ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyberlindnera jadinii strain CBS 1600 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022163	TTA	4	103	114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_022163	TAT	22	769	830	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_022163	TAT	5	839	853	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_022163	TAT	12	943	978	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_022163	TAT	4	1002	1014	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_022163	TAT	8	1020	1043	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022163	TAT	12	1124	1157	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_022163	ATT	9	1161	1185	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_022163	TAT	6	1198	1215	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_022163	ATT	9	1219	1243	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_022163	ATT	5	1282	1296	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_022163	TAT	5	1322	1337	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_022163	TAT	4	1339	1351	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_022163	TAT	4	1382	1394	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_022163	TTA	4	1395	1405	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022163	TAT	8	1412	1435	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_022163	TAT	4	1437	1449	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_022163	TAT	10	1490	1518	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_022163	TAT	11	1521	1553	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_022163	ATT	4	1710	1724	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_022163	ATT	8	1735	1758	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_022163	ATT	4	1858	1869	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_022163	TAT	8	2005	2028	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022163	TAT	8	2119	2142	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_022163	ATT	4	2163	2174	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_022163	ATT	4	2203	2214	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022163	TAT	4	2254	2265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_022163	TAT	4	2359	2370	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022163	TAT	6	2384	2401	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022163	TAT	7	2422	2441	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_022163	AAT	4	3029	3041	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320672
32	NC_022163	TAA	4	3289	3301	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320672
33	NC_022163	TTA	4	3325	3335	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_022163	TAT	4	3604	3615	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022163	ATA	5	3700	3715	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_022163	TAT	7	3712	3732	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_022163	ATA	4	3986	3997	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320672
38	NC_022163	ATA	4	4688	4698	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320671
39	NC_022163	ATA	4	4780	4791	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
40	NC_022163	TAA	4	4981	4993	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320671
41	NC_022163	TAA	4	5020	5031	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
42	NC_022163	TAT	4	5689	5700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320671
43	NC_022163	TAA	4	5735	5746	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
44	NC_022163	TAA	4	5887	5898	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_022163	ATT	4	5945	5956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_022163	TTA	4	6281	6292	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320672
47	NC_022163	TAA	4	6613	6624	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320672
48	NC_022163	TAA	5	6926	6940	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320670
49	NC_022163	ATT	4	7103	7114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
50	NC_022163	TAA	4	7130	7141	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
51	NC_022163	ATA	4	7336	7347	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
52	NC_022163	ATA	4	7485	7497	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320670
53	NC_022163	ATA	4	8041	8051	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320670
54	NC_022163	ATT	11	8250	8283	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_022163	TAA	4	8480	8491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
56	NC_022163	AAG	5	8505	8519	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	53320670
57	NC_022163	ATA	4	9701	9711	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320670
58	NC_022163	TAT	4	9911	9922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
59	NC_022163	TAA	4	9977	9988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
60	NC_022163	ATC	4	10269	10279	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53320670
61	NC_022163	ATT	4	10894	10905	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
62	NC_022163	TAT	4	10920	10932	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320670
63	NC_022163	TAT	4	10951	10961	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320670
64	NC_022163	ATT	4	11348	11358	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320670
65	NC_022163	ATA	4	11516	11526	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320670
66	NC_022163	ATT	4	11708	11718	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320670
67	NC_022163	TAA	4	12696	12707	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
68	NC_022163	ATA	4	12747	12758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
69	NC_022163	ATT	4	13076	13087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
70	NC_022163	ATT	4	13123	13135	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320670
71	NC_022163	TAT	4	13707	13717	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320670
72	NC_022163	TTA	4	14110	14121	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
73	NC_022163	AAG	4	14281	14293	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	53320670
74	NC_022163	TTA	4	14555	14566	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_022163	ATT	4	14583	14594	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022163	ATA	4	14608	14619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_022163	TAT	4	14631	14644	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_022163	AAT	4	15165	15175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022163	TAT	4	15272	15283	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_022163	ATT	4	15384	15395	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_022163	TAA	5	15750	15763	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_022163	TAA	4	15927	15938	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
83	NC_022163	ATA	4	15977	15987	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320671
84	NC_022163	ATA	5	16127	16141	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320671
85	NC_022163	TAA	4	16236	16247	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
86	NC_022163	TAA	4	16554	16568	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320671
87	NC_022163	ATA	4	16571	16581	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320671
88	NC_022163	TAA	4	16632	16642	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320671
89	NC_022163	AAT	4	16807	16818	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
90	NC_022163	ATA	5	17150	17165	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_022163	ATT	4	17249	17260	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_022163	ATA	4	17646	17656	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_022163	TAT	4	17663	17673	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_022163	ATA	5	17828	17841	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_022163	TAT	4	18182	18192	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320670
96	NC_022163	AAT	4	18254	18265	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
97	NC_022163	AAT	4	18626	18636	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320670
98	NC_022163	TAT	4	19345	19355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320670
99	NC_022163	TAA	4	19675	19685	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320670
100	NC_022163	TAA	4	19688	19699	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
101	NC_022163	TAA	4	19793	19803	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320670
102	NC_022163	AAT	4	20010	20020	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320672
103	NC_022163	TAA	4	20060	20071	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320672
104	NC_022163	ATA	8	20151	20173	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_022163	AAT	4	20207	20218	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_022163	TAA	4	20610	20620	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320671
107	NC_022163	TAT	4	21812	21822	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320671
108	NC_022163	ATA	4	22046	22056	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320671
109	NC_022163	TAA	7	23399	23419	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_022163	ATT	4	23912	23923	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_022163	TAA	4	23932	23946	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_022163	TAA	4	24283	24294	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320671
113	NC_022163	AAT	4	24990	25001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320672
114	NC_022163	ATA	5	25173	25188	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
115	NC_022163	TAT	4	26200	26211	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
116	NC_022163	TAT	4	27688	27700	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320670
117	NC_022163	AAT	5	27716	27730	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320670
118	NC_022163	ATA	4	27960	27971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
119	NC_022163	AAT	4	28463	28474	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
120	NC_022163	ATA	4	28835	28846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
121	NC_022163	TAA	4	28856	28867	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320670
122	NC_022163	AAT	4	29502	29513	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_022163	AAT	4	29536	29548	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_022163	TAA	4	29993	30004	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_022163	ATT	4	31326	31338	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320671
126	NC_022163	ATT	5	33861	33875	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_022163	AAT	4	33873	33883	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_022163	ATA	7	34294	34314	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_022163	ATT	4	34945	34957	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_022163	TAT	4	34981	34992	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_022163	ATA	4	35032	35044	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_022163	ATT	4	35238	35249	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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165	NC_022163	AAT	5	41154	41169	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyberlindnera jadinii strain CBS 1600 mitochondrion