ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida tetrigidarum strain NRRL Y-48142 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022157	ACTA	3	280	291	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_022157	GGTAT	5	298	322	25	20 %	40 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022157	GTAT	3	376	386	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_022157	GTAT	3	868	878	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_022157	GTA	4	1760	1772	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_022157	TA	6	2022	2032	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_022157	TA	6	2342	2352	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_022157	TA	6	2768	2778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_022157	CTA	5	3217	3230	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
10	NC_022157	ATA	4	3266	3277	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_022157	TAC	4	3304	3315	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
12	NC_022157	TAA	4	3642	3653	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_022157	TAA	4	3722	3733	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022157	ATAACA	4	3764	3787	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
15	NC_022157	TAGA	3	4047	4057	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022157	TA	6	4115	4125	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_022157	TAGA	3	4318	4328	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_022157	TAG	4	4410	4420	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_022157	CATA	3	4919	4930	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022157	ATAGTA	3	4951	4967	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_022157	ATAGTA	4	4988	5010	23	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_022157	AGAGT	3	5083	5097	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_022157	AGAGT	3	5117	5131	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_022157	AT	6	5556	5566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_022157	TAGAG	3	5711	5725	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_022157	ATAC	3	5833	5844	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022157	AGTAA	3	6010	6024	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022157	TAG	4	6946	6956	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_022157	AAGT	3	6973	6983	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_022157	TAAG	3	8401	8413	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_022157	TATAC	6	8707	8740	34	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
32	NC_022157	TTA	4	8799	8810	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_022157	CTAA	3	9715	9725	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_022157	ATA	4	9804	9816	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_022157	CTAT	4	9990	10005	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
36	NC_022157	TAG	5	10206	10219	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_022157	AGT	5	10383	10396	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_022157	ACCT	3	10550	10560	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
39	NC_022157	ATA	4	11122	11134	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_022157	ACCT	3	11178	11188	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_022157	AGTAA	5	11314	11338	25	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_022157	GTAA	3	11427	11438	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_022157	AAT	4	11933	11944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_022157	CTAT	6	12015	12038	24	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_022157	AGTA	3	12320	12330	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_022157	AGAAT	4	12546	12564	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
47	NC_022157	AGT	4	12620	12631	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_022157	GTA	4	12760	12771	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_022157	AAT	4	12907	12918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_022157	CCAT	3	13066	13077	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
51	NC_022157	ATA	4	13338	13349	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_022157	AAT	4	13437	13448	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_022157	AGATAA	3	13521	13539	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_022157	AACT	3	13765	13775	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_022157	GTA	4	14250	14260	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_022157	AGT	5	14490	14505	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_022157	CAT	4	14912	14922	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
58	NC_022157	TTAC	3	15101	15112	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_022157	GTTA	3	15218	15229	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_022157	TA	7	15835	15848	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_022157	TAC	5	16168	16183	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
62	NC_022157	TTATCT	3	17135	17153	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
63	NC_022157	TAT	4	17325	17336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_022157	ATGG	3	17597	17608	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_022157	TAC	4	17749	17760	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
66	NC_022157	CTA	4	18044	18055	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
67	NC_022157	ATAG	6	18636	18659	24	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_022157	TTACT	5	19341	19365	25	20 %	60 %	0 %	20 %	4 %	Non-Coding
69	NC_022157	TAGG	3	19485	19495	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_022157	TTA	4	19543	19554	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_022157	TA	6	19964	19974	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_022157	ACT	5	20456	20469	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
73	NC_022157	ATAG	3	20669	20684	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_022157	TTAG	3	20949	20959	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_022157	TGA	4	21209	21221	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_022157	ATAGT	6	21936	21965	30	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_022157	CTTA	3	22261	22273	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
78	NC_022157	TA	6	22558	22568	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022157	CTA	4	23718	23728	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
80	NC_022157	TAT	4	24012	24022	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_022157	TTACT	3	24650	24664	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022157	TATAC	3	24945	24959	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
83	NC_022157	TTGA	3	25158	25168	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_022157	CT	7	25424	25437	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
85	NC_022157	TACTAT	4	25664	25686	23	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
86	NC_022157	TACTAT	3	25707	25723	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
87	NC_022157	TATG	3	25744	25755	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_022157	CTA	4	26254	26264	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
89	NC_022157	TGTTAT	4	26887	26910	24	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_022157	TAT	4	26945	26956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_022157	GTA	4	27359	27370	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_022157	TTA	5	27399	27413	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_022157	TA	6	27896	27906	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_022157	GAT	4	28453	28464	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_022157	GTTA	3	28520	28530	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_022157	CATTA	4	28607	28626	20	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
97	NC_022157	TAC	4	28902	28914	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
98	NC_022157	ATA	4	29733	29743	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_022157	ATAC	3	29796	29806	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
100	NC_022157	TTA	4	29995	30005	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_022157	TAGA	3	30203	30213	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_022157	CTTTA	3	30262	30276	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
103	NC_022157	CATAC	5	30351	30375	25	40 %	20 %	0 %	40 %	8 %	Non-Coding
104	NC_022157	TTA	4	30429	30440	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_022157	TAA	4	30830	30841	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320658
106	NC_022157	AAGT	3	31324	31335	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_022157	TTA	4	31911	31922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_022157	ATAG	5	32304	32324	21	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320657
109	NC_022157	AGT	4	33184	33194	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320657
110	NC_022157	ATT	4	33605	33616	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320658
111	NC_022157	TAT	4	33874	33885	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320657
112	NC_022157	TTAT	3	34133	34145	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320657
113	NC_022157	CAT	4	34862	34873	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320657
114	NC_022157	CTA	4	36056	36067	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
115	NC_022157	TA	6	38186	38196	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320657
116	NC_022157	ATTT	3	38501	38512	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53320657
117	NC_022157	CCA	4	38871	38882	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	53320657
118	NC_022157	TTA	4	38990	39000	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320657
119	NC_022157	AGT	4	39048	39058	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320657
120	NC_022157	TTAA	3	40396	40407	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320657
121	NC_022157	AAG	4	40863	40875	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	53320657
122	NC_022157	AATAT	3	41137	41150	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_022157	TTTC	3	41439	41451	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	53320657
124	NC_022157	TAAA	3	41728	41740	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320657
125	NC_022157	ATA	5	42544	42558	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320657
126	NC_022157	ACCTGT	3	43962	43979	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	53320657
127	NC_022157	GTAA	3	44087	44097	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320657
128	NC_022157	TA	6	44406	44416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_022157	ATAG	3	44584	44595	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	53320658
130	NC_022157	ATGT	3	46514	46524	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_022157	TAC	4	46896	46907	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320657
132	NC_022157	AT	6	47854	47864	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320658
133	NC_022157	ATAG	3	49244	49254	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_022157	CTAT	3	50689	50699	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
135	NC_022157	TATT	3	51304	51315	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_022157	TAG	5	51409	51423	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
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138	NC_022157	AGTA	3	52343	52355	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida tetrigidarum strain NRRL Y-48142 mitochondrion