ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida vartiovaarae strain CBS 4289 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022164	ATA	5	87	100	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_022164	AAAT	3	106	116	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_022164	TA	7	164	179	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_022164	AT	6	274	284	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_022164	AAT	4	354	366	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_022164	AATT	3	421	431	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_022164	AT	6	566	576	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_022164	AT	7	725	738	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_022164	AAT	4	750	762	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_022164	AT	6	811	822	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_022164	TAT	4	875	885	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_022164	AATT	3	921	931	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_022164	TAT	6	1159	1175	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_022164	AT	6	1375	1385	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_022164	TAT	7	1523	1546	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_022164	A	14	1608	1621	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022164	ATTT	3	1734	1744	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_022164	AAGT	3	1745	1756	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_022164	TAT	4	1826	1836	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_022164	ATT	9	1931	1957	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_022164	T	12	2014	2025	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_022164	TTAAA	3	2062	2075	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_022164	GAT	8	2100	2122	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022164	AAT	4	2613	2625	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320674
25	NC_022164	AAT	4	2725	2736	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
26	NC_022164	ATA	4	2747	2758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
27	NC_022164	TAA	4	2873	2885	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320674
28	NC_022164	TTA	4	3270	3282	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_022164	TAA	5	3290	3303	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_022164	ATA	4	3409	3420	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
31	NC_022164	ATT	4	3684	3696	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_022164	ATA	5	3792	3805	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320673
33	NC_022164	ATA	4	4097	4109	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320673
34	NC_022164	ATA	4	4189	4199	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
35	NC_022164	TAA	4	4390	4402	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320673
36	NC_022164	ATAA	3	4677	4688	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320673
37	NC_022164	TAC	4	4705	4716	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320673
38	NC_022164	TAAA	3	4730	4742	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320673
39	NC_022164	TA	6	5069	5080	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320673
40	NC_022164	AAAT	3	5147	5157	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320673
41	NC_022164	T	13	5171	5183	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_022164	TTAAT	3	5357	5371	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_022164	TAT	4	5699	5710	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
44	NC_022164	TAA	4	6030	6041	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
45	NC_022164	AT	9	6128	6144	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320673
46	NC_022164	AT	6	6251	6261	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320673
47	NC_022164	ATT	4	6276	6287	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320673
48	NC_022164	TAA	5	6351	6365	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320673
49	NC_022164	ATT	4	6528	6539	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320673
50	NC_022164	TAA	4	6555	6566	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
51	NC_022164	AT	7	6861	6873	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320673
52	NC_022164	ATA	4	6934	6946	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320673
53	NC_022164	AT	6	7417	7427	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320673
54	NC_022164	ATA	4	7432	7442	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
55	NC_022164	TA	6	7458	7468	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320673
56	NC_022164	ATA	4	7478	7488	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
57	NC_022164	A	13	7729	7741	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022164	TTA	4	7742	7756	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_022164	ATT	4	7764	7776	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320673
60	NC_022164	AAG	5	7943	7957	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	53320673
61	NC_022164	TAA	4	8212	8223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
62	NC_022164	TAT	4	8946	8956	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_022164	TAT	4	9142	9153	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_022164	TAT	5	9430	9444	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022164	TAT	4	9452	9463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_022164	AT	7	9484	9496	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_022164	TA	6	9602	9614	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_022164	A	14	9689	9702	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_022164	ATA	4	9821	9831	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
70	NC_022164	ATA	9	10155	10183	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320673
71	NC_022164	TATAAT	3	10258	10275	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320673
72	NC_022164	TAA	6	10416	10436	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
73	NC_022164	ATA	4	10439	10450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
74	NC_022164	TAA	4	10455	10466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
75	NC_022164	TAA	4	10506	10516	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
76	NC_022164	AATA	3	10726	10736	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320673
77	NC_022164	AACT	3	11003	11014	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022164	T	12	11132	11143	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_022164	ATTT	4	11193	11208	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022164	TTAT	3	11434	11445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_022164	TGAG	3	11450	11460	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_022164	AT	8	11656	11670	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_022164	TA	7	11683	11695	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_022164	AATT	3	11815	11826	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320673
85	NC_022164	TAT	4	12040	12050	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320673
86	NC_022164	TTATAT	3	12065	12082	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320673
87	NC_022164	TAA	4	12096	12107	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
88	NC_022164	AATTA	3	12166	12181	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	53320673
89	NC_022164	TAT	4	12306	12317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320673
90	NC_022164	TAT	4	12349	12359	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320673
91	NC_022164	AAT	4	12502	12512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
92	NC_022164	TAT	4	13221	13231	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320673
93	NC_022164	TAA	4	13564	13575	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
94	NC_022164	TAA	4	13669	13679	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
95	NC_022164	TAA	4	13936	13947	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
96	NC_022164	TTTG	3	13962	13972	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	53320674
97	NC_022164	TTTA	3	13975	13986	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_022164	AT	6	13997	14008	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_022164	A	14	14016	14029	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_022164	TAT	4	14059	14069	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_022164	TAA	4	14465	14475	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320673
102	NC_022164	AATT	3	14962	14972	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_022164	TTTA	3	15062	15072	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_022164	TA	6	15179	15190	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_022164	ATA	4	15243	15253	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_022164	TAT	7	15270	15290	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
107	NC_022164	TTAA	3	15582	15593	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320673
108	NC_022164	T	18	16379	16396	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022164	ATA	4	16537	16548	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
110	NC_022164	TAT	4	16663	16674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
111	NC_022164	AAT	4	16833	16844	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
112	NC_022164	TA	7	17146	17158	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_022164	TACC	3	17368	17378	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
114	NC_022164	AT	8	17398	17412	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_022164	AT	6	17694	17704	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_022164	ATT	4	17791	17802	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320674
117	NC_022164	AATG	3	18266	18276	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320674
118	NC_022164	AAT	4	18744	18755	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
119	NC_022164	TAA	4	18764	18774	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320674
120	NC_022164	ATTTT	3	18822	18836	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	53320674
121	NC_022164	AT	8	18883	18897	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_022164	TATT	6	18964	18987	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_022164	ATAA	3	19236	19247	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	53320673
124	NC_022164	ATT	5	19929	19943	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320673
125	NC_022164	TAT	5	20012	20025	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320673
126	NC_022164	TAA	4	20627	20639	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320673
127	NC_022164	TAAT	3	21626	21637	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320673
128	NC_022164	TAT	5	21779	21793	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320673
129	NC_022164	TAA	4	21963	21974	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
130	NC_022164	ATT	4	21979	21989	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320673
131	NC_022164	ATA	4	22619	22630	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
132	NC_022164	TAA	4	22640	22651	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320673
133	NC_022164	T	16	23270	23285	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_022164	AT	7	23390	23402	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_022164	TAA	4	23460	23471	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_022164	AG	6	23569	23579	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_022164	TTTA	3	24071	24082	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_022164	ATA	4	24645	24656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320674
139	NC_022164	ATTT	3	25222	25233	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53320674
140	NC_022164	TAAT	3	25267	25278	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_022164	AT	7	25354	25367	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022164	AAT	5	25519	25533	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
143	NC_022164	TA	6	25551	25562	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
144	NC_022164	TTTATC	3	25593	25611	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
145	NC_022164	TAAA	3	25618	25630	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_022164	TATT	3	26280	26290	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_022164	TTA	4	26503	26515	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_022164	ATA	4	26583	26595	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_022164	TATAAT	3	26810	26832	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_022164	TTAA	3	27200	27210	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
151	NC_022164	TTTC	3	27711	27722	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
152	NC_022164	ATA	4	27726	27736	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_022164	TAT	4	27836	27846	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
154	NC_022164	TAT	4	27895	27906	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
155	NC_022164	ATT	4	27995	28006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_022164	TTTA	4	28143	28158	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
157	NC_022164	TAA	4	28262	28272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
158	NC_022164	AAAT	3	28284	28294	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_022164	TAT	4	29233	29244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
160	NC_022164	TAT	5	29295	29308	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_022164	TAT	4	29658	29670	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
162	NC_022164	TATTTA	3	29791	29808	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
163	NC_022164	TA	6	29811	29821	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
164	NC_022164	T	12	29822	29833	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
165	NC_022164	TTATA	3	30552	30565	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
166	NC_022164	TAT	4	30575	30585	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_022164	ATTA	3	30744	30755	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
168	NC_022164	ATT	4	30911	30923	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
169	NC_022164	CATA	3	30975	30986	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
170	NC_022164	ATTA	3	30999	31009	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
171	NC_022164	A	12	31126	31137	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
172	NC_022164	TAA	8	31194	31217	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
173	NC_022164	TATAT	3	31251	31266	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
174	NC_022164	ATA	4	31315	31325	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
175	NC_022164	ATA	4	31328	31339	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
176	NC_022164	ACTT	3	31393	31404	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
177	NC_022164	AAAT	3	31405	31415	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
178	NC_022164	T	14	31528	31541	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_022164	TAA	6	31610	31627	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_022164	AT	6	31764	31774	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
181	NC_022164	ATA	6	31974	31990	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
182	NC_022164	TAAAAA	3	31996	32013	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
183	NC_022164	TAT	4	32172	32182	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
184	NC_022164	AATT	3	32302	32312	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
185	NC_022164	AT	6	32327	32338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
186	NC_022164	TAAT	3	32385	32395	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
187	NC_022164	AT	7	32413	32426	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
188	NC_022164	TAT	4	32518	32529	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
189	NC_022164	TA	6	32572	32582	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
190	NC_022164	AATT	3	32718	32728	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
191	NC_022164	TAAT	3	32781	32791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
192	NC_022164	TA	6	32976	32986	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
193	NC_022164	TAT	4	33054	33066	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
194	NC_022164	ATAA	3	33151	33162	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida vartiovaarae strain CBS 4289 mitochondrion