ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lygodium japonicum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022136	GATA	3	873	883	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53331028
2	NC_022136	AAT	4	1059	1070	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331028
3	NC_022136	CAAA	3	2936	2946	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	53331028
4	NC_022136	AGATAG	3	3407	3424	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	53331028
5	NC_022136	ATTA	3	3853	3863	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331028
6	NC_022136	TTTCT	3	3912	3925	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	53331028
7	NC_022136	TTTC	3	4124	4135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	53331028
8	NC_022136	GAAA	3	4811	4821	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	53331028
9	NC_022136	TTA	4	6883	6893	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331028
10	NC_022136	AAAG	3	7530	7541	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331028
11	NC_022136	TCTA	3	7659	7671	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	53331028
12	NC_022136	TCTTT	3	8006	8019	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	53331028
13	NC_022136	TCTT	3	8158	8168	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331028
14	NC_022136	A	13	8548	8560	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	53331028
15	NC_022136	AATG	3	9136	9147	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	53331028
16	NC_022136	AT	6	10097	10108	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331028
17	NC_022136	AAAT	3	10442	10454	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	53331028
18	NC_022136	TTTC	3	12595	12606	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	53331028
19	NC_022136	CTTT	3	13907	13917	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331028
20	NC_022136	TTTC	3	20164	20174	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331028
21	NC_022136	TG	6	23305	23315	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	53331028
22	NC_022136	TCAA	3	27430	27441	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	53331028
23	NC_022136	ATT	4	29010	29021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331028
24	NC_022136	TTC	4	29727	29738	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331028
25	NC_022136	CTTTT	3	29745	29758	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	53331028
26	NC_022136	CCT	4	31002	31013	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331028
27	NC_022136	GATA	3	31111	31122	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	53331028
28	NC_022136	TA	8	31132	31147	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53331028
29	NC_022136	TA	12	31915	31938	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331028
30	NC_022136	TC	6	32100	32111	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	53331028
31	NC_022136	TA	6	32219	32229	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331028
32	NC_022136	AAGA	3	32552	32562	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	53331028
33	NC_022136	GCT	4	33002	33013	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331028
34	NC_022136	CT	6	35653	35663	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	53331028
35	NC_022136	G	13	36092	36104	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	53331028
36	NC_022136	ATA	5	36739	36752	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331028
37	NC_022136	TTCT	3	37068	37078	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331028
38	NC_022136	GGAC	3	37892	37903	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	53331028
39	NC_022136	CTTT	3	37935	37945	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331028
40	NC_022136	T	14	38177	38190	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53331028
41	NC_022136	TAT	4	38888	38899	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331028
42	NC_022136	GA	6	40685	40695	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	53331028
43	NC_022136	CCA	4	41150	41160	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	53331028
44	NC_022136	GATT	3	43318	43329	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	53331028
45	NC_022136	GTTT	3	47595	47606	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	53331028
46	NC_022136	A	14	48170	48183	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	53331028
47	NC_022136	TACT	3	50585	50595	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53331028
48	NC_022136	TTTC	3	51456	51466	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331028
49	NC_022136	AAT	4	52892	52904	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331028
50	NC_022136	GAAA	3	53912	53923	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	53331028
51	NC_022136	TTTC	3	53934	53945	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	53331028
52	NC_022136	TTTA	3	57762	57773	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53331028
53	NC_022136	ATAG	3	58876	58887	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	53331028
54	NC_022136	ATGT	3	59205	59216	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	53331028
55	NC_022136	TGGG	3	59316	59327	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	53331028
56	NC_022136	ATGA	3	60483	60494	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	53331028
57	NC_022136	TTTC	3	61761	61772	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	53331028
58	NC_022136	AGCA	3	61789	61799	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	53331028
59	NC_022136	AAT	4	62004	62015	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331028
60	NC_022136	ATG	4	63339	63350	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53331028
61	NC_022136	TCTT	3	63546	63557	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	53331028
62	NC_022136	TTTA	3	64780	64791	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53331028
63	NC_022136	TAAA	4	64874	64889	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	53331028
64	NC_022136	ATTT	3	64948	64959	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53331028
65	NC_022136	GAAA	3	65154	65166	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	53331028
66	NC_022136	GAAA	3	65550	65560	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	53331028
67	NC_022136	TTGG	3	66159	66169	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	53331028
68	NC_022136	AGA	4	66532	66542	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331028
69	NC_022136	GTTG	4	67982	67996	15	0 %	50 %	50 %	0 %	6 %	53331035
70	NC_022136	TAT	4	68077	68088	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331035
71	NC_022136	CTGG	3	68598	68609	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	53331035
72	NC_022136	TTTC	3	69781	69791	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331035
73	NC_022136	GAA	4	70571	70582	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331035
74	NC_022136	GATC	3	73660	73670	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	53331035
75	NC_022136	A	13	74220	74232	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	53331035
76	NC_022136	ATAAA	3	75674	75688	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	53331035
77	NC_022136	CGAT	3	77797	77811	15	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	53331035
78	NC_022136	AGAA	3	78314	78325	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331035
79	NC_022136	AT	11	80100	80121	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331035
80	NC_022136	TTTC	3	80347	80357	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331035
81	NC_022136	CGA	4	80843	80854	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331035
82	NC_022136	TAAA	3	80987	80997	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53331035
83	NC_022136	CAAT	3	81894	81904	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	53331035
84	NC_022136	AATT	3	82528	82539	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331035
85	NC_022136	T	15	84932	84946	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	53331035
86	NC_022136	TAC	5	85522	85537	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	53331035
87	NC_022136	GAAA	3	87379	87390	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331035
88	NC_022136	GAA	4	89046	89056	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331035
89	NC_022136	AGA	5	89064	89077	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	53331035
90	NC_022136	GAG	5	89083	89097	15	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	6 %	53331035
91	NC_022136	CTT	4	89397	89407	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331035
92	NC_022136	TTTC	3	89550	89561	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	53331035
93	NC_022136	GAG	5	89709	89722	14	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	53331035
94	NC_022136	GATC	3	89938	89950	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	53331035
95	NC_022136	AAG	4	90077	90087	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331035
96	NC_022136	CCT	4	91937	91948	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331035
97	NC_022136	CTAT	3	99174	99185	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53331035
98	NC_022136	GAA	4	100211	100222	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331035
99	NC_022136	GAA	4	100309	100320	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331035
100	NC_022136	CTTT	3	100931	100942	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	53331035
101	NC_022136	TC	7	104053	104065	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	53331035
102	NC_022136	CGG	4	104144	104154	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	53331035
103	NC_022136	ATTG	3	104547	104557	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53331035
104	NC_022136	AATC	3	110081	110092	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	53331035
105	NC_022136	G	16	110305	110320	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	53331035
106	NC_022136	C	15	110366	110380	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	53331035
107	NC_022136	GAAA	3	110541	110552	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331035
108	NC_022136	ATT	4	110837	110848	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331035
109	NC_022136	AATAA	3	112794	112808	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	53331035
110	NC_022136	AAT	4	114216	114227	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331035
111	NC_022136	TAA	4	115840	115850	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331035
112	NC_022136	A	12	116092	116103	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	53331035
113	NC_022136	ATTC	3	117728	117740	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	53331035
114	NC_022136	TTAC	3	119441	119452	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53331035
115	NC_022136	AT	6	119476	119487	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331035
116	NC_022136	AAAT	3	123627	123638	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53331035
117	NC_022136	ATA	4	123960	123971	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331035
118	NC_022136	TCC	4	128157	128168	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331035
119	NC_022136	ATAG	3	129432	129447	16	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	53331035
120	NC_022136	TTA	4	129692	129702	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331035
121	NC_022136	TATT	3	129730	129740	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53331035
122	NC_022136	G	13	132331	132343	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	53331035
123	NC_022136	C	13	132392	132404	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	53331035
124	NC_022136	CAAT	3	138152	138162	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	53331035
125	NC_022136	AG	6	138645	138655	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	53331035
126	NC_022136	ATAG	3	143524	143535	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	53331035
127	NC_022136	AGG	4	150761	150772	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	53331028
128	NC_022136	GAGG	3	151259	151270	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	53331028
129	NC_022136	AGGT	3	151474	151485	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	53331028
130	NC_022136	CTT	4	152622	152632	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331028
131	NC_022136	GATC	3	152759	152771	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	53331028
132	NC_022136	CTC	5	152987	153000	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	53331028
133	NC_022136	GAAA	3	153148	153159	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	53331028
134	NC_022136	GAA	4	153301	153311	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	53331028
135	NC_022136	TCC	5	153613	153630	18	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	5 %	53331028
136	NC_022136	TCT	4	153637	153647	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331028
137	NC_022136	AAT	4	154919	154929	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331028
138	NC_022136	AGAA	3	155084	155094	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	53331028
139	NC_022136	TTTC	3	155319	155330	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	53331028
140	NC_022136	AGT	4	157171	157186	16	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lygodium japonicum chloroplast