ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida saraburiensis strain KU-Xs13 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022152	AGAT	3	165	175	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53320649
2	NC_022152	TAT	4	242	253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320649
3	NC_022152	TTA	4	1237	1249	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320649
4	NC_022152	ATA	4	1360	1371	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320649
5	NC_022152	TTA	4	1366	1377	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320649
6	NC_022152	ATA	4	1607	1617	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320649
7	NC_022152	TAG	4	2082	2093	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320649
8	NC_022152	AATT	3	2264	2275	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	53320649
9	NC_022152	GA	7	2428	2441	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_022152	ACAT	3	2460	2470	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_022152	AT	6	2802	2812	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_022152	AT	7	3337	3350	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_022152	ATA	4	3497	3508	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022152	ATA	8	4652	4674	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_022152	TA	6	4676	4686	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022152	AATAA	3	4698	4712	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_022152	CTAG	3	4857	4869	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	53320649
18	NC_022152	AT	6	5352	5362	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320649
19	NC_022152	ATATTA	3	5448	5465	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320649
20	NC_022152	AATGA	3	5477	5490	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	53320649
21	NC_022152	AAC	4	5683	5694	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53320649
22	NC_022152	AATA	3	5890	5902	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320649
23	NC_022152	AT	6	6108	6121	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_022152	ATT	4	6297	6308	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_022152	TAA	4	6309	6319	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_022152	ATA	5	7342	7355	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320649
27	NC_022152	ATA	4	7606	7616	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320649
28	NC_022152	TAA	4	8000	8011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320649
29	NC_022152	TAA	4	8129	8139	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320649
30	NC_022152	TTA	6	8493	8510	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320649
31	NC_022152	ATT	4	8534	8545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320649
32	NC_022152	ATTA	3	8808	8818	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320649
33	NC_022152	ATA	4	9483	9494	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320649
34	NC_022152	AT	6	9508	9518	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320649
35	NC_022152	TAA	4	9874	9885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320649
36	NC_022152	ATT	4	10051	10062	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320649
37	NC_022152	AT	6	11046	11057	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320648
38	NC_022152	AAAAAG	3	11235	11253	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	53320648
39	NC_022152	AAT	4	11339	11351	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_022152	ATA	4	11407	11417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_022152	TTA	5	11437	11451	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_022152	TAT	5	11604	11618	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_022152	CTT	4	11885	11897	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	53320650
44	NC_022152	ATC	4	11983	11994	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320650
45	NC_022152	TTA	4	12158	12169	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320650
46	NC_022152	ATTT	3	12820	12832	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53320650
47	NC_022152	TAT	4	13703	13713	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_022152	TTGA	3	13789	13800	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_022152	AAT	4	14065	14076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_022152	TTAA	3	14207	14218	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_022152	ATAA	3	14228	14239	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022152	AT	9	14338	14354	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_022152	AT	8	14698	14712	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_022152	TAA	4	14714	14726	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_022152	TATAAA	4	15492	15515	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_022152	AATT	3	15597	15608	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_022152	TTA	4	16023	16033	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320649
58	NC_022152	TATC	4	16337	16351	15	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	53320648
59	NC_022152	TAT	5	16435	16449	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320648
60	NC_022152	TAA	5	16787	16801	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320648
61	NC_022152	TA	8	16952	16967	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320648
62	NC_022152	AT	6	17841	17851	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320648
63	NC_022152	AT	6	18094	18106	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_022152	TAAA	3	18253	18263	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_022152	TAT	4	18404	18414	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_022152	GGAA	3	18647	18658	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_022152	AAT	4	18805	18815	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_022152	TA	6	18816	18828	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_022152	ATCT	3	19002	19013	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53320648
70	NC_022152	TAT	4	19109	19119	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320648
71	NC_022152	ATTA	3	19186	19198	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320648
72	NC_022152	ATT	4	19230	19242	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320648
73	NC_022152	TA	8	19294	19308	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320648
74	NC_022152	AATAT	3	19452	19466	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	53320648
75	NC_022152	AAT	4	19503	19513	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320648
76	NC_022152	TAAA	3	19673	19683	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320648
77	NC_022152	ATA	4	20093	20104	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320648
78	NC_022152	ATTA	3	20133	20143	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320648
79	NC_022152	ACTA	3	20304	20314	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	53320648
80	NC_022152	TAAAA	3	20343	20357	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	53320648
81	NC_022152	ATTA	3	20496	20508	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320648
82	NC_022152	CAT	4	20680	20691	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320649
83	NC_022152	TAA	4	20726	20737	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320649
84	NC_022152	ACAT	3	21054	21064	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
85	NC_022152	TA	6	21423	21433	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320649
86	NC_022152	TTA	4	22037	22048	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320649
87	NC_022152	TAT	4	22268	22278	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320649
88	NC_022152	CTTA	3	22285	22295	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320649
89	NC_022152	ATTG	3	22548	22558	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53320649
90	NC_022152	TTAA	3	22905	22915	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_022152	CTC	5	23355	23368	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
92	NC_022152	ATTTAT	3	23557	23574	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_022152	ATTA	3	23767	23777	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320649
94	NC_022152	TAA	4	23828	23839	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320649
95	NC_022152	TAG	4	24350	24361	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53320649
96	NC_022152	TAT	4	24414	24424	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320649
97	NC_022152	AAT	4	24706	24719	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_022152	AGA	4	24724	24735	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_022152	AAAAAT	3	25050	25068	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
100	NC_022152	ATA	4	25088	25098	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_022152	AAAT	3	25326	25336	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_022152	TAT	4	25693	25705	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_022152	AT	6	25721	25731	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_022152	ATT	5	25909	25922	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_022152	TAT	4	26102	26112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_022152	TTAT	3	26139	26149	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_022152	ATATT	3	26216	26229	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_022152	AT	6	26292	26303	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_022152	ATA	4	26632	26644	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_022152	GAATA	3	26687	26700	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_022152	TATT	3	26792	26803	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_022152	TTTA	3	26821	26832	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_022152	ATTT	3	27001	27011	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_022152	TAT	4	27239	27249	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_022152	ATTT	3	27260	27272	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_022152	TTTCT	3	27383	27396	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
117	NC_022152	TTCTT	3	27403	27417	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
118	NC_022152	ATTCTT	3	27593	27611	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
119	NC_022152	TAT	5	27619	27634	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_022152	TTTA	3	27636	27647	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_022152	TTATA	3	27654	27668	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_022152	ATA	4	27913	27923	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_022152	CTA	4	27976	27987	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
124	NC_022152	TAC	4	28495	28506	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
125	NC_022152	TAAA	3	28572	28583	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022152	ATA	4	28588	28599	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_022152	TTA	4	28790	28800	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_022152	TTA	4	28808	28819	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_022152	TAA	4	29295	29307	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_022152	ATA	4	29335	29345	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_022152	AT	6	29564	29574	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_022152	TAAT	3	30286	30297	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_022152	TATAA	3	30325	30339	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_022152	ATA	4	30516	30527	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_022152	AAGT	3	30716	30727	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_022152	TA	9	30902	30919	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
137	NC_022152	TCTA	3	31470	31480	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_022152	AT	7	31866	31878	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_022152	GAA	4	31928	31939	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_022152	TA	7	32106	32119	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida saraburiensis strain KU-Xs13 mitochondrion