ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida theae strain G-17 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022169	TTATCT	3	143	160	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
2	NC_022169	TAT	4	202	213	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022169	ATA	5	234	248	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_022169	TTATCT	3	696	713	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
5	NC_022169	TAT	4	755	766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_022169	ATA	5	787	801	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_022169	ATA	4	1068	1079	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_022169	TA	6	1083	1093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_022169	ATA	4	1126	1138	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_022169	TA	7	1137	1150	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_022169	TATAT	5	1154	1177	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_022169	TAA	4	1208	1220	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_022169	AAT	4	1223	1234	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022169	AAC	4	1558	1569	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53320683
15	NC_022169	ATA	4	1832	1842	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320682
16	NC_022169	TAAA	3	1862	1873	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320682
17	NC_022169	ATA	4	1989	2001	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320682
18	NC_022169	AT	7	2281	2295	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320682
19	NC_022169	AATA	3	2409	2420	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320682
20	NC_022169	ATA	4	2708	2718	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320682
21	NC_022169	TAA	4	2798	2810	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320682
22	NC_022169	ATA	5	2840	2853	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320682
23	NC_022169	ATT	4	2893	2904	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
24	NC_022169	TAA	4	3162	3172	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320682
25	NC_022169	TAT	4	3213	3223	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_022169	AT	14	3285	3312	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_022169	TA	6	3607	3617	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_022169	AATAT	3	3656	3670	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	53320682
29	NC_022169	AGA	4	3808	3819	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53320682
30	NC_022169	GTAAA	3	3880	3893	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	53320682
31	NC_022169	AATATA	3	4401	4417	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53320682
32	NC_022169	TA	8	4467	4484	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320682
33	NC_022169	AAAT	3	4524	4534	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320682
34	NC_022169	CTAT	3	4583	4594	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53320682
35	NC_022169	AAT	4	4979	4990	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320682
36	NC_022169	CCAT	3	5045	5055	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	53320682
37	NC_022169	ATA	5	6067	6082	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_022169	ATAAA	4	6576	6594	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	53320683
39	NC_022169	TAA	5	6610	6623	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320683
40	NC_022169	ATTT	3	6687	6697	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320683
41	NC_022169	ATA	4	6757	6769	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320683
42	NC_022169	TAAA	3	6866	6877	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_022169	AT	6	7415	7425	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_022169	AT	8	7429	7446	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_022169	TAAA	3	7585	7595	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320683
46	NC_022169	TA	7	7613	7625	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320683
47	NC_022169	TCCA	3	7781	7791	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	53320683
48	NC_022169	TTA	4	7857	7868	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320683
49	NC_022169	TTATTT	4	8240	8263	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_022169	TTTA	3	8334	8345	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_022169	ATT	4	8595	8607	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_022169	AT	6	8610	8622	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_022169	TA	7	8834	8847	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_022169	AT	6	9356	9367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_022169	CTA	4	9489	9499	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
56	NC_022169	TATAA	4	9575	9594	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_022169	TA	6	10420	10430	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_022169	ATA	4	10581	10593	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_022169	TA	7	10630	10642	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_022169	ATTT	3	10940	10951	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53320682
61	NC_022169	TAT	7	11322	11342	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320682
62	NC_022169	ATT	4	11365	11376	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
63	NC_022169	TTA	4	11502	11512	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320682
64	NC_022169	GAAA	3	11680	11691	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53320682
65	NC_022169	TAA	4	11746	11757	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320682
66	NC_022169	ATT	4	11906	11917	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
67	NC_022169	GATT	3	11948	11958	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53320682
68	NC_022169	AT	7	12496	12508	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320682
69	NC_022169	AT	7	12512	12524	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320682
70	NC_022169	TA	12	12619	12643	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320682
71	NC_022169	TAA	4	12835	12846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320682
72	NC_022169	TAT	6	12860	12876	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320682
73	NC_022169	ATT	4	13456	13468	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320682
74	NC_022169	TA	6	13812	13823	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_022169	AT	14	13893	13919	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_022169	TA	10	14065	14085	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_022169	AGTA	3	14242	14252	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320682
78	NC_022169	AT	6	14340	14350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320682
79	NC_022169	AT	6	14938	14948	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320682
80	NC_022169	TAT	4	15183	15193	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320682
81	NC_022169	ATT	4	15292	15303	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
82	NC_022169	AT	6	15421	15431	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320682
83	NC_022169	TAT	4	15462	15473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
84	NC_022169	TA	6	15549	15559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320682
85	NC_022169	ATA	4	15585	15596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_022169	AT	6	16083	16093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_022169	TA	6	16496	16507	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_022169	TA	9	16771	16787	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_022169	TTA	4	17422	17432	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320683
90	NC_022169	ATA	4	17467	17478	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_022169	TTAA	5	17479	17497	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
92	NC_022169	TA	6	17756	17768	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_022169	GTA	4	17791	17802	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320683
94	NC_022169	AATT	3	18255	18265	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320682
95	NC_022169	ATT	4	18692	18703	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
96	NC_022169	TAGA	3	19063	19075	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	53320682
97	NC_022169	TTA	4	19169	19180	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320682
98	NC_022169	TA	9	19195	19211	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_022169	ATT	4	19285	19296	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_022169	AT	8	20701	20715	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_022169	TAATA	3	20850	20863	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_022169	TA	17	21063	21095	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_022169	AT	6	21064	21074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_022169	TA	6	21196	21206	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_022169	ATTA	3	21542	21553	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_022169	TAT	6	21585	21601	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320683
107	NC_022169	TAT	4	21645	21656	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320683
108	NC_022169	TTA	5	21726	21739	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320683
109	NC_022169	TAT	5	22328	22342	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320682
110	NC_022169	TTTA	3	22698	22708	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320682
111	NC_022169	AT	6	22911	22923	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320682
112	NC_022169	TAA	4	23001	23012	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320682
113	NC_022169	TA	6	23234	23245	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320682
114	NC_022169	TAA	4	23289	23299	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320682
115	NC_022169	TAT	5	23580	23595	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
116	NC_022169	TAT	4	23607	23617	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_022169	TA	11	23620	23640	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_022169	TA	6	23744	23755	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_022169	ATT	5	24018	24031	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320683
120	NC_022169	TAT	4	24084	24095	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320683
121	NC_022169	ATT	4	24239	24251	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320683
122	NC_022169	GTT	4	24537	24548	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	53320683
123	NC_022169	AT	8	24941	24955	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320683
124	NC_022169	TA	6	25059	25071	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_022169	TA	6	25089	25102	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_022169	AT	6	25141	25151	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_022169	TAT	4	25156	25167	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_022169	ATT	4	25438	25449	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_022169	TAA	6	25470	25488	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
130	NC_022169	AAGATA	4	25521	25544	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_022169	TA	6	25796	25806	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_022169	ATT	4	25991	26002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_022169	TAA	6	26023	26041	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
134	NC_022169	AAGATA	4	26074	26097	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida theae strain G-17 mitochondrion