ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida corydali strain NRRL Y-27910 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022172	TGTA	3	118	129	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	53320689
2	NC_022172	TAT	8	201	223	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320689
3	NC_022172	TTA	4	308	318	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320689
4	NC_022172	TA	6	749	759	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320689
5	NC_022172	TTTA	3	892	903	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53320689
6	NC_022172	TTA	4	1057	1068	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320689
7	NC_022172	AAT	4	1158	1169	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320689
8	NC_022172	TTAA	3	1416	1427	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320690
9	NC_022172	TATC	3	1563	1573	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320690
10	NC_022172	TA	9	1772	1788	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320690
11	NC_022172	AATT	3	1795	1805	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_022172	ATAA	4	1815	1834	20	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022172	GA	6	1835	1846	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022172	TAA	4	2083	2094	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_022172	AT	12	2261	2282	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022172	TTATT	4	3207	3227	21	20 %	80 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
17	NC_022172	TAT	4	3224	3234	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_022172	TAT	4	3361	3373	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_022172	AT	6	3368	3382	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_022172	TATT	4	3772	3787	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_022172	AT	6	3790	3801	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_022172	ATA	4	4006	4017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_022172	TA	11	4672	4694	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022172	TTA	4	4692	4705	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_022172	TA	8	4966	4982	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_022172	TAATA	5	5120	5144	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022172	TAT	4	5296	5306	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_022172	TCT	4	5405	5416	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53320691
29	NC_022172	TTA	4	5468	5479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_022172	ATA	7	5479	5499	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_022172	TAAA	8	5500	5531	32	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_022172	TAA	5	5575	5590	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_022172	TAA	4	5743	5754	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320690
34	NC_022172	TAT	4	6449	6460	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022172	AT	9	6517	6534	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
36	NC_022172	TCAT	3	7165	7177	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
37	NC_022172	TAA	5	7371	7385	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_022172	TA	7	7587	7599	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_022172	TAT	4	7621	7632	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_022172	TAA	12	8148	8182	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_022172	TTA	4	8244	8254	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_022172	TTA	4	8344	8355	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_022172	ATA	5	8553	8567	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_022172	AT	10	8640	8661	22	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
45	NC_022172	AATA	3	8808	8820	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_022172	TA	6	9010	9020	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_022172	AT	8	9396	9411	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022172	AT	6	9631	9641	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_022172	ATATT	4	9783	9802	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_022172	AT	9	10089	10106	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_022172	TTA	11	10161	10194	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_022172	ATA	4	10199	10210	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_022172	TAT	6	10248	10265	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_022172	AATAT	6	10266	10294	29	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_022172	ATAA	5	10332	10352	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_022172	GCT	4	11174	11185	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53320689
57	NC_022172	AT	10	11346	11366	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320689
58	NC_022172	TA	8	11377	11391	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320689
59	NC_022172	TA	6	11425	11435	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320689
60	NC_022172	AT	7	11478	11490	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320689
61	NC_022172	TAA	4	11522	11532	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320689
62	NC_022172	ATA	4	11536	11547	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320689
63	NC_022172	ATA	11	11624	11655	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320689
64	NC_022172	TA	7	12343	12355	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320689
65	NC_022172	TAT	4	13548	13561	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_022172	AT	7	13560	13574	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_022172	TA	7	13570	13582	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_022172	TAT	8	13588	13610	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_022172	TA	8	13698	13712	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_022172	AT	13	13726	13751	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_022172	TA	8	14025	14039	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_022172	TATAAT	3	14111	14128	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320690
73	NC_022172	TAA	4	14313	14324	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320690
74	NC_022172	AT	6	14650	14660	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320690
75	NC_022172	ATA	4	14869	14879	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_022172	TAAA	3	14929	14940	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_022172	TAA	4	15333	15344	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320690
78	NC_022172	TAT	4	15929	15940	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_022172	TAA	4	15935	15946	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_022172	TTA	5	15952	15966	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_022172	TTA	4	16022	16032	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_022172	AT	6	16053	16063	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_022172	AATT	3	16153	16164	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022172	TTA	7	16749	16769	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_022172	ATTA	3	16853	16864	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022172	TATT	3	17069	17080	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022172	ACT	6	18549	18566	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	53320690
88	NC_022172	ATT	5	18991	19005	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_022172	TAT	10	19121	19149	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
90	NC_022172	TAAT	3	19327	19338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_022172	AT	7	19463	19476	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_022172	TAAA	3	19600	19611	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_022172	ATT	4	20183	20194	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_022172	TA	10	20732	20750	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_022172	TA	8	20753	20768	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_022172	AAT	4	20830	20842	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_022172	ATA	5	20867	20881	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_022172	TAATTA	3	21055	21072	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_022172	TA	6	21073	21085	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_022172	ATTC	3	21628	21639	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_022172	TAA	4	21904	21915	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_022172	TATT	5	21942	21965	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_022172	TA	6	21973	21984	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_022172	ATTT	4	22065	22080	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_022172	ATTT	4	22080	22095	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_022172	ATA	4	22149	22159	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_022172	TTAA	3	22179	22190	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_022172	ATA	11	22201	22232	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_022172	TA	12	22370	22393	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_022172	ATA	7	22449	22469	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_022172	ATA	4	22622	22632	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_022172	TA	6	22856	22866	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_022172	TA	6	22944	22954	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_022172	TA	6	22965	22978	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_022172	TTTA	3	24015	24026	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022172	ATT	4	24293	24304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320690
117	NC_022172	TAAT	6	25484	25507	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	53320689
118	NC_022172	ACT	4	26317	26328	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
119	NC_022172	TA	8	28457	28471	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_022172	CT	6	29887	29897	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
121	NC_022172	TAT	4	29936	29947	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_022172	ATATTT	4	29971	29994	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_022172	ATATAA	3	29999	30016	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
124	NC_022172	TAATA	3	30018	30032	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_022172	TA	8	30478	30492	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320688
126	NC_022172	GAATA	3	30570	30585	16	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	53320688
127	NC_022172	AT	6	30686	30697	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
128	NC_022172	CTT	4	31226	31236	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53320688
129	NC_022172	TTATAA	3	31386	31403	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320688
130	NC_022172	TACT	3	31495	31506	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53320688
131	NC_022172	AT	13	32534	32558	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
132	NC_022172	ATT	5	32809	32822	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320688
133	NC_022172	TTA	4	32879	32891	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320688
134	NC_022172	TA	6	32980	32992	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320688
135	NC_022172	AT	6	33024	33035	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
136	NC_022172	ATA	4	33249	33260	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320688
137	NC_022172	ATATT	3	33297	33310	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53320688
138	NC_022172	TA	6	33542	33552	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320688
139	NC_022172	AAT	4	33571	33582	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320688
140	NC_022172	AT	6	33770	33783	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320688
141	NC_022172	AT	12	34086	34108	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
142	NC_022172	ATT	4	34322	34333	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320688
143	NC_022172	TAT	5	34531	34545	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320688
144	NC_022172	TA	7	34758	34771	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320688
145	NC_022172	TTTA	3	34811	34823	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320688
146	NC_022172	ATA	8	34886	34910	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320688
147	NC_022172	ATATTA	3	35447	35464	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320688
148	NC_022172	ATA	4	35519	35530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320688
149	NC_022172	TTA	4	35557	35567	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320688
150	NC_022172	TAA	4	35568	35578	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320688
151	NC_022172	TAA	4	35633	35645	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320688
152	NC_022172	TAAT	6	35640	35663	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
153	NC_022172	TTATA	3	35856	35870	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	53320688
154	NC_022172	TAA	4	36365	36379	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320688
155	NC_022172	AT	6	36598	36609	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
156	NC_022172	TATTT	3	36617	36631	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	53320688
157	NC_022172	AGT	4	36636	36647	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320688
158	NC_022172	TA	6	36944	36954	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320688
159	NC_022172	TTTAT	4	37051	37069	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	53320688
160	NC_022172	TA	6	37170	37181	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320688
161	NC_022172	TA	10	37184	37205	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320688
162	NC_022172	AT	6	37497	37509	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320688
163	NC_022172	ATTA	3	38121	38132	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
164	NC_022172	TAT	9	38133	38160	28	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
165	NC_022172	AT	17	38304	38338	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_022172	ATATT	3	38395	38409	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
167	NC_022172	ATA	4	38424	38434	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
168	NC_022172	ATAA	4	38460	38475	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
169	NC_022172	TAA	11	38907	38939	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	3 %	53320689
170	NC_022172	AAAT	3	39462	39473	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320689
171	NC_022172	TAA	5	39867	39881	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320689
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173	NC_022172	TAT	4	40323	40333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320689
174	NC_022172	ATATTT	3	40522	40539	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320689
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176	NC_022172	AT	11	40635	40655	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320689
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181	NC_022172	ATTA	3	42474	42489	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320689
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188	NC_022172	TATT	5	43473	43492	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	53320689
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190	NC_022172	AT	7	44056	44069	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
191	NC_022172	TA	8	44078	44092	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
192	NC_022172	TAAA	3	44207	44218	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
193	NC_022172	TAT	4	44737	44747	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320689
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195	NC_022172	TAT	4	45311	45323	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320689
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197	NC_022172	TA	6	45776	45786	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320689
198	NC_022172	TTATA	4	45818	45836	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
199	NC_022172	TAA	6	45861	45877	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
200	NC_022172	AT	11	45969	45991	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
201	NC_022172	CTATTA	4	46244	46267	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida corydali strain NRRL Y-27910 mitochondrion