ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida pseudojiufengensis strain AS2.3693 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022156	TTTA	3	297	308	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53320655
2	NC_022156	ATT	4	357	369	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320655
3	NC_022156	TAT	8	408	431	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320655
4	NC_022156	TA	6	564	574	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320655
5	NC_022156	TAA	4	827	838	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320655
6	NC_022156	CCA	4	1156	1167	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	53320655
7	NC_022156	TTTA	3	1388	1399	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53320655
8	NC_022156	ATTAT	3	1692	1707	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	53320655
9	NC_022156	AT	7	1850	1863	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320655
10	NC_022156	AT	7	2123	2135	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_022156	AT	6	2269	2279	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_022156	TA	7	2294	2306	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_022156	TA	9	2436	2453	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_022156	AT	7	2638	2650	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_022156	AT	9	2665	2681	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_022156	CTA	4	2875	2886	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_022156	ATTT	3	3340	3351	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022156	TA	6	3519	3529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_022156	TAG	4	3708	3718	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_022156	AT	6	3843	3855	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_022156	TA	7	3947	3959	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_022156	CTTCG	3	4419	4433	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	Non-Coding
23	NC_022156	GGAG	3	4465	4476	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022156	TTATAT	4	4561	4584	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
25	NC_022156	AT	7	4942	4957	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_022156	TA	6	5080	5090	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_022156	AT	6	5138	5148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_022156	TATC	3	5471	5482	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_022156	ATA	4	5808	5820	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_022156	AT	7	6076	6088	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_022156	AAAT	3	6273	6283	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320656
32	NC_022156	AT	6	6288	6299	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320656
33	NC_022156	TAT	4	6350	6361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320656
34	NC_022156	TATT	3	7282	7293	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_022156	GATA	3	7410	7421	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_022156	CTT	4	7595	7606	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
37	NC_022156	AT	6	7708	7718	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_022156	TTTTAT	3	8363	8380	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	53320656
39	NC_022156	AGAATT	3	8558	8576	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10 %	53320656
40	NC_022156	TAGA	3	9503	9515	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	53320656
41	NC_022156	TAT	4	9605	9615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320656
42	NC_022156	AT	7	9726	9738	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_022156	ATATAA	3	10091	10107	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_022156	TTAT	3	10198	10209	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_022156	G	12	10314	10325	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022156	AT	6	10346	10356	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_022156	ATAA	3	10464	10475	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022156	TA	7	10635	10647	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_022156	TA	6	10726	10736	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_022156	TA	6	11580	11590	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_022156	TA	6	11600	11610	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_022156	TA	13	11968	11991	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_022156	AT	7	12111	12123	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_022156	AAAT	3	12124	12135	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_022156	AT	8	12489	12503	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_022156	AT	7	12513	12528	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_022156	TA	6	12652	12663	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_022156	TATAAA	3	12670	12687	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_022156	TA	6	12817	12829	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_022156	C	13	12893	12905	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
61	NC_022156	TA	7	12967	12980	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_022156	TAA	4	13017	13028	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_022156	TAT	5	13111	13125	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_022156	TTATA	3	13174	13187	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_022156	TAT	4	13274	13286	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_022156	AT	6	13294	13304	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_022156	TTATA	3	13452	13465	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_022156	AT	8	13515	13531	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_022156	TAT	4	13529	13539	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_022156	TA	6	13571	13582	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_022156	AT	7	13622	13634	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_022156	TAA	4	13676	13688	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_022156	TTATT	3	13829	13844	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_022156	AT	7	13851	13863	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_022156	TAT	5	14004	14018	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_022156	AT	7	14027	14040	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_022156	CTAT	3	14157	14168	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
78	NC_022156	TA	6	14237	14247	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022156	TA	6	14392	14402	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_022156	TAAA	3	14411	14422	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022156	TAT	6	14442	14458	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320656
82	NC_022156	AT	6	14553	14563	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
83	NC_022156	TAT	4	14831	14841	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320656
84	NC_022156	TTAA	3	14884	14896	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320656
85	NC_022156	ATT	4	15162	15173	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320656
86	NC_022156	TTA	5	15184	15198	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320656
87	NC_022156	AT	6	15390	15400	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
88	NC_022156	TTAT	3	15423	15434	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53320656
89	NC_022156	TA	7	15524	15536	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320656
90	NC_022156	AT	6	15542	15553	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320656
91	NC_022156	TTTA	3	15856	15866	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320656
92	NC_022156	ATT	4	16129	16139	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320656
93	NC_022156	TAA	4	16159	16170	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320656
94	NC_022156	AT	6	16197	16208	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320656
95	NC_022156	ATT	4	16381	16392	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320656
96	NC_022156	AAT	4	16448	16458	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320656
97	NC_022156	TTC	4	16631	16641	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53320656
98	NC_022156	TA	6	16728	16738	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_022156	AT	7	16743	16756	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_022156	TA	6	17215	17225	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_022156	TAT	4	17529	17539	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320656
102	NC_022156	AT	13	17742	17766	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_022156	TAA	4	17774	17785	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_022156	ATT	4	17862	17874	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320656
105	NC_022156	AT	6	19115	19125	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320657
106	NC_022156	TA	6	19169	19179	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320657
107	NC_022156	TCCC	3	19216	19226	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	53320657
108	NC_022156	AT	7	19412	19425	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320657
109	NC_022156	TA	6	19688	19698	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320657
110	NC_022156	ATT	4	19882	19893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320657
111	NC_022156	AT	7	20044	20056	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320657
112	NC_022156	GATA	3	20176	20187	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	53320657
113	NC_022156	AT	6	20274	20285	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320657
114	NC_022156	TTA	7	20496	20516	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320657
115	NC_022156	ATT	4	20540	20551	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320657
116	NC_022156	TATTTA	3	20853	20869	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320657
117	NC_022156	AT	6	21489	21499	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320657
118	NC_022156	GATAT	3	21557	21571	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	53320657
119	NC_022156	TA	7	22330	22343	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320657
120	NC_022156	C	12	22471	22482	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	53320657
121	NC_022156	ATA	5	22761	22776	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320657
122	NC_022156	GGA	5	23055	23068	14	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	53320657
123	NC_022156	TA	12	23112	23134	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320657
124	NC_022156	TA	10	23313	23331	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	53320657
125	NC_022156	TTAA	3	23466	23478	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320657
126	NC_022156	G	15	23676	23690	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_022156	TA	6	23775	23785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_022156	TCCC	3	24038	24048	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
129	NC_022156	TA	16	24280	24310	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_022156	TAT	4	24320	24330	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_022156	AT	6	25093	25105	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320656
132	NC_022156	ATT	4	25425	25436	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320656
133	NC_022156	CAT	4	25463	25474	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320656
134	NC_022156	ATTT	3	25807	25817	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_022156	AT	7	25818	25831	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_022156	AT	11	26433	26455	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_022156	TA	6	26881	26892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_022156	TTTA	3	26954	26964	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_022156	AT	12	27170	27192	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_022156	AT	6	27548	27558	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_022156	AT	6	27584	27595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_022156	TA	7	27755	27768	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_022156	ATAA	4	27931	27946	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
144	NC_022156	TTA	4	28162	28172	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320657
145	NC_022156	TTA	4	28306	28316	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_022156	AT	6	28368	28378	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_022156	ATA	4	28392	28402	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
148	NC_022156	TA	6	28495	28507	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_022156	TA	10	28515	28536	22	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
150	NC_022156	CCT	4	28547	28557	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
151	NC_022156	ATT	4	29139	29150	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320656
152	NC_022156	TAAA	3	29328	29338	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320656
153	NC_022156	TAT	4	29389	29400	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320656
154	NC_022156	ATA	4	29580	29590	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320656
155	NC_022156	AAAT	3	29758	29768	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320656
156	NC_022156	TAA	4	29845	29855	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320656
157	NC_022156	TAA	5	29992	30006	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320656
158	NC_022156	AT	6	30086	30096	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
159	NC_022156	AT	6	30639	30649	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
160	NC_022156	TAA	4	30871	30882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320656
161	NC_022156	ATTT	3	31128	31140	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320656
162	NC_022156	AT	7	31212	31224	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320656
163	NC_022156	TA	6	31288	31299	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320656
164	NC_022156	TA	8	31330	31344	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320656
165	NC_022156	AT	9	31338	31354	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320656
166	NC_022156	AT	6	31631	31641	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
167	NC_022156	TA	7	31906	31919	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320656
168	NC_022156	ATTT	3	31920	31930	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320656
169	NC_022156	GAT	4	32039	32049	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53320656
170	NC_022156	AT	6	32392	32402	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
171	NC_022156	TAT	4	32405	32415	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320656
172	NC_022156	TA	16	32530	32562	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320656
173	NC_022156	TTA	4	32785	32795	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320656
174	NC_022156	TTC	4	32862	32873	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53320656
175	NC_022156	AAAT	3	33177	33189	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
176	NC_022156	TA	13	33379	33404	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
177	NC_022156	TATT	3	33614	33625	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida pseudojiufengensis strain AS2.3693 mitochondrion