ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ogataea philodendri strain CBS 6075 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022165	ATA	4	10	20	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_022165	ATTAA	3	100	113	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_022165	ATA	4	298	308	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_022165	ATTAA	3	388	401	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_022165	TA	6	1288	1298	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320675
6	NC_022165	TTATTT	5	1815	1845	31	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_022165	TTAAA	3	1854	1867	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_022165	TAT	4	1922	1932	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_022165	TATTTT	3	2041	2058	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_022165	TTTA	3	2060	2071	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_022165	ATT	4	2125	2136	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_022165	TTAT	3	2330	2341	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_022165	ATTT	3	2449	2459	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320675
14	NC_022165	TAT	4	2933	2943	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320675
15	NC_022165	AATTA	3	2999	3013	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	53320675
16	NC_022165	ATT	6	3357	3377	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320675
17	NC_022165	ATT	4	3486	3497	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320675
18	NC_022165	TAAT	4	3512	3528	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320675
19	NC_022165	ATA	4	3603	3614	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
20	NC_022165	AT	7	3866	3878	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_022165	ATCT	3	4016	4026	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_022165	AAG	4	4201	4212	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53320676
23	NC_022165	AT	7	4231	4245	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_022165	TTAA	3	4302	4312	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_022165	ATTAG	3	4487	4501	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022165	TTA	4	4961	4972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022165	AT	8	5150	5164	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_022165	TTA	5	5370	5384	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_022165	TAT	4	5631	5643	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_022165	TAT	4	5808	5818	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_022165	TTAA	3	5832	5843	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_022165	TAAT	6	6022	6046	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_022165	ATTAT	4	6380	6398	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
34	NC_022165	AACG	3	6637	6649	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
35	NC_022165	ATT	4	6811	6822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_022165	TAT	8	6822	6844	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_022165	TTA	4	6981	6993	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_022165	TTTA	3	7469	7481	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320675
39	NC_022165	ATT	4	8335	8346	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320675
40	NC_022165	TAT	5	8496	8510	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320675
41	NC_022165	TTA	4	8642	8653	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320675
42	NC_022165	AAT	6	8654	8672	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	53320675
43	NC_022165	AT	8	9503	9518	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_022165	ATT	4	9529	9540	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
45	NC_022165	ATT	4	9911	9922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
46	NC_022165	AATA	3	9966	9978	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320674
47	NC_022165	ATA	5	10537	10551	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320674
48	NC_022165	TAAAA	4	10777	10797	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	53320674
49	NC_022165	T	12	10886	10897	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	53320674
50	NC_022165	TAT	8	10931	10953	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
51	NC_022165	TATT	3	11053	11064	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53320674
52	NC_022165	AATT	3	11169	11180	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320674
53	NC_022165	TAA	4	11343	11354	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
54	NC_022165	TTTTA	3	11488	11501	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	53320674
55	NC_022165	TTTA	3	11723	11733	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320674
56	NC_022165	TAA	4	11833	11845	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320674
57	NC_022165	AAAT	3	12085	12096	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320674
58	NC_022165	ATT	4	12155	12166	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
59	NC_022165	ATA	4	12615	12627	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320674
60	NC_022165	TTA	4	12782	12792	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_022165	ATA	4	13336	13346	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_022165	TAAA	3	13899	13911	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_022165	TAA	4	14459	14470	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_022165	CAA	4	15351	15363	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	53320675
65	NC_022165	TGG	4	15954	15965	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53320675
66	NC_022165	AT	6	16014	16024	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320675
67	NC_022165	AATT	3	16155	16166	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320675
68	NC_022165	AAT	4	16270	16281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320675
69	NC_022165	TAA	4	16314	16325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320675
70	NC_022165	TAA	4	16596	16607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_022165	AT	7	17502	17515	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_022165	GA	6	17681	17691	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_022165	TAA	4	17809	17820	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_022165	TTAA	3	18583	18594	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320675
75	NC_022165	TAA	4	18713	18724	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320675
76	NC_022165	ACA	4	19767	19777	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_022165	AT	6	19934	19945	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_022165	AAAAT	3	19954	19967	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	53320675
79	NC_022165	AATA	3	19971	19981	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320675
80	NC_022165	ATTT	3	20235	20247	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320675
81	NC_022165	TAA	4	20495	20506	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320675
82	NC_022165	ATA	4	21287	21298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
83	NC_022165	TAA	4	21363	21374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320676
84	NC_022165	TAA	7	21957	21978	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320675
85	NC_022165	TTATAA	4	22006	22029	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320675
86	NC_022165	AAAT	3	22593	22605	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320675
87	NC_022165	ATA	5	23114	23128	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_022165	TAT	4	23702	23713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320675
89	NC_022165	TAAGT	3	23992	24005	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	53320675
90	NC_022165	TA	6	24724	24734	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_022165	AAAT	3	24833	24843	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_022165	ATAAAA	3	25009	25026	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_022165	TAAA	3	25049	25060	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022165	ATA	4	25134	25145	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_022165	TTTAA	3	25197	25210	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_022165	AAATAA	5	25219	25249	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_022165	TA	6	25311	25322	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_022165	TAA	4	25451	25462	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_022165	TA	6	25769	25781	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320675
100	NC_022165	ATTAGG	3	26195	26212	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	53320675
101	NC_022165	TTTAA	3	26658	26671	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_022165	TAT	5	26758	26772	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_022165	TTTAA	3	26946	26959	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_022165	TAT	5	27046	27060	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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