ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022151	ATT	4	587	598	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_022151	TGA	4	668	680	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_022151	AAT	4	848	859	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_022151	TAA	4	1341	1352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_022151	AAT	4	1370	1381	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_022151	TAA	4	4109	4120	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022151	TAT	4	5211	5221	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320647
8	NC_022151	TAA	4	7202	7213	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_022151	TTG	4	7866	7877	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	53320647
10	NC_022151	ATA	4	8638	8649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320647
11	NC_022151	TAT	4	11581	11593	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320646
12	NC_022151	TAT	4	11653	11664	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
13	NC_022151	ATT	4	11808	11819	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
14	NC_022151	ATT	4	12170	12181	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320648
15	NC_022151	TTA	4	12834	12844	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320648
16	NC_022151	AAT	4	12997	13009	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320647
17	NC_022151	TAT	6	14094	14110	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_022151	ATT	4	14516	14527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_022151	TAA	9	15097	15123	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320645
20	NC_022151	TAA	5	15835	15848	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320645
21	NC_022151	TAA	4	16593	16604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320645
22	NC_022151	AAT	4	17200	17211	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320645
23	NC_022151	TTC	4	18047	18058	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53320645
24	NC_022151	TAT	4	18427	18438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
25	NC_022151	ATT	7	18720	18742	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_022151	TAA	6	19266	19283	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53320646
27	NC_022151	TAT	4	19332	19344	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320646
28	NC_022151	TAT	4	19591	19602	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
29	NC_022151	ATT	4	19676	19688	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320646
30	NC_022151	ATT	4	19890	19900	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320646
31	NC_022151	TTA	4	19942	19952	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320646
32	NC_022151	TAA	5	20038	20052	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320646
33	NC_022151	ATA	4	20235	20246	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320646
34	NC_022151	ATT	4	20264	20275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
35	NC_022151	ATA	4	20451	20461	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320646
36	NC_022151	TAT	4	20701	20711	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320647
37	NC_022151	TTA	7	21128	21149	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_022151	ATT	4	22706	22717	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_022151	ATT	4	23301	23312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022151	TAA	4	23322	23334	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_022151	TAA	4	24040	24052	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_022151	ATT	4	24562	24573	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_022151	TAA	9	25277	25302	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_022151	TAA	4	25684	25694	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_022151	TAA	4	25993	26003	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_022151	AAT	5	26042	26056	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_022151	ATA	4	26065	26075	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_022151	TAA	6	26169	26187	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_022151	TTA	5	26414	26428	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_022151	ATA	4	26486	26496	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_022151	ATA	4	26711	26721	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_022151	TAT	4	27275	27287	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_022151	TAA	4	28007	28017	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_022151	TAA	4	28156	28167	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_022151	ATA	4	28437	28449	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_022151	TAA	7	28486	28506	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_022151	ATA	5	29470	29484	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_022151	ATA	5	29499	29513	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_022151	TAT	4	29831	29841	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_022151	ATT	12	29890	29924	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_022151	ATA	4	30667	30678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_022151	AAT	4	31369	31380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022151	TAA	8	31858	31880	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
64	NC_022151	ATA	5	32080	32095	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_022151	ATA	4	32106	32116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320646
66	NC_022151	TAA	4	32134	32145	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320646
67	NC_022151	TAA	4	32206	32217	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320646
68	NC_022151	ATA	4	32485	32495	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320646
69	NC_022151	ATA	4	32781	32792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320646
70	NC_022151	AAT	4	33355	33366	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320646
71	NC_022151	TAA	4	33430	33440	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320646
72	NC_022151	ATA	4	33648	33659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_022151	TAT	4	33686	33696	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_022151	TAA	4	33711	33722	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_022151	ATA	4	34084	34095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_022151	ATA	4	34972	34984	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320646
77	NC_022151	TAT	4	35543	35553	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_022151	TAA	5	35606	35620	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320647
79	NC_022151	TAA	5	35627	35640	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320647
80	NC_022151	TAT	4	35786	35797	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320647
81	NC_022151	ATA	4	36224	36235	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_022151	AAT	4	37833	37843	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_022151	TAT	5	39124	39139	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_022151	ATT	5	40034	40049	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320646
85	NC_022151	TAT	5	40093	40106	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320646
86	NC_022151	ATT	6	40112	40129	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320646
87	NC_022151	TAT	4	40286	40296	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320646
88	NC_022151	TAT	9	40385	40409	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
89	NC_022151	TAT	8	40477	40500	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
90	NC_022151	TAT	4	40699	40710	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
91	NC_022151	TTA	4	40851	40862	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
92	NC_022151	TAT	4	41155	41166	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320646
93	NC_022151	TAT	6	41191	41207	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320646
94	NC_022151	TAA	4	41264	41276	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320646
95	NC_022151	TAA	4	41323	41336	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320646
96	NC_022151	TAA	4	41600	41611	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320646
97	NC_022151	TAA	5	42204	42218	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_022151	TAA	4	42839	42850	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_022151	ATT	4	43118	43129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
100	NC_022151	ATT	4	43500	43511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
101	NC_022151	AAT	4	43538	43548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320645
102	NC_022151	ATT	8	44739	44762	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	4 %	53320645
103	NC_022151	TTA	4	44794	44805	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
104	NC_022151	ATT	4	45234	45245	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
105	NC_022151	TTA	4	45480	45490	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320645
106	NC_022151	CCT	4	46664	46675	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53320645
107	NC_022151	ATA	4	46749	46760	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53320645
108	NC_022151	ATT	4	48029	48040	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
109	NC_022151	TAT	4	48534	48545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
110	NC_022151	TAA	4	48755	48765	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320645
111	NC_022151	TAA	4	49003	49014	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320645
112	NC_022151	ATT	4	49429	49440	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320645
113	NC_022151	ATT	7	49912	49932	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320645
114	NC_022151	ACT	4	50062	50073	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53320645

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Ogataea thermophila strain NCAIM Y.01608 mitochondrion