ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Glomus cerebriforme voucher DAOM:227022 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022144	AATT	3	13201	13211	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320635
2	NC_022144	TA	6	14213	14223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320635
3	NC_022144	TAAA	3	14768	14780	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53320635
4	NC_022144	AAGG	3	14804	14815	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	53320635
5	NC_022144	AACC	3	14859	14870	12	50 %	0 %	0 %	50 %	0 %	53320635
6	NC_022144	AAGA	3	18497	18508	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53320635
7	NC_022144	C	14	20056	20069	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
8	NC_022144	TTCT	4	20718	20733	16	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022144	AGGGA	3	20994	21008	15	40 %	0 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022144	CATT	3	22832	22843	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	53320635
11	NC_022144	TA	7	22855	22867	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320635
12	NC_022144	TTAC	3	23520	23531	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53320635
13	NC_022144	CT	7	24463	24475	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
14	NC_022144	CCCCGG	3	25118	25135	18	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	5 %	Non-Coding
15	NC_022144	TTGGC	3	26936	26949	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	53320636
16	NC_022144	TCTA	3	27639	27649	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320636
17	NC_022144	TTC	4	28427	28438	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53320636
18	NC_022144	GCT	4	28985	28995	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	53320636
19	NC_022144	AAAG	3	30542	30554	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_022144	CCT	4	30677	30689	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	Non-Coding
21	NC_022144	AACT	3	32629	32640	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
22	NC_022144	CTT	4	34129	34139	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
23	NC_022144	TTC	4	38831	38842	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022144	TTGA	3	38850	38860	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_022144	AGA	4	41653	41664	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_022144	AATA	3	43103	43113	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320636
27	NC_022144	CCT	4	43594	43604	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	53320636
28	NC_022144	ATCT	3	45618	45628	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320636
29	NC_022144	CCCCT	3	51178	51192	15	0 %	20 %	0 %	80 %	6 %	Non-Coding
30	NC_022144	TAA	4	55649	55659	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_022144	CTTC	3	56204	56215	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
32	NC_022144	TAAA	3	56349	56361	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_022144	CTT	4	56496	56507	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_022144	TCT	4	57757	57768	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53320637
35	NC_022144	AAG	4	58680	58691	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_022144	AG	6	59185	59195	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_022144	TCT	4	59616	59627	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Glomus cerebriforme voucher DAOM:227022 mitochondrion