ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Wickerhamomyces pijperi strain CBS 2887 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022166	TTA	4	11	22	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022166	ATA	5	833	847	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_022166	TAAA	3	963	973	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_022166	ATTAT	3	1103	1116	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_022166	TAT	4	1163	1173	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_022166	TAT	4	1273	1284	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022166	ATA	8	1295	1318	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_022166	ATT	4	1435	1447	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_022166	TAT	4	1539	1550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_022166	TAA	4	1551	1562	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_022166	TTA	4	1566	1576	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_022166	TATC	3	1577	1589	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
13	NC_022166	TAT	4	1590	1601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022166	TA	7	1635	1648	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_022166	TTATA	3	1671	1684	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_022166	TA	11	1795	1815	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_022166	AATATA	4	1822	1845	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_022166	TAGTT	4	1856	1874	19	20 %	60 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
19	NC_022166	TATG	15	1968	2026	59	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022166	TA	12	2069	2091	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_022166	TTTGTT	3	2122	2140	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_022166	TAA	4	2671	2682	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320677
23	NC_022166	AAT	4	2777	2788	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320677
24	NC_022166	TAA	4	2926	2937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320677
25	NC_022166	TAA	4	3119	3129	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_022166	TA	8	3455	3470	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_022166	GTA	4	3535	3545	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320677
28	NC_022166	AAT	4	3837	3848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_022166	AT	11	3855	3880	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_022166	T	16	4203	4218	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_022166	GAA	4	5194	5206	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	53320676
32	NC_022166	TAA	11	6086	6116	31	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_022166	AAAT	3	6123	6133	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_022166	AAAT	3	6150	6161	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022166	AT	7	6169	6183	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_022166	ATA	5	6200	6215	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_022166	TAA	7	6216	6237	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_022166	A	14	6276	6289	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_022166	TAA	4	6352	6362	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320676
40	NC_022166	ATA	4	6405	6415	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320676
41	NC_022166	TAA	4	6682	6693	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
42	NC_022166	TTTAA	4	6773	6791	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	53320676
43	NC_022166	ATA	4	7020	7031	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
44	NC_022166	ATA	4	7036	7046	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320676
45	NC_022166	AAT	4	7058	7069	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
46	NC_022166	TTAA	3	7462	7473	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320676
47	NC_022166	AT	7	7653	7666	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_022166	ATA	4	7728	7739	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_022166	TTTA	3	8020	8030	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_022166	TGAG	3	8031	8041	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_022166	ATA	5	8225	8238	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_022166	TA	16	8420	8454	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_022166	CTAATG	3	9231	9248	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	53320676
54	NC_022166	TTTA	3	9373	9384	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_022166	TA	14	9501	9526	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_022166	TTTA	3	9604	9614	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_022166	TA	6	9663	9674	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_022166	TAA	4	9741	9753	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_022166	ACTT	3	9901	9911	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_022166	ATA	4	9912	9922	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_022166	TAATA	3	9965	9978	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_022166	TA	7	9983	9996	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_022166	ATT	4	9994	10006	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_022166	TACC	3	10077	10087	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
65	NC_022166	TAT	7	10106	10126	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_022166	ATT	11	10418	10450	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_022166	TAA	4	10888	10899	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
68	NC_022166	TAAAGA	3	11076	11093	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	0 %	53320676
69	NC_022166	ATAA	3	11304	11315	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320676
70	NC_022166	AT	16	11460	11491	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_022166	AATA	3	11521	11532	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_022166	AT	6	11543	11553	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_022166	AAT	4	11693	11704	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320677
74	NC_022166	ATTT	3	11771	11783	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320677
75	NC_022166	AATT	3	12025	12035	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_022166	TA	8	12040	12055	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_022166	ATA	8	12837	12861	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
78	NC_022166	ATT	4	12865	12876	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320676
79	NC_022166	TAAT	3	13427	13438	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320676
80	NC_022166	TAT	4	13627	13638	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320676
81	NC_022166	TCC	4	14136	14146	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	53320676
82	NC_022166	ATA	4	14224	14235	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
83	NC_022166	TAA	4	14245	14256	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
84	NC_022166	GTGA	3	14395	14405	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	53320676
85	NC_022166	CTA	4	14638	14649	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320676
86	NC_022166	ATT	5	14905	14919	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_022166	AT	7	14925	14939	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_022166	ATA	4	14975	14985	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_022166	ACTT	3	15032	15043	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022166	TTTA	3	15343	15355	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_022166	AG	6	15368	15378	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_022166	CTTA	3	15454	15466	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
93	NC_022166	TAT	4	15475	15486	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_022166	A	12	15577	15588	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022166	TA	8	15675	15690	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_022166	AT	13	15803	15826	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_022166	ATT	4	15842	15852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_022166	TAA	4	16119	16130	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_022166	AT	6	16652	16663	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_022166	TTCT	3	16914	16924	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
101	NC_022166	TA	6	16969	16979	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_022166	TA	6	17161	17172	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_022166	AATAT	3	17954	17967	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_022166	TAT	7	18042	18061	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
105	NC_022166	TAT	4	18453	18463	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_022166	AT	6	18773	18783	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_022166	TTAT	3	19304	19315	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022166	TA	11	19563	19584	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_022166	TA	6	19586	19597	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_022166	ATA	5	19755	19770	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_022166	TTAT	3	19849	19861	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_022166	TTTA	3	19957	19967	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_022166	AATTT	3	19985	19999	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_022166	TTA	4	20537	20548	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_022166	AAAT	3	21014	21025	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_022166	ATA	4	21213	21224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_022166	TAT	5	21273	21286	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_022166	TAT	7	21291	21311	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_022166	ATT	5	21352	21367	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_022166	ATAC	15	21452	21510	59	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
121	NC_022166	AGAT	3	21511	21522	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_022166	CTAA	5	21610	21631	22	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_022166	ATATTT	8	21633	21680	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_022166	AT	9	21830	21846	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
125	NC_022166	TAT	4	21913	21924	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_022166	TAA	5	21928	21942	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_022166	GTAT	3	22120	22132	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_022166	AAT	4	22154	22165	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_022166	ATT	8	22163	22186	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_022166	ATA	4	22193	22204	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_022166	ATATA	3	22359	22372	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_022166	GAT	4	22557	22567	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_022166	ATT	5	22615	22628	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_022166	ATT	4	22634	22645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Wickerhamomyces pijperi strain CBS 2887 mitochondrion