ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Cyberlindnera suaveolens strain CBS 1670 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022167	TAAT	3	178	190	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_022167	TTAA	3	227	237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_022167	ATTT	3	380	391	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_022167	GAAA	3	772	783	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_022167	TTAA	3	1016	1027	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_022167	TTTA	3	1347	1358	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022167	TTAT	3	2360	2371	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_022167	ATTT	3	2483	2495	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_022167	TTAA	3	2551	2561	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_022167	TTAA	3	2807	2817	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_022167	AATT	3	3386	3396	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320678
12	NC_022167	ATTA	3	3954	3964	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320678
13	NC_022167	ATAA	3	5342	5354	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320679
14	NC_022167	CCAT	3	6442	6452	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	53320679
15	NC_022167	TAAA	3	6948	6959	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	53320679
16	NC_022167	TAAT	3	7325	7337	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_022167	TAAA	3	8394	8406	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320678
18	NC_022167	TAAA	3	8451	8462	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320678
19	NC_022167	AAAT	3	8811	8821	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320678
20	NC_022167	TAAA	18	9029	9100	72	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_022167	AATT	3	9347	9359	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320679
22	NC_022167	TAAT	4	9687	9703	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320679
23	NC_022167	ATTA	5	9983	10002	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	53320677
24	NC_022167	TTAA	3	10309	10320	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320677
25	NC_022167	TTAT	3	11374	11385	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_022167	TAAT	4	11497	11511	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320677
27	NC_022167	TTTA	3	13092	13102	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320677
28	NC_022167	TTTG	3	13505	13516	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	53320677
29	NC_022167	ATTA	3	13605	13617	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320677
30	NC_022167	AATT	4	13846	13862	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320677
31	NC_022167	AATT	4	14720	14735	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320677
32	NC_022167	TAAA	3	15444	15456	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320677
33	NC_022167	TAAT	4	16553	16568	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320677
34	NC_022167	ATTA	3	16937	16948	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320677
35	NC_022167	AATT	3	17382	17393	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320677
36	NC_022167	AATT	3	18636	18646	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_022167	TTTA	3	18850	18861	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_022167	ATTT	3	19002	19012	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_022167	ATTA	4	20683	20698	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022167	AAAT	3	20699	20709	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_022167	AACT	3	20760	20771	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022167	ATAA	3	22805	22817	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320677
43	NC_022167	AATT	3	23004	23015	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320677
44	NC_022167	TTAA	3	23554	23566	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320677
45	NC_022167	TTAA	3	25068	25079	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320677
46	NC_022167	AATT	3	26084	26094	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_022167	TTAA	3	26121	26132	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_022167	AAAT	3	27960	27971	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320679
49	NC_022167	TGAT	3	28290	28300	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53320679
50	NC_022167	ATTA	3	28392	28403	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022167	TACC	3	28772	28782	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
52	NC_022167	TAAA	3	28941	28952	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_022167	AATA	3	29254	29265	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_022167	TTAG	3	29921	29931	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53320678
55	NC_022167	ATTA	3	29969	29980	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320678
56	NC_022167	ATAA	3	30483	30494	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320678
57	NC_022167	TAAT	4	30684	30699	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_022167	TAAA	3	31559	31570	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	53320677
59	NC_022167	ATTT	3	31673	31684	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53320677
60	NC_022167	AATT	4	33314	33329	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320677
61	NC_022167	CATA	3	33955	33965	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	53320677
62	NC_022167	TAAT	4	35081	35096	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320677
63	NC_022167	TTAA	3	36376	36387	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320677
64	NC_022167	ATTT	3	38051	38061	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320677
65	NC_022167	AATT	10	38623	38662	40	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320677
66	NC_022167	GTAA	3	40152	40162	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320677
67	NC_022167	ATTT	3	40795	40806	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_022167	TTAA	3	41254	41265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_022167	TTTA	3	41705	41716	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_022167	TTAA	3	42442	42453	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_022167	TAAA	3	42780	42792	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_022167	TTCA	3	44902	44913	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_022167	TTAT	3	45256	45267	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_022167	ATTT	4	45359	45374	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_022167	TTAA	3	45678	45688	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_022167	TATT	3	47573	47584	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022167	TAAA	3	50258	50269	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_022167	AAAT	3	50830	50840	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022167	ATTA	3	50981	50992	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022167	CTTT	3	51181	51192	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_022167	AATA	3	51415	51426	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Cyberlindnera suaveolens strain CBS 1670 mitochondrion