ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lygodium japonicum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022136	AAT	4	1059	1070	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331028
2	NC_022136	TTA	4	6883	6893	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331028
3	NC_022136	ATT	4	29010	29021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331028
4	NC_022136	TTC	4	29727	29738	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331028
5	NC_022136	CCT	4	31002	31013	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331028
6	NC_022136	GCT	4	33002	33013	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331028
7	NC_022136	ATA	5	36739	36752	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331028
8	NC_022136	TAT	4	38888	38899	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331028
9	NC_022136	CCA	4	41150	41160	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	53331028
10	NC_022136	AAT	4	52892	52904	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331028
11	NC_022136	AAT	4	62004	62015	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331028
12	NC_022136	ATG	4	63339	63350	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53331028
13	NC_022136	AGA	4	66532	66542	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331028
14	NC_022136	TAT	4	68077	68088	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331035
15	NC_022136	GAA	4	70571	70582	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331035
16	NC_022136	CGA	4	80843	80854	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331035
17	NC_022136	TAC	5	85522	85537	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	53331035
18	NC_022136	GAA	4	89046	89056	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331035
19	NC_022136	AGA	5	89064	89077	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	53331035
20	NC_022136	GAG	5	89083	89097	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	53331035
21	NC_022136	CTT	4	89397	89407	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331035
22	NC_022136	GAG	5	89709	89722	14	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	53331035
23	NC_022136	AAG	4	90077	90087	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331035
24	NC_022136	CCT	4	91937	91948	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331035
25	NC_022136	GAA	4	100211	100222	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331035
26	NC_022136	GAA	4	100309	100320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331035
27	NC_022136	CGG	4	104144	104154	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	53331035
28	NC_022136	ATT	4	110837	110848	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331035
29	NC_022136	AAT	4	114216	114227	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331035
30	NC_022136	TAA	4	115840	115850	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331035
31	NC_022136	ATA	4	123960	123971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331035
32	NC_022136	TCC	4	128157	128168	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331035
33	NC_022136	TTA	4	129692	129702	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331035
34	NC_022136	AGG	4	150761	150772	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	53331028
35	NC_022136	CTT	4	152622	152632	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331028
36	NC_022136	CTC	5	152987	153000	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	53331028
37	NC_022136	GAA	4	153301	153311	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331028
38	NC_022136	TCC	5	153613	153630	18	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	53331028
39	NC_022136	TCT	4	153637	153647	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331028
40	NC_022136	AAT	4	154919	154929	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331028
41	NC_022136	AGT	4	157171	157186	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lygodium japonicum chloroplast