ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Clavispora lusitaniae strain CBS 6936 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022161	TA	6	9	20	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_022161	ATA	4	66	78	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_022161	TAT	7	678	698	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320666
4	NC_022161	ATT	4	721	732	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320666
5	NC_022161	TAA	4	834	845	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320666
6	NC_022161	ATA	4	1206	1217	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320666
7	NC_022161	TAA	7	1261	1281	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320666
8	NC_022161	TAA	4	1459	1470	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320666
9	NC_022161	TAA	4	1609	1619	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320666
10	NC_022161	AATTT	3	1799	1812	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53320666
11	NC_022161	ATA	4	1958	1970	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320666
12	NC_022161	AT	6	2218	2229	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320666
13	NC_022161	TTA	4	2572	2583	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320666
14	NC_022161	AAAT	4	2983	2998	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	53320666
15	NC_022161	ATT	4	2997	3010	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_022161	TA	12	3200	3223	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_022161	TA	6	3267	3278	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_022161	AT	6	3288	3298	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_022161	AAT	4	3421	3433	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320666
20	NC_022161	TAA	4	3561	3572	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320666
21	NC_022161	AATA	3	3613	3624	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	53320666
22	NC_022161	ATATTA	3	3640	3658	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320666
23	NC_022161	TAT	4	3678	3688	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320666
24	NC_022161	ATATT	3	4109	4122	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53320666
25	NC_022161	TAT	4	4221	4233	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320666
26	NC_022161	TA	8	4256	4270	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320666
27	NC_022161	AATA	3	4323	4334	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320666
28	NC_022161	TA	6	4359	4369	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320666
29	NC_022161	TA	6	4470	4480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320666
30	NC_022161	ATATTA	3	4605	4622	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320666
31	NC_022161	ATT	4	4661	4671	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320666
32	NC_022161	ATAAA	3	5766	5780	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	53320666
33	NC_022161	ATT	4	5785	5795	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320666
34	NC_022161	CAT	4	5814	5825	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320666
35	NC_022161	TA	6	7125	7135	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320666
36	NC_022161	AT	6	7213	7226	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_022161	TAA	4	7482	7494	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_022161	AGT	4	7692	7702	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_022161	TA	6	7858	7868	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_022161	AT	8	8279	8293	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_022161	GATATA	3	8471	8487	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_022161	TA	6	9227	9237	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_022161	TA	6	9843	9854	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_022161	TA	7	9988	10000	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_022161	ATT	4	10006	10017	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_022161	AT	8	10030	10044	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_022161	ATT	4	10378	10388	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_022161	AT	7	10556	10568	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320667
49	NC_022161	TAT	4	10666	10677	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320667
50	NC_022161	TTA	4	10693	10703	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320667
51	NC_022161	TAT	4	11151	11161	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_022161	ATT	4	11249	11261	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_022161	TTTAT	3	11283	11296	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_022161	ATA	4	11388	11400	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_022161	ATAA	5	11554	11573	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	53320667
56	NC_022161	ATATT	3	11708	11721	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53320667
57	NC_022161	TAT	4	11760	11771	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320667
58	NC_022161	TAG	4	11907	11918	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320667
59	NC_022161	TAA	4	11949	11960	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320667
60	NC_022161	AATA	3	12001	12012	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320667
61	NC_022161	ATT	4	12032	12046	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	53320666
62	NC_022161	ATA	4	12193	12203	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320666
63	NC_022161	TAT	4	12472	12484	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320666
64	NC_022161	AATT	3	12850	12861	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	53320666
65	NC_022161	TTTAA	3	12917	12930	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53320666
66	NC_022161	AT	7	13057	13071	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320667
67	NC_022161	TTA	4	13230	13240	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320667
68	NC_022161	AT	6	13440	13453	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_022161	TTAA	3	13700	13710	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_022161	CATT	3	14050	14060	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320666
71	NC_022161	TA	7	14641	14654	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320667
72	NC_022161	AT	7	14666	14678	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320667
73	NC_022161	TTAT	3	15377	15388	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_022161	TAA	4	15476	15488	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_022161	TAA	5	15825	15839	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022161	AT	8	15992	16007	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_022161	AT	7	16410	16423	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_022161	AT	6	16534	16544	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022161	AT	6	16579	16590	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_022161	AT	6	17858	17869	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_022161	TTA	4	17871	17881	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_022161	TAC	4	18118	18129	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
83	NC_022161	TTTA	4	18511	18526	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_022161	TA	6	18732	18744	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_022161	AT	6	18881	18891	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_022161	TA	6	18944	18955	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_022161	TAA	4	18992	19003	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_022161	AT	6	19385	19396	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_022161	TAAAA	4	20443	20462	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
90	NC_022161	TAAAA	3	20465	20479	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	53320666
91	NC_022161	TGTATT	4	21174	21197	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	8 %	53320666
92	NC_022161	AT	7	21631	21645	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_022161	TA	6	21722	21732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_022161	AT	7	21808	21820	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_022161	AT	7	21823	21836	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_022161	AAT	4	21969	21979	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320667
97	NC_022161	TAT	4	22003	22014	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320667
98	NC_022161	AT	6	22029	22039	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320667
99	NC_022161	ATA	4	22086	22097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320667
100	NC_022161	AT	6	22220	22231	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320666
101	NC_022161	TAT	4	22338	22348	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320666
102	NC_022161	AGT	4	22426	22437	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320666
103	NC_022161	AT	6	22840	22850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320666
104	NC_022161	ATA	4	23232	23242	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320666
105	NC_022161	AGCTAC	3	23293	23310	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	53320666
106	NC_022161	TA	7	23437	23449	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320666
107	NC_022161	TTA	4	23805	23815	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320666
108	NC_022161	TA	6	23861	23874	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_022161	TA	6	24049	24060	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_022161	ATAA	3	24368	24379	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022161	TTA	4	24591	24601	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320667
112	NC_022161	TA	7	24652	24665	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_022161	AT	6	24727	24737	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_022161	AT	11	24874	24894	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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