ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022151	ATTAA	8	7218	7257	40	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022151	ATAA	3	7258	7269	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022151	TAAA	3	8305	8316	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022151	TAAAAA	11	8335	8400	66	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022151	A	12	8518	8529	12	100 %	0 %	0 %	0 %	53320647
6	NC_022151	TATT	6	9313	9336	24	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022151	TTAAT	5	12538	12562	25	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022151	TAAA	5	13928	13947	20	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022151	AATAAA	3	13942	13959	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022151	TAT	5	14096	14110	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022151	ATTA	6	14577	14600	24	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022151	TAA	9	15097	15123	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320645
13	NC_022151	TAA	4	15835	15846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320645
14	NC_022151	ATTTA	10	16112	16161	50	40 %	60 %	0 %	0 %	53320645
15	NC_022151	AATTT	4	16409	16428	20	40 %	60 %	0 %	0 %	53320645
16	NC_022151	AACTTA	4	17489	17512	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	53320645
17	NC_022151	TTA	4	18426	18437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320645
18	NC_022151	ATT	4	18722	18733	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022151	TATAT	3	18743	18757	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022151	AATTA	4	18767	18786	20	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022151	ATAAAA	5	18897	18926	30	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022151	TAA	5	19269	19283	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320646
23	NC_022151	ATTT	3	19735	19746	12	25 %	75 %	0 %	0 %	53320646
24	NC_022151	TAA	5	20038	20052	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320646
25	NC_022151	ATA	4	20235	20246	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320646
26	NC_022151	AAATTC	3	20344	20361	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	53320646
27	NC_022151	ATAAAA	3	21001	21018	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022151	AAATTA	6	21095	21130	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022151	TTA	5	21128	21142	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022151	ATTA	3	21161	21172	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022151	TAAT	4	22385	22400	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022151	AT	6	22409	22420	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022151	TAAAT	3	23041	23055	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022151	AATTTA	3	23223	23240	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022151	ATT	4	23301	23312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022151	TTTTA	3	23515	23529	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022151	TAAA	4	23987	24002	16	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022151	GTTATA	5	24111	24140	30	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022151	GTTATT	5	24141	24170	30	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022151	TTAATG	4	24284	24307	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022151	AATAAA	3	24360	24377	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022151	TTATA	4	24846	24865	20	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022151	ATTA	3	24866	24877	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022151	AATAAA	3	24881	24898	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022151	TATAC	4	25136	25155	20	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022151	TAA	7	25279	25299	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022151	ATTTA	3	25561	25575	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022151	TAAT	3	25665	25676	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022151	TAATAT	3	27003	27020	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022151	ATA	5	27490	27504	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022151	ATAA	3	28111	28122	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022151	TAAGAG	3	28135	28152	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022151	TAAT	3	28403	28414	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022151	TAA	4	28489	28500	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022151	TAAA	5	28775	28794	20	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022151	AATA	3	29141	29152	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022151	TTA	5	29900	29914	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022151	ATAATG	3	30837	30854	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022151	AAT	4	31369	31380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022151	ATAA	3	31638	31649	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022151	TAA	6	31858	31875	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022151	ATA	4	32080	32091	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022151	TGATTA	4	34113	34136	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022151	ATTAT	5	34380	34404	25	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022151	ATTA	3	35572	35583	12	50 %	50 %	0 %	0 %	53320647
66	NC_022151	TTAAG	4	36196	36215	20	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022151	TTTAAA	3	37786	37803	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022151	TAT	4	39124	39135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022151	AT	6	39701	39712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022151	ATT	4	40034	40045	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320646
71	NC_022151	TAT	4	40093	40104	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320646
72	NC_022151	TAT	7	40387	40407	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320646
73	NC_022151	TAT	6	40477	40494	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320646
74	NC_022151	TAT	5	41191	41205	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320646
75	NC_022151	ATATT	3	41608	41622	15	40 %	60 %	0 %	0 %	53320646
76	NC_022151	TTTTAT	3	41774	41791	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022151	TATAGT	3	42166	42183	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022151	TAA	4	42204	42215	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022151	TTTAT	3	42526	42540	15	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022151	TA	6	42780	42791	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022151	TAT	4	44750	44761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320645
82	NC_022151	AATTAA	3	44910	44927	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320645
83	NC_022151	TTTAA	3	45277	45291	15	40 %	60 %	0 %	0 %	53320645
84	NC_022151	TAAT	3	45455	45466	12	50 %	50 %	0 %	0 %	53320645
85	NC_022151	ATA	4	46749	46760	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53320645
86	NC_022151	ATTA	4	47066	47081	16	50 %	50 %	0 %	0 %	53320645
87	NC_022151	AATT	3	48079	48090	12	50 %	50 %	0 %	0 %	53320645
88	NC_022151	TAAATT	3	48580	48597	18	50 %	50 %	0 %	0 %	53320645
89	NC_022151	ATTATC	4	49843	49866	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	53320645
90	NC_022151	ATT	4	49894	49905	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320645
91	NC_022151	ATT	4	49915	49926	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53320645

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