068	52080	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_022176	ATT	5	52234	52249	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_022176	GTA	4	52525	52537	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_022176	TTA	4	54068	54078	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320699
94	NC_022176	CAA	4	54095	54106	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
95	NC_022176	ATA	4	54853	54865	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_022176	TAT	4	55272	55284	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_022176	TTA	4	55595	55605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320699
98	NC_022176	TAT	4	56016	56026	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320699
99	NC_022176	TAT	4	56924	56934	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_022176	TAA	4	57215	57226	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_022176	ATA	5	57534	57547	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_022176	ATA	5	57555	57568	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_022176	TAA	4	57718	57729	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_022176	ATA	4	57955	57967	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_022176	TAA	4	58080	58092	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_022176	AAT	4	58247	58257	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_022176	ATA	4	58507	58518	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_022176	ATA	5	58709	58722	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_022176	ATT	4	59350	59360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_022176	TAT	4	59579	59590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320699
111	NC_022176	ATT	5	60184	60198	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320698
112	NC_022176	ATT	5	60476	60489	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320698
113	NC_022176	GTA	4	61229	61240	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320698
114	NC_022176	ATT	4	62482	62494	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_022176	ATA	4	62754	62765	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_022176	TAT	5	65222	65235	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_022176	TAT	4	65921	65933	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_022176	ATT	4	65965	65977	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
119	NC_022176	ATT	4	66163	66175	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
120	NC_022176	TAA	4	66815	66826	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_022176	TAA	5	67044	67059	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_022176	ATA	4	67088	67099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_022176	ATA	5	67240	67253	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_022176	AAT	7	67457	67477	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_022176	AAT	4	67861	67872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_022176	TAA	4	67931	67942	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022176	TAT	4	68883	68894	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_022176	TAT	4	68920	68930	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_022176	CTT	4	70315	70326	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53320698
130	NC_022176	AGT	5	72580	72594	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_022176	TAT	4	72771	72782	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_022176	ATA	4	72801	72813	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida chauliodes strain NRRL Y-27909 mitochondrion