ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida gigantensis strain NRRL Y-27736 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022174	TAG	4	470	481	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022174	GAAG	3	2818	2829	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022174	ATC	4	3068	3079	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320695
4	NC_022174	GA	6	4884	4894	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_022174	CAT	4	5096	5106	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53320694
6	NC_022174	AG	6	5988	5999	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022174	TGAC	3	7084	7095	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022174	ACTG	3	7248	7258	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	53320694
9	NC_022174	CGAG	3	7653	7665	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	53320694
10	NC_022174	ATACC	3	7992	8005	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	53320695
11	NC_022174	CTCG	3	8465	8477	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
12	NC_022174	CTCG	3	9157	9169	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
13	NC_022174	CGAG	3	9294	9306	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
14	NC_022174	AGT	4	9399	9410	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_022174	CGAG	3	9727	9739	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
16	NC_022174	TCC	4	11450	11462	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
17	NC_022174	CGAG	3	12831	12843	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_022174	GA	6	13472	13482	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	53320694
19	NC_022174	CTC	4	13755	13766	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022174	TC	7	15393	15405	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
21	NC_022174	TC	6	15661	15671	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	53320694
22	NC_022174	TTAGC	3	16167	16180	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
23	NC_022174	AGG	4	17603	17615	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_022174	TGAGT	3	18788	18803	16	20 %	40 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_022174	CTCG	3	19327	19339	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
26	NC_022174	ACT	4	19656	19667	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022174	CTCG	3	19760	19772	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
28	NC_022174	GGTAT	3	21061	21074	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	53320695
29	NC_022174	CTCG	3	21401	21413	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	53320694
30	NC_022174	CAGT	3	21808	21818	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	53320694
31	NC_022174	GTCA	3	21971	21982	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022174	CTTCC	3	22104	22117	14	0 %	40 %	0 %	60 %	7 %	Non-Coding
33	NC_022174	TC	6	23068	23079	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
34	NC_022174	TC	6	23591	23601	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
35	NC_022174	ATG	4	23960	23970	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320695
36	NC_022174	TC	6	24172	24182	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
37	NC_022174	GAT	4	25987	25998	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320695
38	NC_022174	CTA	4	28585	28596	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022174	AGC	4	29589	29600	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53320693
40	NC_022174	CCAT	3	31563	31573	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_022174	CTCG	3	32507	32519	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
42	NC_022174	CTCG	3	32974	32986	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
43	NC_022174	CTCG	3	33194	33206	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
44	NC_022174	TGA	4	33525	33537	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_022174	CT	6	33962	33973	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
46	NC_022174	CGAG	3	35216	35228	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
47	NC_022174	CGAG	3	36769	36781	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
48	NC_022174	TCCAAC	4	39958	39981	24	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	8 %	53320693
49	NC_022174	GAG	4	40174	40186	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	53320693
50	NC_022174	GTA	4	42206	42216	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320695
51	NC_022174	GAAGAG	3	43173	43190	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	53320693
52	NC_022174	AGA	4	43430	43441	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53320693
53	NC_022174	GGAA	3	43606	43616	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	53320693
54	NC_022174	AGA	4	43892	43903	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53320693
55	NC_022174	CTCG	3	44449	44461	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_022174	GATCTG	3	44605	44622	18	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
57	NC_022174	CTCG	3	44934	44946	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
58	NC_022174	GAG	4	46577	46588	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	53320693
59	NC_022174	GA	6	48449	48459	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_022174	GATGG	3	48620	48634	15	20 %	20 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_022174	CTTG	3	48957	48968	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
62	NC_022174	TAG	4	49139	49149	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_022174	TGAC	3	50318	50329	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_022174	CGAG	3	50831	50843	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
65	NC_022174	CGAG	3	50943	50955	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
66	NC_022174	CGAG	3	51065	51077	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
67	NC_022174	CGAG	3	51172	51184	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
68	NC_022174	CGAG	3	51329	51341	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
69	NC_022174	TGA	4	51454	51466	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_022174	CGAG	3	51535	51547	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
71	NC_022174	CTAG	3	52543	52553	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	53320693
72	NC_022174	TAC	4	52700	52710	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53320693
73	NC_022174	CTA	4	53442	53453	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320693
74	NC_022174	CGAG	3	54132	54144	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding
75	NC_022174	CCCA	3	54297	54308	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022174	CGAG	3	54523	54535	13	25 %	0 %	50 %	25 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida gigantensis strain NRRL Y-27736 mitochondrion