ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida sake strain CBS 159 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022168	TA	6	336	346	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_022168	ATA	4	624	635	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320681
3	NC_022168	ATA	5	870	883	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320681
4	NC_022168	ACA	4	1040	1051	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53320681
5	NC_022168	TATAA	3	1114	1127	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	53320681
6	NC_022168	ATA	4	1366	1377	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320681
7	NC_022168	CTAT	3	1452	1462	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320681
8	NC_022168	ATA	4	1591	1602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320681
9	NC_022168	AAT	4	1689	1699	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320681
10	NC_022168	ATAA	6	1834	1860	27	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_022168	ATA	4	2612	2622	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320681
12	NC_022168	TAA	5	2640	2653	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320681
13	NC_022168	TAA	5	2893	2906	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_022168	AATAT	4	3036	3055	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_022168	ATATA	4	3138	3157	20	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022168	AT	6	3322	3334	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_022168	ATAA	3	4006	4017	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022168	ACTT	3	4309	4321	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
19	NC_022168	TAT	4	4532	4543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022168	ATA	4	4664	4675	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_022168	TTAAT	5	4831	4854	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_022168	TAT	4	4859	4871	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_022168	AT	7	5169	5181	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_022168	ATAATG	4	6184	6207	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	53320681
25	NC_022168	TA	6	6355	6365	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320681
26	NC_022168	AT	6	6672	6682	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_022168	ATT	5	6772	6786	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320682
28	NC_022168	TAAT	3	6787	6797	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320682
29	NC_022168	TTAA	3	6886	6897	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320682
30	NC_022168	AT	6	6931	6943	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_022168	ATA	4	6945	6955	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_022168	AT	12	7384	7406	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_022168	AGT	4	7527	7537	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_022168	AT	6	8188	8199	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022168	AT	6	8202	8213	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_022168	AAAT	3	9845	9855	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320680
37	NC_022168	TAAA	3	9874	9886	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_022168	TAAA	3	9943	9954	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_022168	ATA	7	10236	10256	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320681
40	NC_022168	TAT	4	10462	10473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320681
41	NC_022168	AT	6	10620	10631	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320680
42	NC_022168	ATT	6	10638	10655	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320680
43	NC_022168	ATA	4	10695	10707	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320680
44	NC_022168	TA	6	10884	10894	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320680
45	NC_022168	AAT	4	11131	11142	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320680
46	NC_022168	ATA	4	11303	11313	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
47	NC_022168	AAT	4	11444	11454	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
48	NC_022168	ATA	4	11567	11577	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
49	NC_022168	TAATA	3	11592	11605	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	53320680
50	NC_022168	ATTAAT	3	11674	11691	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320680
51	NC_022168	ATA	6	11891	11907	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_022168	TA	6	12883	12893	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320680
53	NC_022168	AAT	4	13233	13243	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
54	NC_022168	TAAA	3	13252	13264	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320680
55	NC_022168	TA	6	13370	13381	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320680
56	NC_022168	ATT	4	13422	13432	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320680
57	NC_022168	TAT	5	13568	13582	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320680
58	NC_022168	AT	6	13791	13802	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320680
59	NC_022168	ATA	7	15242	15262	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
60	NC_022168	ATT	4	15687	15698	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320680
61	NC_022168	TA	10	15966	15984	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_022168	AT	7	16165	16179	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_022168	TTA	4	16377	16390	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320680
64	NC_022168	TA	6	16431	16441	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320680
65	NC_022168	AT	7	16626	16638	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320680
66	NC_022168	ATC	4	17081	17092	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320680
67	NC_022168	TA	6	17327	17338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320680
68	NC_022168	TAA	4	17536	17546	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
69	NC_022168	AT	6	17736	17746	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320680
70	NC_022168	GCT	4	18500	18511	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53320680
71	NC_022168	ATA	4	18868	18878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320680
72	NC_022168	TAAA	3	19018	19029	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320680
73	NC_022168	TA	6	19170	19180	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320681
74	NC_022168	TAA	4	19197	19208	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320681
75	NC_022168	AAATAT	3	19368	19386	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_022168	TA	7	19392	19405	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_022168	TA	6	19480	19490	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_022168	AT	6	19535	19545	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022168	ATA	4	19568	19579	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320681
80	NC_022168	TAT	4	20767	20779	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320680
81	NC_022168	TAAA	3	20873	20884	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320680
82	NC_022168	AAT	5	21465	21479	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320680
83	NC_022168	TAAA	3	21524	21535	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320680
84	NC_022168	AT	9	21897	21913	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320680
85	NC_022168	TGTATT	3	22237	22254	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	5 %	53320680
86	NC_022168	TTTATA	3	23093	23111	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
87	NC_022168	TTA	4	23263	23274	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_022168	AAAATA	3	23520	23537	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
89	NC_022168	ATG	4	24227	24237	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320681
90	NC_022168	TA	6	24360	24370	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320681
91	NC_022168	AAAATA	3	24645	24661	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
92	NC_022168	AT	7	24726	24739	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_022168	AT	7	24945	24957	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_022168	TA	6	24963	24975	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_022168	AT	6	24976	24987	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_022168	TAAA	3	25726	25736	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_022168	TTTA	3	25877	25888	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_022168	ATT	4	25889	25899	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_022168	TTTA	3	25965	25976	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_022168	TA	6	26007	26019	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_022168	TA	7	26021	26033	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_022168	TA	7	26046	26058	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

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