ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida oxycetoniae strain AS2.3656 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022162	ATA	23	180	243	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_022162	ATA	4	281	291	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320668
3	NC_022162	TAA	11	341	373	33	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320668
4	NC_022162	AAT	5	758	773	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320668
5	NC_022162	ATA	4	802	813	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320668
6	NC_022162	AAT	4	1671	1682	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320668
7	NC_022162	TTA	4	2028	2039	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
8	NC_022162	TAT	4	2254	2264	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
9	NC_022162	ATA	4	3402	3412	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320668
10	NC_022162	AAT	4	4379	4389	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_022162	ATA	4	4987	4998	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_022162	CTA	4	10106	10117	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320668
13	NC_022162	TAA	4	10494	10505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320668
14	NC_022162	ATT	4	11532	11544	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_022162	TTA	4	11548	11558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022162	ATA	4	11689	11699	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_022162	TAT	5	12015	12029	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_022162	ATA	5	13694	13709	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_022162	ATT	4	14082	14093	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022162	ATT	4	14319	14331	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_022162	TAT	4	14362	14372	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_022162	ATA	4	14393	14403	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_022162	TAT	4	14448	14458	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_022162	TAT	4	15235	15245	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
25	NC_022162	TAT	4	15327	15338	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
26	NC_022162	TTA	4	16061	16073	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320668
27	NC_022162	TAT	4	16516	16527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
28	NC_022162	AAT	5	17907	17921	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_022162	ATT	4	19018	19029	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_022162	TAT	4	19476	19486	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320669
31	NC_022162	ATA	4	19724	19735	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320669
32	NC_022162	ATA	4	19921	19932	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320669
33	NC_022162	TAT	4	20219	20230	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320669
34	NC_022162	TAA	4	21011	21022	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022162	TTA	5	22003	22017	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_022162	AAT	4	22949	22960	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_022162	TAA	4	22990	23001	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_022162	ATA	4	23124	23134	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_022162	ATA	4	23188	23198	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_022162	TAA	5	23473	23487	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022162	ATA	5	23845	23860	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_022162	ATT	4	24629	24641	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_022162	ATT	4	25639	25649	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_022162	TAT	6	26403	26419	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_022162	ATT	11	26657	26687	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_022162	TAT	5	27115	27128	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_022162	AGT	7	27268	27288	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_022162	AGT	4	27323	27333	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_022162	AGT	5	27446	27460	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_022162	TCC	4	28090	28100	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
51	NC_022162	TAA	4	28479	28490	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320668
52	NC_022162	TAT	4	28689	28699	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
53	NC_022162	TAT	4	29399	29409	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
54	NC_022162	ATT	4	29508	29519	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
55	NC_022162	AAT	4	31725	31735	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_022162	ATA	4	31787	31797	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_022162	AAT	4	31841	31852	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_022162	ATT	4	32281	32293	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_022162	TGA	4	33251	33261	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320669
60	NC_022162	AAT	4	34321	34332	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320669
61	NC_022162	ATA	4	35763	35773	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_022162	ATA	4	36034	36046	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_022162	TAT	5	36448	36461	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_022162	TTA	4	36578	36588	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_022162	TAT	4	36739	36751	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_022162	TAT	4	36794	36806	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_022162	TTA	4	36902	36914	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_022162	TAT	5	37338	37353	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_022162	ATA	4	37819	37830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_022162	TAT	4	38583	38593	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_022162	TAA	4	39533	39545	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_022162	TAT	4	39613	39623	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_022162	TAA	4	40270	40281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320669
74	NC_022162	AAT	4	40867	40878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_022162	TTA	4	41235	41247	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_022162	TTA	4	41719	41730	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_022162	TCT	5	41967	41981	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
78	NC_022162	ATT	5	42732	42745	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
79	NC_022162	TAT	5	43244	43259	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_022162	TTA	4	43933	43945	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_022162	TTA	4	43984	43996	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_022162	TAT	4	44211	44221	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_022162	AAT	4	44307	44317	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_022162	ATT	5	44411	44425	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_022162	TAT	4	44428	44439	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_022162	CTA	4	45415	45425	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53320669
87	NC_022162	TTA	4	45535	45546	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320669
88	NC_022162	AGC	4	45596	45607	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53320669
89	NC_022162	ATT	4	45916	45927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320669
90	NC_022162	ATA	4	46500	46510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320669
91	NC_022162	TAT	4	47086	47098	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320669
92	NC_022162	TAT	4	47360	47371	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320670
93	NC_022162	ATA	4	48039	48050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_022162	ATA	4	48945	48957	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_022162	ATA	4	51535	51546	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320668
96	NC_022162	TAT	4	53245	53256	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
97	NC_022162	TAT	4	54895	54907	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320668
98	NC_022162	TAT	4	55623	55633	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
99	NC_022162	TAT	4	56309	56319	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
100	NC_022162	ATA	5	58118	58132	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320668
101	NC_022162	TAA	4	59859	59870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320668
102	NC_022162	ATT	4	60603	60613	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
103	NC_022162	TAT	4	60674	60685	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
104	NC_022162	TTA	4	60934	60945	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320668
105	NC_022162	ATT	4	61107	61118	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320668
106	NC_022162	TAT	4	61251	61261	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320668
107	NC_022162	TAT	5	62117	62132	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320668
108	NC_022162	TAT	5	62153	62167	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320668
109	NC_022162	ATT	5	62184	62198	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320668
110	NC_022162	ATT	5	62217	62231	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320668
111	NC_022162	TAT	23	62351	62414	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Candida oxycetoniae strain AS2.3656 mitochondrion