ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022151	TAAAAA	14	8323	8406	84	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_022151	AAATAT	3	8723	8741	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	53320647
3	NC_022151	ATTATA	4	9529	9552	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_022151	TATAAC	4	13896	13919	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
5	NC_022151	ATTAAA	3	17397	17414	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53320645
6	NC_022151	AACTTA	5	17489	17517	29	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	6 %	53320645
7	NC_022151	ATAAAA	6	18897	18932	36	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_022151	TAATAT	3	20326	20343	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	53320646
9	NC_022151	AAATTC	4	20344	20367	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	4 %	53320646
10	NC_022151	ATAAAA	6	20987	21024	38	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_022151	AAATTA	8	21089	21136	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_022151	TATCAT	3	23208	23225	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
13	NC_022151	TTAAAT	4	23226	23249	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022151	ATATTA	3	23265	23282	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_022151	TTCCTT	3	23831	23849	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
16	NC_022151	GTTATA	10	24111	24170	60	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_022151	TTAATA	4	24272	24295	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_022151	TTAATG	6	24272	24312	41	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_022151	AATAAA	4	24360	24383	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_022151	AATAAA	4	24881	24904	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_022151	AAATTT	3	25879	25897	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_022151	AAAATA	3	26142	26159	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_022151	TATATT	3	26463	26479	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_022151	AAATTT	3	26537	26555	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_022151	TAATAT	5	27003	27032	30	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_022151	AAATAA	3	27482	27499	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_022151	ATTTAT	3	27506	27523	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_022151	TAAGAG	4	28129	28152	24	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_022151	ATAATG	5	30832	30866	35	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_022151	AAATAA	3	31890	31908	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_022151	TTTATT	4	33992	34017	26	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_022151	TGATTA	6	34106	34142	37	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_022151	TTTAAT	3	35265	35283	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	53320646
34	NC_022151	ATTAAA	3	36576	36593	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
35	NC_022151	ATTAAT	4	36969	36992	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_022151	TTTAAA	4	37786	37809	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
37	NC_022151	AAATAA	3	37914	37931	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_022151	AAATTT	3	40966	40984	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	53320646
39	NC_022151	TTTATT	4	41973	41996	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
40	NC_022151	TATAGT	6	42161	42195	35	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_022151	TAATTC	4	42369	42392	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
42	NC_022151	AATATT	3	42673	42691	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_022151	ATTTGA	3	44721	44738	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	53320645
44	NC_022151	AATTAA	3	44910	44927	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320645
45	NC_022151	TAAATT	3	48580	48597	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	53320645
46	NC_022151	ATTATC	5	49843	49872	30	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	3 %	53320645
47	NC_022151	ATTATC	4	49882	49905	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	53320645
48	NC_022151	TATTAG	7	49923	49964	42	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	9 %	53320645
49	NC_022151	TATAAG	3	50914	50931	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	53320645

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion